Geri Dön

ISOLATION, IDENTIFICATION, DETERMINATION OF ANTIMICROBIAL RESISTANCE PROFILES, AND MULTILOCUS SEQUENCE TYPING (MLST) OF CAMPYLOBACTER SPECIES FROM MEAT AND MILK PRODUCTS

ET VE SÜT ÜRÜNLERİNDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN İZOLASYONU, TANIMLANMASI, ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ PROFİLLERİNİN BELİRLENMESİ VE ÇOKLU LOKUS DİZİ TİPLENDİRMESİ (MLST)

  1. Tez No: 640725
  2. Yazar: CEREN BETÜL EKEN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEZA ARSLAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Biyoloji, Microbiology, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Antibiyotik dirençliliği, Bakteri izolasyonu, Beyaz peynir, Kıyma, Tavuk eti, Çiğ süt, Bacterial isolation, White cheese, Ground meat, Chicken meat, Raw milk
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışma, gıdalarda, önemli gıda kaynaklı patojenler olan Campylobacter türlerinin yaygınlığını, antimikrobiyal direncini, direnç belirleyicilerini ve genetik çeşitliliğini araştırmayı amaçlamıştır. Tavuk eti, kıyma, çiğ süt ve ev yapımı beyaz peynir (her birinden 50 adet) olmak üzere toplam 200 örnek incelenmiştir. 40 örnekte (%20) Campylobacter türleri tespit edilmiş olup, bunlar arasında C. jejuni (%2), C. coli (%3,5) ve diğer Campylobacter türleri (%14,5) bulunmuştur. Kontaminasyon oranları tavuk etinde %52, peynirde %12, kıymada %10 ve sütte %6 olarak belirlenmiştir. Tüm izolatlar ampisilin ve siprofloksine dirençli bulunmuştur. Eritromisin, nalidiksik asit, tetrasiklin, azitromisin ve kanamisine direnç sırasıyla %97,5, %95, %92,5, %82,5 ve %75 idi. Tüm izolatlar çoklu ilaca dirençlidir (MDR). aphA-3 geni izolatların %5'inde tespit edilmiştir. Tüm C. coli izolatları blaOXA-61 genini taşırken, C. jejuni izolatlarının %50'si pozitiftir. tet(O) geni izolatların %25'inde tespit edilmiştir. cmeB geni tüm C. jejuni izolatlarında ve C. coli izolatlarının %85,7'sinde mevcuttur. 23S rRNA gen mutasyonları bir C. jejuni (%33,3) ve bir C. coli (%14,3) izolatında tespit edilmiştir. Thr-86-Ile mutasyonu tüm C. coli izolatlarında ve bir C. jejuni izolatı hariç tümünde tespit edilmiştir. MLST yöntemiyle dört C. jejuni izolatı ST-2036, ST-824, ST-45 ve yeni ST-12345'e atanmıştır. Yedi C. coli izolatı ise beş farklı ST'ye (ST-829, ST-9011, ST-1628, ST-827 ve ST-1587) aittir ve bunların tümü CC-828 alt grubuna dahil edilmiştir. Bu çalışma, çoklu ilaca dirençli Campylobacter türlerinin varlığını ortaya koymuş ve C. jejuni ve C. coli izolatlarının klinik açıdan önemli dizi tiplerini (ST'lerini) tanımlayarak, bunların halk sağlığı açısından taşıdığı potansiyel öneme dikkat çekmiştir.

Özet (Çeviri)

This study aimed to investigate the prevalence, antimicrobial resistance, resistance determinants, and genetic diversity of Campylobacter spp. which are important foodborne pathogens in foods. A total of 200 samples, including chicken meat, ground beef, raw milk, and homemade white cheese (n=50 each), were examined. Campylobacter spp. were detected in 40 samples (20%), including C. jejuni (2%), C. coli (3.5%), and other Campylobacter spp. (14.5%). Contamination rates were 52% in chicken meat, 12% in cheese, 10% in ground beef, and 6% in milk. All isolates were resistant to ampicillin and ciprofloxacin. Resistance to erythromycin, nalidixic acid, tetracycline, azithromycin, and kanamycin was 97.5%, 95%, 92.5%, 82.5%, and 75%, respectively. All isolates were multidrug resistant (MDR). The aphA-3 gene was detected in 5% of isolates. All C. coli carried blaOXA-61, whereas 50% of C. jejuni were positive. The tet(O) gene was detected in 25% of isolates. The cmeB gene was present in all C. jejuni and 85.7% of C. coli. 23S rRNA gene mutations were identified in one C. jejuni (33.3%) and one C. coli (14.3%) isolate. Thr-86-Ile mutation was detected in all C. coli and all but one C. jejuni. MLST assigned four C. jejuni isolates to ST-2036, ST-824, ST-45, and the novel ST-12345. Seven C. coli isolates belonged to five STs (ST-829, ST-9011, ST-1628, ST-827, and ST-1587), all within CC-828. This study revealed the presence of multidrug-resistant Campylobacter spp. and identified clinically significant STs of C. jejuni and C. coli isolates, highlighting their potential public health importance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    479175

    Isolation, identification and determination of some pathogenic characteristics of salmonella spp. from retail chicken meat by phenotypic and genotypic methods

    Salmonella türlerinin perakende tavuk etinden fenotipik ve genotipik metodlarla izolasyonu, identifikasyonu ve bazı patojenik özelliklerinin belirlenmesi

    CEREN BETÜL EKEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyolojiAbant İzzet Baysal Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEZA ARSLAN

  2. Tez No

    376015

    Isolation, identification using phenotypic and genotypic methods and determination of some pathogenic characteristics of yersinia spp. from meat and milk products

    Et ve süt ürünlerinden yersinia türlerinin izolasyonu, fenotipik ve genotipik yöntemlerle adlandırılması ve bazı patojenite özelliklerinin belirlenmesi

    FATMA ÖZDEMİR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    MikrobiyolojiAbant İzzet Baysal Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEZA ARSLAN

  3. Tez No

    639322

    Yöresel ekşi hamurlardan saccharomyces cerevisiae suşlarının izolasyonu, tanımlanması ve multifonksiyonel özelliklerinin belirlenerek endüstriyel öneme sahip suşların saptanması

    Isolation and identification of saccharomyces cerevisiae strains from local sourdoughs and determination of industrially important strains by examining their multifunctional properties

    BUKET SOLAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Gıda MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEKİYE YEŞİM ÖZBAŞ

  4. Tez No

    735472

    Gebelerden izole edilen streptococcus agalactiae kökenlerinde antimikrobiyal direnç profilleri ve virülans faktörleri

    Antimicrobial resistance profiles and virulence factors in strains of streptococcus agalactiae isolated from pregnant women

    EMİNE HAMŞUOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİZAMİ DURAN

  5. Tez No

    458306

    Klinik örneklerden campylobacter türlerinin üretilmesinin araştırılması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi

    Investigation of growth of campylobacter species from clinical specimens and determination of their antimicrobial susceptibility

    RECEP BORUCU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. YELİZ TANRIVERDİ ÇAYCI

Geri Dön