Fermente sucuktan izole edilen enterococcus suşlarındanantibiyotik direnç genlerinin pzr ile araştırılması
Research of antibiotic resistance genes in enterococcus strainsisolated from traditional fermented sausage
- Tez No: 607998
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BANU ÖZDEN TUNCER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Enterococcus faecium ve Enterococcus faecalis bazı gıdalarda organaleptik özellikleri iyileştirmektedir. Bunun yanında bu suşlar lipolitik ve esterolitik aktivite, sitrattan yararlanma ile uçucu aromatik bileşikleri sentezleme gibi özellikleri ile fermente et ürünlerinin olgunlaştırılması sırasında diğer laktik asit bakterileri ile birlikte starter kültür olarak da kullanılır. Günümüzde bazı araştırmacılar Enterococcus cinsi bakterileri hala GRAS (Generally Recognised As Safe) olarak kabul etmemektedir. Enterokokların pek çoğu probiyotik olarak kullanılabilecek kadar zararsız bakteriler olmakla birlikte bazıları ciddi hastalıklara neden olabilmektedir. Özellikle Enterococcus faecium ve Enterococcus faecalis gibi türlerin, insanlarda bazı önemli enfeksiyonlara yol açtıkları ve antibiyotik dirençlilik gibi çeşitli patojenite özellikleri içerdikleri bilinmektedir. Antibiyotiğe dirençli bu suşların gıda yoluyla insan bağırsak florasında bulunan diğer bakterilerin antibiyotik direnci kazanmasına yol açabileceği düşünülmektedir. Bu yüksek lisans tez çalışmasında, doğal fermente sucuk örneklerinden izole edilmiş 25 adet Enterococcus suşunun (24 adet E. faecium ve 1 adet E. feacelis) temini sağlanarak polimeraz zincir reaksiyon (PZR) tekniği ile antibiyotik direnç genlerinin varlığı araştırılmıştır. Öncelikle Enterococcus suşlarının genomik DNA'ları izole edilmiştir. Genomik DNA'larının varlığı % 1,5 agaroz jel elektroforezinde saptanmıştır. Enterococcus suşlarında eritromisin (ermA, ermB, ermC), tetrasiklin (tetM, tetL), siprofloksasin (gyrA), streptomisin (strA, strB, aadA, aadE), vankomisin (vanA, vanB), gentamisin [(aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV)], antibiyotik direnç genlerinin varlığı spesifik primerler kullanılarak PZR çalışmaları ile araştırılmıştır. PZR analizi sonucunda ermA, ermB, ermC, tetM, tetL, gyrA, strA, strB, aadA, aadE, vanA, vanB, aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV genlerinin tüm izolatlarda varlığı saptanamamıştır.
Özet (Çeviri)
Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis improve organoleptic properties in some foods. In addition, these strains used as a starter culture along with other lactic acid bacteria during fermentation of the fermented meat products due to their some properties such as the use of citrat and the synthesis of volatile aromatic compounds, lipolytic and esterolytic activity. Nowadays, some researchers do not accept Enterococcus as GRAS (Generally Recognized As Safe). Some of them can cause serious illnesses, with many being harmless bacteria that can be used as probiotics. It is known that especially species such as Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis to cause some important infections in humans. These antibiotic resistant strains are thought to lead to antibiotic resistance by other bacteria found in the human intestinal flora via food. In this master thesis study, 25 Enterococcus strains (24 E. faecium and 1 E. feacelis) isolated from natural fermented sausage samples by means of the polymerase chain reaction (PCR) technique developed the presence of antibiotic resistance genes has been investigated. Primarly, genomic DNAs of Enterococcus strains were isolated. The presence of genomic DNAs was determined by 1.5% agarose gel electrophoresis. In Enterococcus strains, Erythromycin (ermA, ermB, ermC), tetracycline (tetM, tetL), ciprofloxacin (gyrA), streptomycin (strA, strB, aadA, aadE), vancomycin (vanA, vanB), gentamycin [(aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV] antibiotic resistance genes were investigated by PCR studies using specific primers. As a result of PCR analysis, ermA, ermB, ermC, tetM, tetL, gyrA, strA, strB, aadA, aadE, vanA, vanB, aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV genes could not be detected in all isolates.
Benzer Tezler
- Fermente sucuktan izole edilen laktik asit bakterilerinin antibiyotik dirençlilikleri ve biyojen amin üretimlerinin belirlenmesi
Determination of antibiotic resistance and production of biogenic amines in lactic acid bacteria isolated from fermented Turkish sausage (sucuk)
ÖZGE YÜCEER
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BANU ÖZDEN TUNCER
- Fermente sucuktan izole edilen antilisterial Enterococcus mundtii yb6.30 tarafından üretilen bakteriyosinin karakterizasyonu
Characterization of bacteriocin produced by antilisterial Enterococcus mundtii yb6.30 isolated from fermented sucuk
TUBA ALTINKAYNAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YASİN TUNCER
- Fermente sucuktan izole edilen enterosin üreticisi Enterococcus mundtii YB6.30 suşunun teknolojik özellikleri ve güvenlik değerlendirmesi
Technological properties and safety aspects of enterocin producer Enterococcus mundtii YB6.30 strain isolated from fermented sucuk
MELİKE KASAP
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YASİN TUNCER
- Farklı kültür besiyeri, başlangıç pH'sı ve inkübasyon sıcaklığının enterococcus mundtıı YB6.30'un gelişimi ve bakteriyosin üretimi üzerine etkisi
The effect of different culture media, initial pH and incubation temperature on the development and bacteriosin production of enteroccus mundtii YB6.30
SELMA KÜÇÜKÇİFTCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YASİN TUNCER
- Sucuktan enterokokların izolasyonu ve antibiyotik duyarlılık profillerinin belirlenmesi
Isolation of enterococci from traditional fermented Turkish sausage (sucuk) and determination of their antibiotic susceptibility patterns
FURKAN DEMİRGÜL
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASİN TUNCER