Samsun, Kızılırmak deltası'nda manda ve arakonaklarda paramphistomid türlerin yayılışı ve moleküler teşhisi
Prevalence and molecular diagnosis of paramphistomid species in water buffaloes and their intermediate hosts in the Kizilirmak delta, Samsun
- Tez No: 618048
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞİNASİ UMUR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Parazitoloji, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: Calicophoron daubneyi, Galba truncatula, Manda, Paramphistomum cervi, Samsun, Türkiye, Calicophoron daubneyi, Galba truncatula, Paramphistomum cervi, Samsun, Turkey, Water buffalo
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Parazitoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 156
Özet
Amaç: Bu proje, Kızılırmak Deltası'nda otlatılan mandalarda paramphistomosise neden olan türler ve arakonaklarını saptamak amacıyla yapılmıştır. Materyal ve Metot: Ağustos 2016 - Temmuz 2018 tarihleri arasında haftada bir kez Atakum ve Bafra ilçe mezbahalarına gidilerek kesilen 139 manda incelenmiştir. Aynı tarihlerde ilkbahar ve sonbahar mevsiminde ayda bir kez, hayvanların otladığı meralara gidilerek 550 sümüklü örneği toplanmıştır. Laboratuvarda ergin parazitler, morfolojik, histolojik ve moleküler, larva dönemleri moleküler yöntemlerle teşhis edilmiştir. Histolojik tanı için 10 µm kalınlıkta kesitler alınmış ve hematoksilen eozin ile boyanmıştır. Moleküler teşhis için erginler ve arakonaklardan elde edilen larval formların ITS-2+ ve Cox-1 gen bölgeleri PCR ile çoğaltılmıştır. ITS2+ rDNA gen bölgesinin çoğaltılması ile elde edilen PCR ürünlerine dört endonükleaz enzimi MseI, HaeIII, RsaI, Bsh1236I kullanılarak PCR-RFLP uygulanmıştır. Bulgular: İncelenen 139 mandanın 45'i (%32,37) paramphistomid türlerle enfekte bulunmuş, 45 hayvandan 4754 parazit toplanmıştır. Hayvan başına parazit sayısı 2-1884 (ort. 105.6) arasında değişmiştir. İncelenen 300 G. truncatula örneğinin 19'unda larval formlar tespit edilmiştir. Çalışmada 45 ergin örneğin tamamında ve arakonaklardan elde edilen 19 gelişme aşamasından 12'sinde (%4) C. daubneyi moleküler olarak tespit edilmiştir. Histolojik kesitlerle enfekte hayvanların tümünde C. daubneyi ve üç hayvanda P. cervi saptanmıştır. Son konaklardaki ergin parazitler (MH939278) ve arakonaklarda bulunan larval formlara ait DNA dizilimleri (MH939279) GenBank'a kayıt edilmiştir. Sonuç: Ülkemizde ilk kez C. daubneyi moleküler olarak teşhis edilmiş ve arakonağı G.truncatula olarak belirlenmiştir. Kızılırmak Deltası'ndaki mandalarda baskın tür olarak C. daubneyi belirlenmiş, ancak miks enfeksiyon şeklinde olmak üzere, üç hayvanda P. cervi'ye rastlanmıştır.
Özet (Çeviri)
Aim: This project was carried out to determine amphistomid species parasitized in water buffalo (WB) grazing in the Kızılırmak Delta and their intermediate host. Material and Method: Between August 2016 and July 2018 abattoirs in Bafra and Atakum districts were visited once a week and 139 slaughtered WBs were examined. During the same period, in the spring and autumn once a month 550 snail samples were collected from pastures grazing WBs. Adult parasites were identified using histological and molecular methods and larval stages were only identified with molecular method in the laboratory. For histological diagnosis, mature parasites were cut as 10 µm thicknes and stained with hematoxylin eosin. The ITS-2 + and Cox-1 gene regions of adults and larval forms obtained from intermediate hosts were amplified using PCR. PCR-RFLP analysis were applied to PCR products obtained from amplification using four endonuclease enzymes; MseI, HaeIII, RsaI, Bsh1236I. Results: 45 out of 139 WBs (32.4%) were infected with Paramphistomid species and 4761 parasites were collected from 45 infected animals. The number of parasites per animal ranged from 2-1884 (mean. 105.8). Larval forms were found in 19 of 300 G.truncatula samples. In this study, C.daubneyi was determined molecularly in all 45 adult specimens and in 12 of 19 developmental stages (4%) obtained from intermediate hosts. Using histological section method C.daubneyi was determined in all infected animals and P.cervi in only 3 animals. DNA sequences of adult parasites in the definitive hosts (MH939278) and larval forms found in intermediate hosts (MH939279) were recorded in GenBank. Conclusion: For the first time C.daubneyi was identified molecularly and its intermediate host was determined as G.truncatula in our country. C.daubneyi was identified as the dominant species in buffaloes in Kızılırmak Delta, in addition P.cervi was found in three animals as mixed infection.
Benzer Tezler
- Kızılırmak deltasında yetiştirilen Anadolu mandalarının PRL, CSN3 ve PIT-1 genleri bakımından genotiplerinin PCR-RFLP yöntemi ile belirlenmesi
Genotyping of PRL, CSN3 and PIT-1 genes in Anatolian water buffalos reared in Kizilirmak delta by PCR-RFLP
EMİNE TOPARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. LEVENT MERCAN
- Sylvia scopoli, 1769 (Aves: Passeriformes) türlerinin Samsun Kızılırmak Deltası'ndaki ilkbahar ve sonbahar göç dinamikleri ve konaklama stratejilerinin araştırılması
Research on migration dynamics and stopover strategies of the species of the Genus sylvia Scopoli, 1769 (Aves: Passeriformes) during spring and autumn in the Kızılırmak delta, Samsun
ARİF CEMAL ÖZSEMİR
Doktora
Türkçe
2018
ZoolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK KEFELİOĞLU
PROF. DR. YAKUP SANCAR BARIŞ
- Kızılırmak Deltası'nda Sazhorozu (Porphyrio porphyrio, Linnaeus,1758)populasyonunun saptanması
DEtermination of population Purple gallinule(Porphyrio porphyrio, Linnaeus,1758) in kızılırmak Delta
GÖKCEN DEMİRBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. YAKUP SANCAR BARIŞ
- Kızılırmak deltası'nda tarım arazileri ve su yüzeylerinin zamansal değişiminin google earth engine ile irdelenmesi
Examining the temporal changes of agricultural lands and water surfaces of the Kızılırmak delta with google earth engine
ŞEYDANUR DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Jeodezi ve FotogrametriOndokuz Mayıs ÜniversitesiHarita Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AZİZ ŞİŞMAN
- Kızılırmak Deltası'ndaki habitat çeşitliliğinin kuş, sürüngen ve amfibi türlerinin dağılımına etkisi
The effect of habitat diversity on the distribution of bird, reptile and amphibian species in the Kızılırmak Delta
NİZAMETTİN YAVUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEMAL VAROL TOK