Ticari ve halk elinde beslenen tavuklarda enterik laktobasillerin dağılımı ve makrolide-lincosamide-streptogramin (MLS) antibiyotiklere direnç profillerinin araştırılması
Distribution of enteric lactobacilli in backyard and commercial poultry and investigation of their makrolide-lincosamide-streptogramin (MLS) antibiotics resistance profiles
- Tez No: 652148
- Danışmanlar: PROF. SERKAN İKİZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Tavuk, Laktobasillus, MLS direnci, Antibiyotikler, Lactobacillus, Mikrobiyal duyarlılık testleri, Tavuklar, İlaçlara direnç, Chicken, Lactobacillus, Antibiotics, Microbial sensitivity tests, Chickens, Drug resistance
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada; ticari ve halk elinde beslenen tavuklardan alınan kloakal sıvaplardan Laktobasil türlerinin izolasyon ve identifikasyonu ile dağılımının belirlenmesi, izolatların Makrolid- Linkosamid-Streptogramin (MLS) grup antibiyotiklere ait MİK değerlerinin ve dirençten sorumlu belirli genlerin PCR ile saptanması amaçlandı. 12 farklı çiftlikten tesadüfi örnekleme ile toplamda 60 adet kloakal sürüntü örneğinden 174 Lactobacillus izolatı elde edildi. Bu izolatların 48'i halk elinde beslenen, 57'si yumurtacı ve 69'u broyler yetiştiricilik şekillerine aitti. Sırasıyla halk elinde beslenen, yumurtacı ve broyler yetiştiricilik olmak üzere 10, 12, 9 farklı Lactobacillus türü UltrafleXtreme MALDI TOF mass spectrometer cihazıyla identifiye edildi. Farklı Laktobasil türü izolat sayısı bakımından yetiştiricilik şekilleri arasında fark önemli bulunmuştur (p<0,05). Broth mikrodilüsyon metoduyla gerçekleştirilen antibiyotik duyarlılık test sonuçlarına göre; eritromisin, klindamisin, linkomisin, tylosin ile virjinamisin antibiyotiklerine direnç oranları sırasıyla halk elinde beslenen %62,5, %72,9, %43,8, %18,8, %37,5, yumurtacı %47,4, %78,9, %77,2, %40,4, %54,4 ve broylerde %87, %92,8, %91,3, %87, %73,9 olarak saptandı. Test edilen tüm antibiyotikler için yetiştiricilik şekilleri arasında fark önemli bulunmuştur (p<0,05). Günümüzde Laktobasil türleri için antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesinde standart metod bulunmayışına bağlı olarak fenotipik test, bakteriyel suşların antibiyotik direnç belirleyicilerinin varlığı yönünden tarandığı moleküler yöntemle (PZR) kombine edildi. Bu bağlamda dirençten sorumlu gen varlığı [erm(B)-erm(C)] değerlendirmesinde ise oranlar; halk elinde beslenen, yumurtacı ve broiler yetiştiricilikte sırasıyla; %27,1-%37,5, %70,2-%71,9, %76,8-%55,1 olarak bulundu. Erm(A) direnç geni varlığına sadece broiler tavuğa ait 1 Lactobacillus vaginalis izolatında rastlanmıştır. Sonuç olarak; hem ticari hem halk elinde beslenen tavukların mikrobiyomunda, önemli üyelerden olan Laktobasillerde yaygın antibiyotik direnç varlığına rastlanması antimikrobiyallerin kullanımının kontrollü ve sınırlı olması gerekliliğini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
In this study; it was aimed to determine the distribution and isolation of Lactobacillus species from cloacal swabs taken from commercial and backyard chickens, and to determine the MIC values of the isolates belonging to Macrolide-Lincosamide-Streptogramin (MLS) group antibiotics and specific genes responsible for resistance by PCR. A total of 174 Lactobacillus isolates were obtained from 60 cloacal swab samples by random sampling from 12 different farms. 48 of these isolates were from backyard chickens, 57 of them belonged to laying hens and 69 of broilers. 10, 12, 9 different Lactobacillus species were identified with UltrafleXtreme MALDI TOF mass spectrometer from backyard chickens, laying hens and broilers, respectively. The difference between the breeding methods was found to be significant in terms of the number of different Lactobacillus species (p<0,05). According to the antibiotic sensitivity test results performed with the broth microdilution method; resistance rates to erythromycin, clindamycin, lincomycin, tylosin and virginamycin antibiotics were 62.5%, 72.9%, 43.8%, 18.8%, 37.5% in backyard chickens, %47,4, %78,9, %77,2, %40,4, %54,4 in laying hens and 87%, 92.8%, 91.3%, 87%, 73.9% in broilers, respectively. For all antibiotics tested, the difference in breeding method was found to be significant (p<0,05). Due to the lack of a standard method for determining antibiotic susceptibility for Lactobacillus species, the phenotypic test was combined with the molecular method (PCR) in which bacterial strains were screened for the presence of antibiotic resistance determinants. In this context, in the evaluation of the gene responsible for resistance, the rates are; 27.1%-37.5%, 70.2%-71.9%, 76,8%-55,1% in backyard chickens, laying hens and broilers, respectively. The presence of the erm (A) resistance gene was found only in 1 Lactobacillus vaginalis isolate from broiler chicken. As a result; the presence of widespread antibiotic resistance in the microbiome of both commercial and backyard chickens, one of its important members, Lactobacilli, reveals the need for controlled and limited use of antimicrobials.
Benzer Tezler
- Effect of chymotrypsin on M1 type pyruvate kinase from rabbit muscle and L-type from sheep liver
Başlık çevirisi yok
NİLAY BAŞARAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERAL YÜCEL
- Antakya tarihi ticaret merkezi mekansal yapı değişim ve gelişim sürecinin kent ticaret merkezi planlamasına etkinliği
The Effectiveness of spatial structural chance and development period of the historical trade center of Antakya in the urban trade planning
NEVİN TURGUT
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Şehircilik ve Bölge PlanlamaGazi ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NURCAN UYDAŞ
- Nar konsantresinin dondurularak ve kimyasal yöntemlerle saklanması sırasında meydana gelen değişmeler üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
İLHAN BODUR
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiTarım Ürünleri Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YURDAGEL ÜNAL
- Uzun zincirli bazı alkil aromatik hidrokarbonların yüzey aktif madde olarak kullanım alanlarının incelenmesi
Başlık çevirisi yok
SAADET YAPAR
- Avrupa Topluluğu'nun bürokratik yapısı
Başlık çevirisi yok
GÜNİZ ODYAKMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1989
Uluslararası İlişkilerİstanbul ÜniversitesiUluslararası İlişkiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BENER KARAKARTAL