Geri Dön

Küçük hücre dışı akciğer kanserlerinde transkripsiyon faktörü NFKB-aracılı otofaji düzenlenme mekanizmalarının aydınlatılması

Elucidation of transcription factor NFKB-mediated autophagy regulation mechanisms in NON-small cell lung cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 639764
  2. Yazar: ÖZGE ALVUR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HAKAN AKÇA
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Onkoloji, Tıbbi Biyoloji, Oncology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Pamukkale Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 127

Özet

Otofaji, tüm ökaryotlarda yüksek oranda korunmuş hücre içi degradasyon ve geri dönüşüm prosesidir. Otofaji mekanizmasında meydana gelen aksaklıklar kanser de dahil birçok hastalığın progresyonunda yer alır. Otofaji, kanserin doğasına bağlı olarak tümör baskılayıcı bir mekanizma olarak davranabildiği gibi onkogenik bir mekanizma olarak da davranabilir. Otofaji mekanizmasının düzenlenmesinde birçok hücre içi molekül, selüler proses ve yolaklar rol oynayabilir. Bu yolaklardan biri de NFKB yolağıdır. Bir transkripsiyon faktörü olan NFKB, önemli hücresel proseslerde rol oynayan çok fazla sayıda genin ekspresyonunu regüle eder. NFKB'nin otofajiyi indükleyici ya da otofajiyi inhibe edici olarak davrandığı bilinmektedir. Kullanımda olan birçok anti-kanser terapisinin hem otofajiyi hem de NFKB yolağını etkilediği bilinmektedir. NFKB yolağı ve otofaji arasındaki fonksiyonel ilişkiyi aydınlatmak kombine terapiler kullanılarak kanser tedavilerinin etkinliğinin arttırılmasına ve yeni stratejiler geliştirilmesine katkı sağlayabilecektir. Ancak literatürde, Küçük Hücre Dışı Akciğer Kanserlerinde (KHDAK) NFKB yolağının otofajiyi nasıl düzenlediği ve bu düzenlemenin ayrıntılı mekanizmasına ilişkin bilgi bulunmamaktadır. Bu nedenle tez çalışmamızda Küçük Hücre Dışı Akciğer Kanserlerinde NFB'nin otofaji mekanizması üzerindeki olası regüle edici etkisini ve NFKB-aracılı otofaji regülasyonunda rol oynayan olası genleri saptamayı amaçladık. Öncelikle KHDAK hücre hattında NFKB baskılanan ve overeksprese edilen gruplar oluşturduk ve bu gruplarda otofajiyi indüklediğimiz ve indüklemediğimiz alt gruplar oluşturduk. Bu örnek gruplarında otofaji düzeylerini western blot analizi ile belirledik. Bunun sonucunda Küçük Hücre Dışı Akciğer Kanserinde NFKB'nin otofajiyi pozitif regüle ettiğini ortaya koyduk. Sonrasında bu örnek gruplarında RNA sekans analizi ile gruplar arasında farklı ekspresyon profili sergileyen genleri saptadık. NFKB overeksprese edilen otofaji indüklü gruplarda ekspresyonu artarken NFKB baskılandığında ekspresyonu düşüş gösteren genleri NFKB-aracılı otofaji regülasyonunda rol oynayan aday genler olarak belirledik. RNA sekanslama sonuçlarını qRT-PCR analizi ile teyit ederek NFKB-aracılı pozitif otofaji regülasyonunda rol oynayan genleri saptadık. Çalışmamızın 'NFKB Küçük Hücre Dışı Akciğer Kanserlerinde otofajiyi nasıl regüle eder ve bu regülasyonda rol oynayan genler nelerdir?' sorusuna cevap bulabilmek adına literatüre katkı sunacağını düşünmekteyiz.

