Geri Dön

PMA/kantitatif real-time PCR kullanarak biyosidal ürünlerin mikobakterisidal etkinliğinin saptanmasında hızlı bir yöntem

A rapid method for determination of mycobactericidal effects of biocidal products using PMA / quantitative real-time PCR method

PDF İndir

  1. Tez No: 610891
  2. Yazar: ECE HALAT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÜVEN ÖZDEMİR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 133

Özet

Bu tez çalışmasında dezenfektanların mikobakterisidal etkinliklerinin tespit edilmesi için klasik kültürel yöntemlere dayanan, test süresi 1 aydan uzun zaman alan EN metotlarına (European Standards) alternatif olacak, bu metotlarda ortaya çıkan zaman kayıplarını, kontaminasyon riski ve diğer zorlukları ortadan kaldıracak hızlı ve güvenilir bir metodun geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bu çalışmada, dezenfektanların mikobakterisidal etkinliklerinin belirlenmesinde kullanılan klasik kültürel yöntemlerin yerine hızlı ve güvenilir bir moleküler metot olan PMA/Real time PCR metodunun geliştirilmesi amacıyla 6 farklı dezenfektan aktif maddesinin M.terrae ve M.avium bakterileri üzerine etkinlikleri test edilmiştir. Mikobakterilerden DNA izolasyonunda farklı kit prosedürleri ve manuel prosedür kullanılmış ve High Pure PCR Template Preparation kitiyle (Roche) uygulanan prosedürün uygulanan diğer prosedürlere göre daha yüksek geri kazanıma, tekrarlanabilirliğe ve saflığa sahip olduğu ve her tespit edilmiştir. Isıl işlemle yapılan PMA optimizasyon çalışmalarında 6 Ct'lik fark sağlanmış olup, sıcaklığın Mycobacterium türlerinin membran yapısının bütünlüğünü bozmada, kimyasal ajanlar kadar etkili olmadığı gözlenmiştir. Kültürel metot ve moleküler metot ile yapılan paralel çalışmalarda en uyumlu sonuçlar ise izopropil alkol ve ortofitalaldehit etken maddeleri ile alınmış olup, PHMB(polihekzametilen biguanid), glutaraldehit, aktif klor ve perasetik asitte her iki organizma için de anlamlı sonuçlar elde edilememiştir.

Özet (Çeviri)

In this thesis study, it was aimed to develop a rapid and reliable method for determining the mycobactericidal efficacy of disinfectants, which will be an alternative to EN methods (European Standards) based on classical cultural methods and exceeds 1 month period. In this study, the effectiveness of 6 different disinfectant active agents on M.terrae and M.avium bacteria were tested in order to develop a fast and reliable molecular method instead of classical methods used to determine mycobactericidal efficacy of disinfectants. Different kit and manual procedures were used to isolate DNA from mycobacteria, and it was determined that the procedure with High Pure PCR Template Preparation Kit (Roche) had higher recovery, reproducibility and purity than other procedures. PMA optimization studies performed by heat treatment showed a difference of 6 Ct and it was observed that the high temperatures were not as effective as chemical agents in disrupting the integrity of the membrane structure of Mycobacterium species. In parallel studies with cultural method and molecular method, the most compatible results were obtained with isopropyl alcohol and orthophitalaldehyde active substances and no significant results were obtained for both organisms with PHMB (polyhexamethylene biguanide), glutaraldehyde, active chlorine and peracetic acid.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    384800

    Analysis of MEFV gene alternatively spliced transcripts expression patterns in cell culture models

    Hücre kültürü modellerinde MEFV geni alternatif kırpılmış transkriptlerinin ekspresyon modellerinin analizi

    İREM ABACI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EDA TAHİR TURANLI

  2. Tez No

    285683

    Selective quantification of viable Escherichia coli cells in biosolids upon propidium monoazide treatment by quantitative PCR

    Biyokatılardaki canlı Escherichia coli miktarının propidyum monoazid işlemi ile kantitatif polimeraz zincir reaksiyon (Q-PCR) yöntemi kullanılarak belirlenmesi

    BİLGİN TAŞKIN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Bölümü

    DOÇ. DR. AYŞE GÜL GÖZEN

    DOÇ. DR. METİN DURAN

  3. Tez No

    443805

    U-937 ve THP-1 hücrelerinin diferansiyasyonu ve polarizasyonunda SIK genlerinin rolü

    Role of SIK genes in differentiation and polarization of U-937 and THP-1 cells

    YASEMİN SEZİKLİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyokimyaOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ALİ OKUYUCU

  4. Tez No

    432326

    Isıl işlem görmüş bazı gıdalarda Escherichia coli O157:H7 ve Salmonella Typhimurium'un kantitatif tespitinde kültürel yöntem, real-time PCR ve PMA-real time PCR yöntemlerinin karşılaştırılması

    Comparison of cultural method, real-time PCR and PMA-real time PCR methods for quantitative determination of Escherichia coli O157:H7 and Salmonella Typhimurium in heat treated some foods

    HAKİYE ASLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Gıda MühendisliğiErciyes Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZÜLAL KESMEN

  5. Tez No

    646408

    Tip 1 diyabetlilerde IL-22 ve IL-9 immün cevabının değerlendirilmesi

    Evaluation of immune response of IL-22 and IL-9 in patients with TYPE 1 diabetes mellitus

    ÇAĞDAŞ UĞUR ADAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ OSMAN GÜROL

Geri Dön