Behçet hastalığı-genom analiz çalışmasında belirlenen IL23r-IL12RB2 bölgesindeki varyantın (RS924080), IL23R ve IL12rb2 genlerinin ekspresyonları ile ilişkisinin araştırılması.
Analyzing the relation between the variation (RS924080) of IL23R-IL12RB2 region and the expressions of IL23R and IL12RB2 genes identified in a Behçet's Disease-GWAS study.
- Tez No: 585088
- Danışmanlar: PROF. DR. BURÇAK VURAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
Behçet hastalığı (BH), etiyolojisi bilinmeyen, tekrarlayan inflamatuar ataklar ile seyreden, artmış sitokin cevabına neden olan inflamatuar bir hastalıktır. 2010 yılında Remmers ve arkadaşlarının Türk toplumundaki Behçet hastalarında yürüttüğü GWAS çalışmasının sonuçlarına göre; IL23R-IL12RB2 lokusunda rs924080 SNP'leri BH ile ilişkili varyantlar olarak tespit edilmiştir (P
Özet (Çeviri)
Behçet's disease (BD) is an inflammatory disorder of unknown etiology characterized with recurrent inflammatory attacks and increased production of proinflammatory cytokines. A genome-wide association study (GWAS) identified an association between a polymorphism in the IL23R-IL12RB2 locus (rs924080) and Turkish BD patients by Remmers et al in 2010 (P < 0.0001), which was confirmed by Xavier et all in 2012. To delineate whether this particular polymorphism is associated with enhanced proinflammatory responses, IL-12 receptor β2 subunit (IL-12RB2), IL-23 receptor (IL-23R) expression and proinflammatory cytokine production were investigated in healthy individuals homozygous (AA) (n=4) or heterozygous for the risk A allele (AG) (n=6) or homozygous for the common G allele (GG) (n=4). Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were isolated and total RNA from PBMC was obtained and reverse-transcribed into cDNA. IL-12RB2 and IL-23R expression was assessed by real-time quantitative RT–PCR. Data analysis was performed using the Ct method, mRNA expression levels were compared by non-parametric Kruskal-Wallis test. IL-12RB2 and IL-23R expression levels and IL-12RB2 stimulation indices were comparable among different genotype groups. By contrast, IL-23R stimulation indices of AA and AG groups were significantly higher than the GG group (p=0.042). The AA genotype group's average stimulation index for IL-23R was greater than those of AG and GG groups. These results suggest that the rs924080 risk A allele does not affect the baseline expression levels of IL-12RB2, IL-23R, IFN- and TNF- but enhances the IL-23R and TNF- expression capacity in response to LPS stimulation. But also appears to enhance baseline IL-6 production. Based on the LPS stimulation results, it is tempting to speculate that individuals with the rs924080 A allele give exaggerated inflammatory responses to bacterial pathogens ultimately leading to BD development.
Benzer Tezler
- Kompleksin 1 ve Behçet Hastalığı patogenezindeki olası rolünün araştırılması
Complexin-1 and investigation of its possible role in the Pathogenesis of Behçet's Disease
ARİS ÇAKİRİS
- Anadolu'daki nadir otoinflamatuvar hastalıklar ile ilişkili mutasyonlar için alel yaşının hesaplanması
Computing allele ages for mutations associated with rare autoinflammatory diseases in anatolia
DAMLA KARADAVUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolHacettepe ÜniversitesiBiyoinformatik Ana Bilim Dalı (Disiplinlerarası)
DR. ÖĞR. ÜYESİ İDİL YET
- Genetic and epigenetic analyses of hla-b5 gene in familial behçet syndrome pedigrees
Ailesel behçet sendromu ailelerinde hla-b5 geninin genetik ve epigenetik analizleri
PELİNSU KÖPRÜLÜ
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EDA TAHİR TURANLI
- Differential expression of proteins in active and inactive phases of Behçet's syndrome
Behçet sendromunun aktif ve inaktif fazlarında farklı protein ekspresyonları
KIYMET ASLI KİREÇTEPE AYDIN
Doktora
İngilizce
2019
Moleküler Tıpİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI
- Machine learning methods for detecting genetic and infectious diseases
Genetik ve enfeksiyon hastalıklarının tespiti için makine öğrenmesi yöntemleri
YUNUS EMRE IŞIK
Doktora
İngilizce
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolAbdullah Gül ÜniversitesiElektrik ve Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZAFER AYDIN