Association mapping for yellow rust resistance in wheat (triticum aestivum l.)
Buğdayda sarı pasa dayanıklılık için ilişkilendirme haritalaması
- Tez No: 630195
- Danışmanlar: PROF. DR. MUZAFFER TOSUN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Ziraat, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 146
Özet
Puccinia striiformis f. sp. tritici Westend'in neden olduğu sarı pas, küresel buğday üretimi için önemli bir tehdittir. Dayanıklılık genlerinin dayanıklılığındaki kırılma ve sarı pasın yeni virülans ve daha agresif patotipleri, dünyanın tüm büyük ekmeklik ve makarnalık buğday yetiştirme alanlarında ciddi sorunlara neden olmaktadır. Islah programlarında kullanılmak üzere yeni dayanıklılık genleri ve ilişkili QTL'lerin yeni kaynaklarını araştırmak ve belirlemek için, ICARDA gen bankasında muhafaza edilen sekiz ülkeden 600 ekmeklik buğday yerel çeşidinden oluşan bir ilişkilendirme haritalaması paneli oluşturulmuştur. İlişkilendirme haritalama paneli 2016, 2018 ve 2019 yıllarında İzmir, Türkiyede çok sayıda sarı pas patotipine karşı fide ve ergin bitki dayanıklılığı açısından değerlendirilmiştir. Genom çapında ilişki çalışması (GWAS), Karışık Doğrusal Model (MLM) kullanılarak gerçekleştirildi. 47 SNP, 19 genomik bölgede, hem fide hem de ergin bitki aşaması dayanıklılığı için önemli SNP-özelliği ilişkilerine sahip olarak varsayılmış ve markör-özellik ilişkileri için önem eşiği, hatalı keşif oranı (q) ≤ 0.05 ile belirlenmiştir. Bu çalışmada tanımlanan üç genomik bölge (QYr.1D_APR, QYr.3A_ve QYr.7D_fide dönemi), daha önce rapor edilen herhangi bir Yr geni veya QTL'den çok uzakta yer almaktadır, böylece etiketlenen yeni genomik bölgelerdir. Yeni QTL bölgelerindeki aday genlerin analizi sonucunda, bitkilerin hastalığa dayanıklılığı ve savunma mekanizması ile ilgili proteinleri kodlayan birkaç aday dayanıklılık geni belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Stripe rust, caused by Puccinia striiformis Westend. f. sp. tritici is an important threat to global wheat production. The breakdown in resistance of resistance genes and new virulent and more aggressive pathotypes of stripe rusts are causing serious problems in all main bread and durum wheat cultivating areas of the world. To look and identify new sources of resistance genes and associated QTL for utilization in breeding programs an association mapping panel comprising of 600 bread wheat landraces was assembled from eight countries preserved in ICARDA gene bank. The association mapping panel was evaluated for seedling and adult plant resistance against multiple yellow rust pathotypes in Izmir, Turkey during 2016, 2018 and 2019. The genome-wide association study (GWAS) was carried out using a Mixed Linear Model (MLM). 47 SNPs were postulated at 19 genomic regions with significant SNP-trait associations for both seedling and adult plant stage resistance, the threshold of significance for marker-trait associations was determined by the false discovery rate (q) ≤ 0.05. Three genomic regions (QYr.1D_APR, QYr.3A_seedling and QYr.7D_seedling) identified in this study are far away from any previously reported Yr gene or QTL thus, tagging novel genomic regions. The analysis for the candidate genes in the novel QTL regions identified several candidate resistance genes encoding proteins related to plants disease resistance and defense mechanism.
Benzer Tezler
- Şişli bölgesine ait tarihi pervıtıtch sigorta haritalarının planimetrik doğruluklarının incelenmesi ve bölgedeki alansal değişimin irdelenmesi üzerine bir çalışma
A study on the examination of planimetric accuracy of historical pervititch insurance maps of şi̇şli̇ region and the evaluation of the areal change in the region
ERMAN YELTEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Jeodezi ve Fotogrametriİstanbul Teknik ÜniversitesiGeomatik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TURAN ERDEN
- İncir genotiplerinin karakterizasyonu ile cinsiyet ve bazı meyve özellikleri için ilişkilendirme haritalaması yöntemi ile moleküler işaretleyicilerin belirlenmesi
Characterization of fig genotypes and development of molecular markers for sex determination and some important fruit features using association mapping
HATİCE IKTEN
Doktora
Türkçe
2007
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. NEDİM MUTLU
PROF.DR. UYGUN AKSOY
- Farklı elma tür ve çeşitlerinde bazı agronomik özellikler için ilişki haritalaması
Association mapping for some agronomic characteristics in different apple species and varieties
MERVE AREFE YİĞİT
- Association mapping for oil and protein content in hazelnut (corylus avellana l.)
Fındıkta (corylus avellana l.) yağ ve protein içeriği için ilişkilendirme haritalaması
FATMANUR SÖYLEMEZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Zeytin (Olea europaea)'de ilişki haritalaması (Association mapping) ile bazı karakterlerle ilişkili DNA markörlerinin geliştirilmesi
Development of DNA markers associated with some traits using association mapping in olive (Olea europaea)
HİLAL BETÜL KAYA AKKALE
Doktora
Türkçe
2016
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