Geri Dön

Karbapenem dirençli acinetobacter SPP. kökenlerinde direnç genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle araştırılması

Investigation of resistance genes in carbapenem resistant acinetobacter SPP. strains by polymerase chain reaction

PDF İndir

  1. Tez No: 621118
  2. Yazar: AYDAN AYDIN HİZEL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. METE EYİGÖR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Acinetobacter, Elektroforez-agar jel, Genler, Karbapenemler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, İlaçlara direnç, Acinetobacter, Electrophoresis-agar gel, Genes, Carbapenems, Polymerase chain reaction, Drug resistance
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Acinetobacter spp. çoklu antimikrobiyal direnç gösterebilen ve hastaneden kazanılmış enfeksiyonlarda önemli olan bir patojendir. Çoklu ilaca dirençli Acinetobacter spp. suşlarının tedavisinde karbapenemler önemli bir seçenektir. Çalışmamızda, karbapenem dirençli Acinetobacter spp. suşlarında karbapenem direncine neden olan genlerin PCR yöntemiyle araştırma amaçlanmıştır. Yöntem: Özel Antalya Medical Park Hastane Kompleksinde Merkez Laboratuvarı Mikrobiyoloji bölümünde değerlendirilen kültür sonuçlarında üremesi olan izolatlar Vitek 2 (Biomerioux) otomatize sistemde karbapenem dirençli Acinetobacter baumanni olarak tanımlanan, 48 adet köken çalışmaya dahil edildi. İmipenem ve meropenem direnci için ayrıca E-test yapıldı ve MİK değerleri belirlendi. Örnekler -20°C'de saklandı. DNA eksraksiyonu kaynatma yöntemi ile yapıldı. In-house PCR yöntemi ile karbapenem direnç genleri araştırıldı. Bulgular: Hastaların 16 sı kadın (% 33,3), 32 si erkektir (% 66,7). Yaş ortalaması 51,83'tür. Çalışmaya dahil edilen hasta numunelerinde altı trakeal aspirat ( % 33,33), on dört kan (% 29,17), bir plevra (% 2,08), altı katater (% 10,42), üç yara yeri (%6,25), iki dren (% 4,17), iki balgam (% 4,17),) , üç idrar (% 6,25), bir bos kültürü (%2,08) vardır. OXA- 23 ve OXA-51 genine 48 hastanın hepsi sahiptir. IsabA1 genine sahip otuz iki köken, VIM direnç genine sahip sekiz köken (% 16,6) ,OXA-58 genine sahip iki köken (% 4,16), GIM genine sahip iki köken (% 4,16), SIM genine sahip iki köken (% 4,16) tespit edilmiştir. OXA-24, NDM-1, SPM-1 genine sahip hiçbir köken bulunmamıştır. Sonuç: Acinetobacter baumanni direnci giderek artmaktadır. Direncin moleküler epidemiyolojisinin saptanması gerekli izolasyon önlemlerinin kesintisiz bir şekilde uygulanması bu bakterinin sebep olduğu enfekesiyonların önlenmesinde etkili olur. Her hastanenin direnç profili değişiklik gösterdiğinden benzer çalışmaların ülke çapında yapılması faydalı olacaktır.

Özet (Çeviri)

Objective: Acinetobacter spp. is an important pathogen for hospital acquired infection known for its resistance for multiple antimicrobial agents. Carbapenem is an important option in the treatment of infection caused by multidrug resistant Acinetobacter spp. In our study, genes causing carbapenem resistance of Acinetobacter spp. strains were investigated by a PCR method. Method: The isolates with culture results evaluated in Microbiology Department of Private Antalya Medical Park Hospital Complex Central Laboratory were included in 48 Vitek 2 (Biomerioux) automated system identified as carbapenem resistant Acinetobacter baumanni.E-test was also performed for imipenem and meropenem resistance and MIC values were determined. Samples were stored at -20°C. DNA extraction was performed by boiling. Carbapenem resistance genes were investigated by in-house PCR method. Results: Sixteen patients were female (33.3%) and 32 were male (66.7%). The mean age is 51.83 years. Six tracheal aspirate (33.33%), fourteen blood (29.17%), one pleura (2.08%), six catheter (10.42%), three wound (6.25%), two drain (4.17%), two sputum (4.17%), three urine (6.25%), one CSF culture (2.08%) were included in the study. All 48 patients had the OXA-23 and OXA-51 genes. Thirty-two strains had ISAbA1 gene, 8 strains had VIM resistance gene (16.6%), two strains had OXA-58 gene (4.16%), two strains had GIM gene (4.16%), two strains had SIM gene (4.16%). OXA-24, NDM-1, and SPM-1 genes were not found im any strain. Conclusion: Acinetobacter baumanni resistance is gradually increasing. Continuous application of isolation measures required to determine the molecular epidemiology of resistance is effective in preventing infections caused by this bacterium. As each hospital's resistance profile varies, it would be beneficial to conduct similar studies throughout the country.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    193883

    Pseudomonas ve acinetobacter klinik izolatlarında metallo-beta-laktamaz üretiminin araştırılması

    Investigation of metallo-beta-lactamase production in pseudomonas and acinetobacter clinical isolates

    LİNDA AŞIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MÜZEYYEN MAMAL TORUN

  2. Tez No

    399041

    Klinik acınetobacter baumannıı izolatlarında karbapenem direncine yol açan sınıf-D beta-laktamazların araştırılması

    Investigation of class-D beta-lactamases causing carbapenem resistance in clinical acinetobacter baumannii isolates

    ISKANDAR DAVANDEH

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BAYRI ERAÇ

  3. Tez No

    60737

    Klinik ve poliklinik hastalarında gram negatif çomakların ürettiği beta laktamaz enzim sıklığının ve beta laktam antibiyotiklere direncin belirlenmesi

    Determination of the beta lactamase enzym density produced by gram negative rods in clinical and polyclinical patients and the resistance againts beta lactam antibiotics

    ESRA GÜLSEREN AYAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA SAMASTI

  4. Tez No

    416008

    Yoğun bakım ünitelerinde acinetobacter enfeksiyonlarına bağlı mortalite için risk faktörleri ve tedavi seçenekleri

    Fatality associated with acinetobacter infections in intensive care units and treatment options

    OKAN DERİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. DİLEK YILDIZ SEVGİ

  5. Tez No

    661819

    Yoğun bakım ünitelerinde karbapenem dirençli acinetobacter SPP. ve pseudomonas spp. enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, risk faktörleri ve mortaliteye etkisi

    The epidemiology, risk factors, and their effects on mortality of carbapenem resistant acinetobacter SPP. and pseudomonas spp. infections in intensive care units

    FATMA ÖZCAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    HastanelerAkdeniz Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLARA İNAN

Geri Dön