Antibakteriyel etkili ofloksasin'in multispektroskopik olarak dna ile etkileşimi ve moleküler kenetlenme çalışmaları
Investigation of antibacterial drug ofloxacin interaction with dna by spectroscopic techniques and molecular docking studies
- Tez No: 632751
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ÇEŞME
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Analitik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
DNA molekülünün Watson-Crick tarafından çift sarmal yapısının aydınlatılmasından bu yana ilaç tasarım çalışmaları hız kazanmıştır. Antikanser ve antibakteriyel ilaçların DNA ile yaptığı kovalent ve kovalent olmayan etkileşimlerle yeni ilaçlar geliştirilerek insan sağlığı daha refah düzeye ulaştırılmıştır. Bu tez çalışmasında Florokinolonlar sınıfı antibiyotiklerden antibakteriyel etkili Ofloksasin ilaç etken maddesinin DNA ile etkileşim çalışmaları Uv-vis, Fotolüminesans gibi multispektroskopik tekniklerle incelenmiştir. DNA etkileşimine ait moleküler kenetlenme çalışmaları teorik olarak yapılmıştır. Moleküler kenetlenme çalışmaları ile DNA etkileşim mekanizması teorik olarak hesaplanıp karşılaştırma yapılmıştır. UV-vis deneyinde bağlanma sabiti (Kb) OFX için 1.89 ± 0.3 x 104 M-1 olarak bulundu. Floresan söndürme deneyi için bağlanma sabiti (KSV) OFX için 1.93 x 104 M-1 olarak bulunmuştur. Moleküler modelleme ve yerleştirme çalışmalarına dayanarak, OFX ve DNA arasındaki bağlanma afinitesi -8.4 kcal/mol olarak bulunmuştur. DNA ile kenetlenmiş OFX modeli ve bağlanma modu, deney sonuçları ile korelasyon göstermiş ve OFX, DNA ile küçük oluk üzerinden etkileşime girmiştir.
Özet (Çeviri)
Since the double helix structure of the DNA molecule was illuminated by Watson-Crick, drug design studies have gained momentum. With the covalent and non-covalent interactions of anticancer and antibacterial drugs with DNA, new drugs have been developed and human health has been brought to a more prosperous level. In this thesis study, interaction studies of antibacterial effective ofloxacin drug active substance with fluoroquinolones class antibiotics with DNA were investigated by multispectroscopic techniques such as Uv-vis, Photoluminescence. Molecular docking studies of DNA interaction have been done theoretically. DNA interaction mechanism was calculated theoretically and compared with molecular docking studies. In the UV-vis experiment, the binding constant (Kb) was found to be 1.89 ± 0.3 x 104 M-1 for OFX. The binding constant (KSV) for the fluorescent quenching experiment was found to be 1.93 x 104 M-1 for OFX. Based on molecular modeling and docking studies, the binding affinity between OFX and DNA was found to be -8.4 kcal / mol. The DNA-docked OFX model and binding mode correlated with the experimental results and OFX interacted with the DNA over the small groove.
Benzer Tezler
- Kırklareli, Edirne ve Tekirdağ illerindeki yumurtacı tavuk altlıklarından elde edilen salmonella izolatlarının serotiplendirilmesi, bazı dezenfektanlara, antibiyotiklere ve kamfor yüklü kitosan gümüş nanopartiküllerine duyarlılıklarının belirlenmesi
Serotyping of salmonella isolates obtained from layer hen litters in Kırklareli, Edirne and Tekirdağ provinces, and determination of their sensitivity to some disinfectants, antibiotics and camphor loaded chitosan silver nanoparticles
İBRAHİM POLAT
Doktora
Türkçe
2024
BiyolojiTrakya ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BURHAN ŞEN
PROF. DR. FATMA KAYNAK ONURDAĞ
- 2-hidroksi-4,5-dimetoksi benzen içeren schiff bazları ve metal komplekslerinin sentezi, karakterizasyonu ve antibakteriyel aktivitelerinin incelenmesi
Investigation of the synthesis, characterization and antibacterial activities of some new schiff base ligands and complexes containing 2-hydroxy-4,5-dimethoxy benzene
SEMANUR YEŞİLBAĞ
- Antibiyotik içeren çeşitli oküler nano-taşıyıcı sistemlerin in vitro in vivo değerlendirilmesi üzerine çalışmalar
Studies on the in vitro - in vivo evaluation of different ocular nano-carrier systems containing antibiotics
NESLİHAN ÜSTÜNDAĞ OKUR
Doktora
Türkçe
2012
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. GÖKHAN ERTAN
- Kaliks[4]aren bazlı suda çözünen gümüş nanopartiküllerin sentezi ve antibakteriyal özellikleri
Synthesis and antibacterial properties of calix[4]arene based water-soluble silver nanoparticles
FATMA DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
KimyaAfyon Kocatepe ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLDEREN UYSAL AKKUŞ
- Yeni 2,5-disübstitüebenzoksazol türevlerinin sentezi, yapılarının aydınlatılması, antimikrobiyal etkileri ve moleküler modelleme çalışmaları
Synthesis, structure elucidation, antimicrobial activity and molecular modelling studies of novel 2,5-disubstitutedbenzoxazoles
MUSTAFA ARISOY
Doktora
Türkçe
2013
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM TEMİZ ARPACI