Erdemli ilçesi limon ağaçlarında tururunçgil klorotik cüceleşme virüs (TKCV) hastalığının yaygınlığının belirlenmesi ve moleküler karakterizasyonu
Determination and molecular characterization of citrus chlorotic virus disease (CCDAV) in lemon trees of Erdemli district
- Tez No: 640606
- Danışmanlar: PROF. DR. NÜKET ÖNELGE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Turunçgil, CCDaV, PCR, Citrus, CCDaV, PCR
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 106
Özet
Bu çalışma Mersin ili Erdemli ilçesinde limon yetiştiricilik alanlarında Turunçgil klorotik cüceleşme (TKCV) = Citrus chlorotic dwarf associated virus (CCDaV) hastalığının varlığını ve yaygınlığını araştırmak ve izolatlar arasındaki farklılığı ortaya koymak amacıyla yürütülmüştür. Erdemli ilçesi limon yetiştiricilik alanlarında yapraklarda kıvırcıklaşma, deformasyon, yapraklarda klorotik lekelenmeler ve yaprak alanlarının küçülmesi şeklinde simptom gösteren ağaçlardan örnekler toplanmıştır. Bu çalışma sonucunda CCDaV hastalığının Erdemli ilçesinde limon çeşitlerinde ortalama infeksiyon oranı %47 olarak saptanmıştır. Bölgede en fazla yetiştirilen çeşit olan Kütdiken limon çeşidinde ortalama bulaşıklık oranının %52 olduğu saptanmıştır. Biyolojik indeksleme çalışmalarında ise tohumdan yetiştirilen turunç (Citrus aurantium) fidanlarına CCDaV'nin inokülasyonu yapılmış ve hastalığın makroskobik simptomları doğada hastalıkla enfekteli ağaçlarda gözlenen simptomlarla benzer olduğu izolatlar arasında farklılık olmadığı belirlenmiştir. Örnekler PCR çalışmaları ile analiz edilmiş ve farklı primerler kullanılarak manto protein ve hareket protein gen bölgeleri belirlenmiştir. BLAST analizi sonucunda NCBI kayıtlı bulunan CCDaV'nin TK4 (JQ920490.1 ) izolatının ErY-4 (MT492444) izolatı ile karşılık gelen bölgeleri ve nükleotid dizilimlerinin %99,30 oranında benzerliğe sahip olduğu belirlenmiştir. Ayrıca bu izolatların birbiri ile yakın homolojiye sahip olduğu ancak Çin izolatları ile bazı nukleotid dizilim farklılıkları içermekle birlikte benzerliğin %98 oranında olduğu belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
This study aimed to investigate the occurrence and molecular characterization of Citrus chlorotic dwarf virus (CCDaV) causing citrus chlorotic dwarf disease on lemon orchards in Erdemli district in Mersin province. Leaf samples were collected from lemon trees exhibiting typical symptoms of the disease namely leaves curl and deformation, chlorotic spots in the burns and shrinking. The result shows that the average incidence rate of the virus in Erdemli district was 47% while Kütdiken, the most grown lemon variety in the district recorded 52% of average incidence rate. The biological indexing of the pathogen on sour orange (Citrus aurantium) showed a similarity of the macroscopic symptoms of the disease on infected lemon trees in the field with those inoculated sour oranges in a greenhouse. Samples were analyzed with PCR studies and coat protein and movement protein gene regions were determined using different primers As a result of the blast analysis, it was determined that TK4 (JQ920490.1) isolate of CCDaV registered with NCBI has 99.30% similarity with the ErY-4 (MT492444) isolate and the corresponding regions and nucleotide sequences. In addition, it was determined that these isolates had close homology with each other, but the similarity was 98% with Chinese isolates, although they had some nucleotide sequence differences.
Benzer Tezler
- Erdemli limon yetiştiricilik alanlarında rumple(çöküntü) hastalığının bulunma oranı ve çöküntü gözlenen limon ağaçlarında viroid etmenlerinin araştırılması
The prevalence of rumple disease in lemon growing areas of Erdemli district and investigation of viroid factors in lemon trees with rumple
OĞUZHAN KILINÇ
- Limon üreticilerinin risk tutumlarını etkileyen faktörlerin belirlenmesi
Determining the factors influencing risk behaviors of lemon farmers
DİLEK ÖZER
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
EkonomiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMİNE İKİKAT TÜMER
- Production of functional food ingredient by enzyme and ultrasound assisted extraction from lemon waste
Limon atıklarından enzim ve ultrason destekli ekstraksiyon ile fonksiyonel gıda bileşeni üretimi
NİHAL DURMUŞ
Doktora
İngilizce
2024
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL KILIÇ AKYILMAZ
- Erdemli ilçesi yer adları
Erdemli district location names
ÜMMÜ BOZKURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
DilbilimNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiTürk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMET BÜYÜKAKKAŞ
- Mersin ili Erdemli ilçesinde seralarda yetiştirilen domateslerde görülen bakteriyel etmenlerin tanısı ve yaygınlığı
Identification and prevalance of bacterial disease agents on greenhouse grown tomato plants in Erdemli district of Mersin province
MERVE GÜNEŞ