Geri Dön

Yara ve yanık numunelerinden Pseudomonas aeruginosa izolasyonu, tanımlanması ve toksin üretiminden sorumlu ExoU ve biyofilm geni yönünden araştırılması

Isolation of Pseudomonas aeruginosa from wound and burn samples, identification and investigation of ExoU gene reverse responsible for toxin production

PDF İndir

  1. Tez No: 639771
  2. Yazar: MUSTAFA RIYADH SALMAN AL-RUBAYE
  3. Danışmanlar: PROF. DR. EVREN YILDIZTUGAY, DOÇ. DR. AHMET UYSAL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Genetics, Microbiology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Selçuk Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Çalışmanın amacı doğrultusunda klinik şartlarda yaralardan ve yanıklardan toplam 206 örnek alınmıştır. Bunların 139 yanık ve 67 tanesi yara numunesidir. 1 ila 70 yaş aralığındaki farklı klinik vakalardan Bağdat Eğitim Hastanesi ve tıp hastanelerinden 3 ay süreyle toplanmıştır (Ocak-Mart). Örnekler, fenotipik özelliklerine bağlı olarak Pseudomonas aeruginosa'nın bakteriyel izolatlarını elde etmek için çeşitli kültür ortamlarında (MacConkey agar, Kanlı agar ve Cetrimide agar) kültüre alınmıştır. 206 örnekten toplam 50 Pseudomonas aeruginosa izolatı elde edilmiştir. 31 izolat yanıktan ve 17 izolat yara numunelerinden izole edilmiştir. İzolatlar hem Api 20E teşhis kiti hem de bir dizi biyokimyasal teste tabi tutulmuş olup, Pseudomonas aeruginosa bakterileri için izolasyon veriminin daha fazla teyit edilmesini sağlamıştır. Numunelerden 12'sinin (7 yanık ve 5 yara) Pseudomonas aeruginosa için pozitif olduğu tespit edildi. Suşların disk difüzyon yöntemi ve otomatize sistem olan VİTEK-2 ile çeşitli antibiyotiklere duyarlılıkları araştırıldı. Sonuçlar, izolatların çoğunun (% 92) Amoksisiline dirençli olduğunu gösterdi. Antibiyotiklere karşı direnç oranları sırası ile Amoksisilin (% 89), Gentamisin (% 81), Siprofloksasin (% 79), Tetrasiklin (% 74), Nalidiksik asit, Norfloksasin (% 72) ve İmipenem (% 66) olarak belirlendi. 50 izolatın 12'sinin ExoU geni için pozitif olduğu belirlendi. ExoU geninin polimeraz zincir reaksiyonunun (RT-PCR) sonuçları, NCBI veritabanı ve GenBank kullanılarak değerlendirildi. Sonuçlar, izolatların (% 98-100) lokal izolatlar ve uluslararası standart izolatlar arasında eşleştiğini gösterdi. ExoU geninin polimeraz zincir reaksiyonunun (RT-PCR) sonuçları, Pseudomonas aeruginosa ile ilişkili mutasyonları saptamak için kullanıldı ve transisyon, tüm izolatlarda ExoU geninin 5 mutasyonunun sıklığını gösterdi. Ek olarak, üç tip mutasyon tespit edildi. Bunlar 3 çerçeve kayması mutasyonu, 4 sessiz mutasyon ve 2 uyumsuz mutasyon şeklinde dağlım gösterdi.

Özet (Çeviri)

For the purpose of the study, 206 samples were taken from wound and burn under clinical conditions. 139 of these are burn and 67 are wound samples. It was collected from Baghdad Education Hospital and medical hospitals for 3 months from different clinical cases between the ages of 1 and 70 (January-March). Samples were cultured in various culture media (MacConkey agar, Bloody agar, and Cetrimide agar) to obtain bacterial isolates of Pseudomonas aeruginosa based on their phenotypic properties. A total of 50 Pseudomonas aeruginosa isolates were obtained from 206 samples. 31 isolates were isolated from burn and 17 isolates from wound samples. The isolates were subjected to both the Api 20E diagnostic kit and a series of biochemical tests provided further confirmation of the isolation efficiency for Pseudomonas aeruginosa bacteria. 12 of the samples (7 burn and 5 wound) were found to be positive for Pseudomonas aeruginosa. The susceptibility of the strains to various antibiotics was investigated by VITEK-2, a disk diffusion method and automated system. The results showed that most of the isolates (92%) were resistant to Amoxicillin. Resistance rates to antibiotics were determined as Amoxicillin (89%), Gentamycin (81%), Ciprofloxacin (79%), Tetracycline (74%), Nalidixic acid and Norfloxacin (72%) and Imipenem (66%). While 12 of 50 isolates were determined to be positive for the ExoU gene. The results of the polymerase chain reaction (RT-PCR) of the ExoU gene were evaluated using the NCBI database and GenBank. The results showed that the isolates (98-100%) matched between local isolates and international standard isolates. The results of the polymerase chain reaction (RT-PCR) of the ExoU gene were used to detect mutations associated with Pseudomonas aeruginosa, and transitions showed the frequency of 5 mutations of the ExoU gene in all isolates. In addition, three types of mutations were detected. These showed dispersion as 3 framework shift mutations, 4 silent mutations, and 2 incompatible mutations.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    725653

    Lokal Pseudomonas suşundan antikanser proteini kodlayan azurin genini (AZU) moleküler tarama ve klonlama

    Molecular screening and cloning the azurin gene (AZU) encoding anticancer protein from local Pseudomonas strain

    SHAYMAA FADHIL ABBAS AL-ANBAGI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyomühendislikKırşehir Ahi Evran Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT ÇANLI

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ABDULAMEER M. GHAREEB

  2. Tez No

    779496

    Molecular diagnosis and examination of Proteus mirabilis isolated from urine and wound samples in Dhi-Qar province hospitals

    Dhi-Qar vilayetindeki hastanelerde idrar ve yara numunelerinden izole edilen Proteus mirabilis'in moleküler teşhisi ve tetkiki

    ZAID KAREEM BAHLOL AL-GHEZI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİN BOZKURT

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AMANY SHAKEİR JABER AL-RUBEI

  3. Tez No

    643919

    Zeytinyağından azelaik asit eldesi ve geliştirilecek krem formülasyonlarının biyolojik aktivitelerinin in-vitro koşullarda değerlendirilmesi

    Azelaic acid production from olive oil and in-vitro evaluation of the biological activities of cream formulations to be developed

    SİBEL CARI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Bilim ve TeknolojiSelçuk Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAMİDE FİLİZ AYYILDIZ

  4. Tez No

    779453

    Investigation of efflux pump and aminoglycoside resistance genes in Staphylococcus aureus strains isolated from clinical specimens in Iraq

    Irak'ta klinik numunelerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında atım pompası ve aminoglikosit direnç genlerinin incelenmesi

    AHMED AWAD FATTOOH MUSLMAWI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HİBA JASİM HAMZA

  5. Tez No

    323855

    Nanolif yara örtücü yüzeylerin geliştirilmesi ve karakterizasyonu

    Development and characterization of nanofiber wound dressings

    ZARİFE DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Tekstil ve Tekstil Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Tekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ DEMİR

Geri Dön