Geri Dön

Design of effective carbonic anhydrase inhibitors by using in silico pharmacophore analysis

İn siliko ortamda etkin karbonik anhidraz inhibitörlerinin farmakofor analizi tekniği ile tasarlanması

  1. Tez No: 579396
  2. Yazar: NUR GÜREL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TUĞBA TAŞKIN TOK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoenformatik ve Bilişimsel Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 35

Özet

Farmakofor modelleme, bilgisayar destekli ilaç tasarımında başarılı ancak çok çeşitli bir alt alandır. Farmakofor kavramı, yeni ilaçların rasyonel tasarımına yaygın olarak uygulanmıştır. Bu yazıda, bu kavramın hesaplamalı uygulanmasını ve ilaç keşif sürecinde ortak kullanımını gözden geçirdik. Karbonik anhidrazlar (CA), on altı farklı izoformu içeren, çinko içeren metaloenzimlerdir. Bu enzimler subselüler lokalizasyonları, katalitik aktiviteleri ve farklı inhibitör sınıflarına duyarlılıkları bakımından farklılık gösterir. Önceki çalışmalar, hCA-I ve hCA -II seviyelerinin, mide, prostat, akciğer ve yumurtalık tümörlerinde daha yüksek sitozolik eritrosit seviyeleri gibi bazı kanser türlerinde daha yüksek olduğunu; ayrıca lösemi gibi hematolojik hastalıklarda. Ek olarak, hCA-II, bazı kanser dokularında, melanom, özofagus, böbrek kanserleri de dahil olmak üzere bazı kanser dokularındaki endotelyumda ifade edilerek ön plana çıkmıştır. Bu nedenle, çoklu hedefe karşı güvenilir ve potansiyel karbonik anhidraz inhibitörlerinin araştırılması ve tasarlanması; hCA-I ve hCA-II, kanser tedavisi için ekibimizdeki biyolojik verileri kullanarak amacımız olmuştur.

Özet (Çeviri)

Pharmacophore modeling is a successful yet very diverse subfield of computer-aided drug design. The concept of the pharmacophore has been widely applied to the rational design of novel drugs. In this paper, we review the computational implementation of this concept and its common usage in the drug discovery process. Carbonic anhydrases (CAs) are zinc containing metalloenzymes including sixteen different isoforms. These enzymes differ in their subcellular localization, catalytic activity and susceptibility to different classes of inhibitors. The previous studies have also indicated that the CA I and II levels were also higher in several cancer types, such as higher cytosolic erythrocte levels in stomach, prostate, lung and ovary tumors; also in hematological diseases such as leukemia. In addition, CA II has come to the forefront by being expressed in the endothelium of neovessels in some cancer tissues, including melanoma, esophageal, renal cancers. Therefore, it is aimed to investigate and design reliable and potential carbonic anhydrase inhibitors against to multi target; CA I and II by using biological data from our team for treatment of cancer.

Benzer Tezler

  1. Pirazol-benzensülfonamit türevi bileşiklerin tasarımı, sentezi, kimyasal yapılarının aydınlatılması ve biyoaktiviteleri

    Design, synthesis, elucidation of chemical structures and bioactivities of pyrazole-benzensulfonamide derivatives

    CEM YAMALI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Eczacılık ve FarmakolojiAtatürk Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALİSE İNCİ GÜL

  2. Yeni karbonik anhidraz inhibitörlerinin tasarımı, sentezi ve biyolojik aktivite çalışmaları

    Design, synthesis and biological activity studies of new carbonic anhydrase inhibitors

    DELAL ERZURUM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZAFER ASIM KAPLANCIKLI

  3. Yeni sentezlenmiş 1,2,4-triazol-5-on türevlerinin sığır serum karbonik anhidraz aktivitesi üzerine etkisinin in vitro ve in siliko yöntemlerle incelenmesi

    Investigation of the effect of newly synthesized 1,2,4-triazol-5-on derivatives on bovine serum carbonic anhydrase activity by in vitro and in silico methods

    HASAN AYALOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyokimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ÇOLAK

  4. Tiyofen bazlı imin ve fosfoazometin bileşiklerinin sentezi, karakterizasyonu ve bazı biyoaktif özelliklerinin araştırılması

    Synthesis, characterization and investigation of bioactive properties of thiophene based imine and phosphoazometine compound

    KÜBRA ÖZTÜRK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyomühendislikFırat Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHAMMET ŞABAN TANYILDIZI

  5. Nitril fonksiyonellenmiş N-heterosiklik karben öncülleri ve karben kompleksleri sentezi: Enzim inhibisyon, antikanser aktivite ve DNA bağlanma özellikleri

    Nitrile functionalized N-heterocyclic carbene precursors and carbene complex synthesis: Enzyme inhibition, anti-cancer activity and dna binding properties

    ERKAN ÖNER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyokimyaMersin Üniversitesi

    Eczacılık Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERAP YALIN

    PROF. DR. YETKİN GÖK