Özet (Çeviri)

Autophagy, is an intracellular degradation and recycling process which has been highly conserved in eukaryotes. Dysfunctions in autophagy process take place in progression of various diseases including cancer. Depend on nature of cancer, autophagy may behave as an oncogenic mechanism as well as a tumor suppressor mechanism. Many intracellular molecules, cellular processes and pathways may play role in regulation of autophagy mechanism. One of them is NFKB pathway. NFKB, a transcription factor, regulates the expression of a large number of genes involved in important cellular processes. It is known that NFKB behaves an autophagy inducer or inhibitor. Many anti-cancer therapies in use effect both autophagy and NFKB pathway. Illuminating the functional relationship between the NFKB pathway and autophagy can contribute to increase of the effectiveness of cancer treatments by using combined therapies and to development of new strategies. However in the literature, there is no information about how NFKB pathway regulates autophagy in Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC) and detailed mechanism of this regulation. Therefore, in our thesis, we aimed to determine the possible regulatory effect of NFKB on autophagy mechanism and possible genes involved in NFKB-mediated autophagy regulation in NSCLC. Firstly, we constitued NFKB-suppressed and -overexpressed groups in NSCLC cells and subgroups which we induced and not induced autophagy. We determined autophagy levels in these groups by western blotting. As result, we revealed that NFKB positively regulates autophagy in NSCLC. After that, in these groups, we detected genes that display different expression profiles between the groups by RNA sequence analysis. We determined the genes that showed decreased expression when NFKB was suppressed while their expressions increased in NFB overexpressed autophagy-induced groups as candidate genes which play role in NFKB-mediated autophagy regulation. We detected genes which play role in NFKB-mediated positive autophagy regulation by confirming RNA sequencing results by qRT-PCR. We think that our study will contribute to the literature in order to find the answer to the question of“How does NFKB regulate autophagy in NSCLC and what are the genes involved in this regulation?”

Benzer Tezler

  1. Tez No

    778283

    Investigation of possible interaction between ARID3A, ARID3B, lncRNAs MALAT1 and NORAD in non-small cell lung cancer (NSCLC)

    Küçük hücreli dışı akciğer kanserinde (KHDAK) ARID3A, ARID3B, lncRNA'lar MALAT1 ve NORAD arasındaki olası etkileşimin araştırılması

    ŞEDİN NASUH

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Tıbbi BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ABU SHAMEEM MD. SAADAT KHANDAKAR

    PROF. DR. SİBEL OĞUZKAN BALCI

  2. Tez No

    875402

    Akciğerin ileri evre skuamöz hücreli karsinomunda dek gen değişikliklerinin prognoz ve immünoterapi tedavisi ile ilişkisi

    Dek gene rearrangement in advanced stage squamous cell carcinoma of the lung the relationship with prognosis and immunotherapy treatment

    HANDE KARABAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    PatolojiPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERDA BİR

  3. Tez No

    844679

    Timoma ve timik karsinom vakalarında PD-L1 ve SOX-2 ekspresyonunun klinikopatolojik bulgularla ilişkisi

    The relationship of PD-L1 and SOX-2 expression with clinicopathological findings in case of thymoma and thymic carcinoma

    HAKAN ÖZTÜRKÇÜ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    PatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYLİN GÜL

  4. Tez No

    899032

    Akciğer kanseri tanılı hastalarda FOXO3A genekspresyon düzeylerinin değerlendirilmesi

    FOXO3A gene in patients diagnosed with lung cancerevaluation of expression levels

    DAMLA HASGÜL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Göğüs CerrahisiMersin Üniversitesi

    Göğüs Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ ÖZDÜLGER

  5. Tez No

    347615

    Küçük hücreli dısı akciğer kanseri hastalarında RRM1, RRM2, ERCC2 gen polimorfizmleri ve serum 8-OHG ve LHD düzeylerinin hastalığın riski ve prognozu üzerine etkilerinin arastırılması

    Investigation of the effects of RRM1, RRM2, ERCC2 gene polymorphisms and serum 8-OHDG levels on disease risk and prognosis in nsclc patients

    ENDER MEHMET ÇOŞKUNPINAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN YAYLIM

Geri Dön