Mercimek (Lens culinaris Medik.) çeşitlerinin DNA barkodlamametodu ile tanımlanması
Identification of lentils (Lens culinaris Medik.) varieties by DNA barcoding method
- Tez No: 638314
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SEMRA HASANÇEBİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 111
Özet
Bu çalışma; Türkiye'de üretim iznine sahip mercimek çeşitlerini DNA barkodları ile tanımlamak amacıyla yapılmıştır. Çalışmada 34 adet Türkiye ve 1 adet Kanada menşeli çeşit kullanılmıştır. Barkod geni olarak“CBOL (The Barcode of Life Data) Bitki Grubu”tarafından önerilen rbcL, matK ve trnH-psbA kloroplast genleri seçilmiştir. 3 lokus da evrensel primerler kullanılarak PCR ile başarılı bir şekilde çoğaltılmıştır. Ancak PCR ürünlerinin dizilenmesinde sorun yaşanmıştır. Dizileme sorunlarının muhtemel sebepleri öngörülerek alternatif yöntemler uygulanmıştır. Uygulanan yöntemler sonucunda trnH-psbA lokusu %100 başarı ile dizilenmiştir. Başarı oranı matK lokusu için %75, rbcL lokusunda ise dizileme sorunları çözülememiştir. trnH-psbA ve matK lokusundan elde edilen dizi bilgileri“Mega X”programında“ClustalW alignment”metodu ile hizalanmış ve“UPGMA”metoduna göre filogenetik ağaç oluşturulmuştur. rbcL lokusuna ait verilerin yetersiz olması sebebiyle filogenetik analizlere dahil edilmemiştir. Çeşitlerden elde edilen diziler kırmızı ve yeşil taneli olmak üzere iki grupta incelenmiş toplamda çeşitleri tanımlayıcı 18 haplotip elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
This study was conducted in order to identify lentil varieties with DNA barcodes that have permission to be produced in Turkey. 34 varieties originating from Turkey and 1 species originating from Canada were used in the study. The rbcL, matK and trnH-psbA chloroplast genes proposed by the“CBOL (the Barcode of life data) Plant group”were selected as the barcode gene. 3 loci have also been successfully replicated with PCR using universal primers. However, there has been trouble sequencing of PCR products. Alternative methods were applied in anticipation of possible causes of sequencing problems. The trnH-psbA locus was sequenced with 100% success as a result of the methods applied. The success rate is 75% for the matK locus and the sequencing problems for the rbcL locus have not been solved. The sequence information from the trnH-psbA and matK locus is aligned with the“ClustalW alignment”method in the“Mega X”program and the phylogenetic tree is formed according to the“UPGMA”method. It was not included in phylogenetic analyses due to insufficient data on loci rbcL. The sequences obtained from the cultivars were examined in two groups as red and green grains. A total of 18 haplotypes were obtained to describe the cultivars.
Benzer Tezler
- Mercimek (Lens culinaris Medik.)' de farklı çeşitler arasında genetik polimorfizmin DNA markır teknolojisi ile tanımlanması
Determination of the genetic polymorphism using DNA marker technology between distinct accessions in lentil (Lens culinaris Medik.)
SAMİ AKSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TÜLAY HEKİMBAŞI
- Bazı mercimek(Lens culinaris medik.) çeşitlerinin çimlenme döneminde tuza toleranslarının belirlenmesi
Determination of salinity tolerances during germination peri̇od of some lentil (Lens culinaris medik.) cultivars
CANSU ÇAKIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatSelçuk ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERCAN CEYHAN
- Farklı mercimek (Lens culinaris Medik.) çeşitlerinin doku kültüründe mikroüretimi
Migropropagation of lentil (Lens culinaris Medik.) cultivars in plant tissue culture
FETHİ AHMET ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
BiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSA TÜRKER
- Alternatif sıcaklığın su stresi altındaki mercimek (Lens culinaris Medik.) çeşitlerinin çimlenme ve bazı fizyolojik parametreleri üzerine etkisi
Effects of alternating temperature to germination and some physiological parameters of lentil (Lens culinaris Medik.) species under water stress
ELİF HAKLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
BotanikÇukurova ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SEMA DÜZENLİ
- Screening of advanced generation lentil mutant genotypes for tolerance to imazamox herbicide
Mercimekte ileri generasyon mutant hatlarda imazamox herbisitedayanıklılığın belirlenmesi
ZIAN HAMEED AHMED
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
ZiraatHarran ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ABDULLAH KAHRİMAN