Mikrobiyal biyotransformasyon ile 4,5,6,7-tetrahidro-6-fenil-4-oksobenzofuranon türevlerinin sentezi
Synthesis of 4,5,6,7-tetrahydro-6-phenyl-4-oxobenzofuranone derivatives by microbial biotransformation
- Tez No: 608256
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ZERRİN ZERENLER ÇALIŞKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilim ve Teknoloji, Science and Technology
- Anahtar Kelimeler: GhFDH, mikrobiyal biyotransformasyon, benzofuranon, GhFDH, microbial biotransformation, benzofuranone
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 106
Özet
Mikrobiyal Biyotransformasyon İle 4,5,6,7-Tetrahidro-6-Fenil-4-Oksobenzofuranon Türevlerinin Sentezi Kübra AVCI Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı Yüksek Lisans Tezi Danışman: Doç.Dr. Zerrin ZERENLER ÇALIŞKAN Son yıllarda enantiosaf bileşiklerin üretimi ilaç endüstrisinde önemli bir çalışma alanı haline gelmiştir. Mikrobiyal biyotransformasyon da enantiyosaf bileşik eldesinde önemli bir metot olduğundan büyük önem arz etmektedir. Bu çalışmada benzofuranon türevi maddelerin mikrobiyal biyotransformasyon yolu ile enantiosaf benzofuranon türevlerine dönüştürülmesi hedeflenmiştir. Mikrobiyal biyotransformasyon basamağında Gossypium hirsutum format dehidrogenaz (GhFDH) enzimini üreten rekombinant Escherichia coli (E.coli) suşu ve E.coli DH5α suşu kullanılmıştır. Çalışmada kullanılan benzofuranon türevi maddeler 5-fenil-1,3-siklohekzadion bileşiğinden sentezlenmiştir. Bunun için öncelikle 5-fenil-1,3-siklohekzadion başlangıç maddesinden 6,7-Dihidro-6-fenilbenzofuran-4-(5H) bileşiği sentezlenmiş, ardından 6,7-Dihidro-6-fenilbenzofuran-4-(5H) başlangıç maddesinden 4,5,6,7-tetrahidro-6- fenil-4-oksobenzofuran-5-il asetat bileşiğinin sentezi gerçekleştirilmiştir. Mikrobiyal biyotransformasyon çalışmaları“Terrific Broth”besiyeri ortamında rekombinant GhFDH enzimi üreten E.coli DH5α suşu ile yapılmış ve biyotransformasyon deneyi sonucuna göre protein ekspresyonu indüksiyonundan 24 saat sonra eklenen 4,5,6,7-tetrahidro-6- fenil-4-oksobenzofuran-5-il asetat maddesinin reaksiyon başladıktan 50 dk ve 150 dk sonra biyotransformasyonun gerçekleştiği belirlenmiştir. GhFDH genini taşımayan ekspresyon vektörünü içeren kontrol setinde4,5,6,7-tetrahidro-6- fenil-4-oksobenzofuran-5-il asetat maddesinin dönüşümünün izlenmemesi, madde biyotransformasyonunun rekombinant GhFDH enzimini üreten bakteri tarafından katalizlendiğini ispatlamıştır. Ayrıca SDS-PAGE analizi sonucunda, eklenen maddenin, reaksiyonun sonlandırıldığı 7.ve 9.saat dahil olmak üzere, FDH ekspresyonunu baskılamadığı tespit edilmiştir. Gelecek çalışmalarda yüksek miktar ve saflıkta üretilen biyotransformasyon ürününün yapı tayininin yapılarak, ilaç öncü maddesi olarak kullanılabilme potansiyelinin araştırılması hedeflenmektedir.
Özet (Çeviri)
Synthesis of 4,5,6,7-Tetrahydro-6-Phenyl-4-Oxobenzofuranone Derivatives by Microbial Biotransformation Kübra AVCI Department of Molecular Biology and Genetics Master of Science Thesis Advisor: Assoc.Prof. Zerrin ZERENLER ÇALIŞKAN In recent years, the production of enantiopure compounds has become an important field of study in the pharmaceutical industry. Furthermore, microbial biotransformation is also important due to is an important method in obtaining enantiopure compounds. In this study, it was aimed to convert the benzofuranone derived substances to enantiopure benzofuranone derivatives by microbial biotransformation. Recombinant Escherichia coli(E.coli) strains producing Gossypium hirsutum formate dehydrogenase (GhFDH) and E.coli DH5α strains were used in the microbial biotransformation step. The benzofuranone derivatives used in the study were synthesized from 5-phenyl-1,3 cyclohexadione. For this purpose, 6,7-dihydro-6 phenylbenzofuran-4- (5H) was synthesized from 5 phenyl-1,3-cyclohexadione starting material. Subsequently, synthesis of 4,5,6,7-tetrahydro-6-phenyl-4-oxobenzofuran-5-yl acetate compound from the starting material 6,7-Dihydro-6 phenylbenzofuran-4- (5H) was carried out. The microbial biotransformation step was performed with E.coli DH5α strain producing recombinant GhFDH enzyme in the medium of“Terrific Broth”and according to the results of the biotransformation test, it was determined that 4,5,6,7-tetrahydro-6-phenyl-4-oxobenzofuran-5-yl acetate added 24 hours after the induction of protein expression had biotransformation 50 and 150 minutes after the reaction started. The lack of monitoring of the conversion of 4,5,6,7-tetrahydro-6-phenyl-4-oxobenzofuran-5-yl acetate in the control set containing the expression vector that does not carry the GhFDH gene proved that the biotransformation of the substance was catalyzed by the bacteria that produced the recombinant GhFDH enzyme.Moreover, the result of SDS-PAGE analysis showed that the added substance does not terminate the reaction including the 7th and 9th hours and does not suppress FDH expression. In future studies, it is aimed to determine the structure of biotransformation products produced in high quantity and purity and to investigate its potential to be used as a drug precursor.
Benzer Tezler
- Benzofuranon ve indol türevlerinin biyokatalitik rezolüsyonu
Biocatalytic Resolutions of Benzofuranone and Indole Derivatives
EDA SOYDAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyoteknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ZERRİN ÇALIŞKAN
- P-sinefrin alkaloitinin mikrobiyal biyotransformasyonu ile oluşan yeni metabolitlerin analitik yöntemlerle tayini, izolasyonu, antidiyabetik ve antimikrobiyal aktivitelerinin belirlenmesi
The microbial biotransformation of P-synephrine and isolation of its metabolites by using analytical methods with their antidiabetic and antimicrobial activities
ŞÜKRAN DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiFarmakognozi ve Doğal Ürünler Kimyası Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IŞIL GAZİOĞLU
- Matrıcarıa recutıta L.'nın uçucu yağı ve bileşenlerinin mikrobiyal transformasyonu
Microbial transformation of matricaria recutita L. essential oil and its components
ZEYNEP FIRAT
Doktora
Türkçe
2023
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH DEMİRCİ
- Testosteron bileşiğinin aspergıllus glaucus küfü ile blyotramsformasyonu
Biotransformation of testosterone by aspergillus glaucus
ALI ABDULHUSSEIN ALI ALI
- Biotransformation of dehydroepiandrosterone by Penicillium olsonii
Dehidroepiandrosteronun Penicillium olsonii ı̇le bı̇yotransformasyonu
MENA ALBAYATY
