Geri Dön

Flow sitometri yöntemi ile bakterilerin antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi

Determination of antibiotic sensitivity of bacteria by flow cytometry method

PDF İndir

  1. Tez No: 577341
  2. Yazar: HÜSEYİN HATİPOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET KÖROĞLU
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Flow sitometri, antimikrobiyal duyarlılık, MİK, EUCAST, Flow cytometri, antimicrobial suscecbility, MIC, EUCAST
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sakarya Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 117

Özet

Giriş ve Amaç: Bu çalışmasında gram pozitif ve gram negatif bakterilerin in vitro antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi amacıyla flow sitometri yöntemi kullanımı ve sonuç verme süresinin kısaltılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Altı standart suş ile 11 klinik izolat bu çalışmada incelenmiştir. Tüm suşların antibiyotik duyarlılıkları; VITEK 2 otomatize sistemi, sıvı mikrodilüsyon ve flow sitometrik yöntem ile test edilmiştir. Antibiyotik dilüsyonları güncel EUCAST kılavuzuna göre belirlenmiştir. Flow sitometrik analiz öncesi mikroplaktaki bakteri süspansiyonları, 120 rpm ve 35-37°C'de 2 saat inkübe edildikten sonra 100μl okuma tüplerine alınmıştır. Daha sonra her tüpe 10μl Syto 9 ve 10μl Propidium iodid boyası eklenerek karanlık ortamda 15 dk bekletilmiştir. Flow sitometrik analizde, üreme kontrol kuyucuğu ile antibiyotikli kuyucuklar FL1-H grafiğinde üstü üste getirilerek karşılaştırılmış ve antibiyotikli kuyucuklarda en az %55 oranında bakteri sayısında azalma duyarlılık kriteri olarak kabul edilmiştir. Bulgular: Flow sitometrik yöntemle belirlenen antibiyotik duyarlılık ile BMD ve VITEK 2 sistemi arasında saptanan uyum oranları sırasıyla; iki E. coli suşu için (%92.3, %84.6), dört K. pneumoniae suşu için (%88.7, %81.8), iki P. aeruginosa suşu için (%73, %73), iki A. baumannii complex suşu için (%81.8, %81.8), iki S. aureus suşu için (%86.1, %81.2), üç Enterococcus spp. suşu için (%81.8, %88.8) olarak saptanmıştır. Sonuç: Flow sitometrik yöntemle yapılan antibiyotik duyarlılık çalışmaları ile BMD ve VITEK 2 sistemi arasında yüksek düzeyde uyum saptanmıştır. Gram negatif bakterilerde gram pozitiflere göre flow sitometri ve diğer yöntemlerin uyumunun daha yüksek oranda olduğu tespit edilmiştir. Antibiyotik duyarlılık testlerinin sonuç verme süresini 12-14 saat kısaltmaktadır. Ancak henüz tüm laboratuvarlarda kullanılabilecek şekilde standardize edilememiştir. Antibiyotik duyarlılıklarının flow sitometri ile belirlenmesi konusunda daha detaylı ve kapsamlı çalışmalara ihtiyaç vardır.

Özet (Çeviri)

Introduction and Aim: The aim of this study was to determine the in vitro antibiotic susceptibility of gram-positive and gram-negative bacteria by using flow cytometry method and to shorten the delivery time. Material and Method: Six standard strains and 11 clinical isolates were examined in this study. Antibiotic susceptibility of all strains; was tested with VITEK 2 automated system, liquid microdilution and flow cytometric method. Antibiotic dilutions were determined according to the current EUCAST guidelines. Antibiotic dilutions were determined according to the current EUCAST guidelines. Prior to flow cytometric analysis, bacterial suspensions in the microplate were incubated at 120 rpm and 35-37 ° C for 2 hours. The suspension in each well was transferred to 100μl reading tubes. Then, 10 Syl Syto 9 and 10 Propl Propidium iodide dye were added to each tube and incubated for 15 minutes in dark. In flow cytometric analysis, growth control wells and antibiotic wells were compared by overlay on the FL1-H graph and a growth control wells in bacterial count of at least 55% in antibiotic wells was accepted as the sensitivity criterion. Results: Antibiotic susceptibility determined by flow cytometric method with BMD and VITEK 2 system were found to be as follows; two E. coli strains (92.3%, 84.6%), four K. pneumoniae strains (88.7%, 81.8%), two P. aeruginosa strains (73%, 73%), two A. baumannii complex strains (81.8%, 81.8%), two S. aureus strains (86.1%, 81.2%), three Enterococcus spp. strain (81.8%, 88.8%). Conclusion Antibiotic susceptibility studies with flow cytometric method showed a high level of agreement between BMD and VITEK 2 system. In gram negative bacteria, flow cytometry and other methods were found to be more compatible than gram positives. Antibiotic susceptibility tests shorten the delivery time of 12-14 hours. However, it has not yet been standardized to be used in all laboratories. More detailed and comprehensive studies are needed to determine antibiotic susceptibility by flow stiometry.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    533175

    Bacteroides türlerinde antimikrobiyal duyarlılığın akım sitometri yöntemi ile hızlı tespiti

    Rapid detection of the antimicrobial susceptibility of bacteroides SPPP. BY flow cytometry

    SİNEM KAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ORHAN BEDİR

  2. Tez No

    603830

    Micrococcus luteus Metabolitlerinin Helicobacter pylori'nin Kokoid Formu Üzerindeki Etkisinin İncelenmesi

    Investigation of the Effect of Micrococcus luteus Metabolities on Helicobacter pylori Cocoid Form

    DİDEM AKTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MELAHAT BAĞIROVA

  3. Tez No

    651250

    Probiyotik özellik gösteren bazı laktik asit bakterileri ve mayaların tümör baskılayıcı etkilerinin araştırılması

    Investigation of the tumor supressive effect of some probiotic lactic acid bacteria and yeasts

    MÜNEVVER KAHRAMAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYNUR GÜL KARAHAN

    PROF. DR. MUSTAFA ENDER TERZİOĞLU

  4. Tez No

    247531

    Kistik fibrozlu çocuklarda sistemik antibiyotik, lökotrien reseptör antagonisti ve makrolid grubu antibiyotiklerin enflamatuvar yanıta etkisi

    The effect of systemic antibiotics, leukotrien receptor antagonist and macrolids on inflamatory response in cystic fibrosis patients.

    NİHAN UYGUR KÜLCÜ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YILDIZ CAMCIOĞLU

  5. Tez No

    735865

    Kolistin ve karbapenem dirençli acinetobacter baumannii ve klebsiella pneumoniae suşlarında akım sitometri yöntemi ile kolistin ve meropenem kombinasyonunun in vitro etkinliğinin test edilmesi ve dama tahtası yöntemi ile karşılaştırılması

    Testing the in vitro efficacy of colistin and meropenem combination with flow cytometry method in colistin and carbapenem resistant acinetobacter baumannii and klebsiella pneumoniae strains and comparison with checkerboard method

    ÖZLEM IŞIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiBursa Uludağ Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CÜNEYT ÖZAKIN

Geri Dön