Geri Dön

Metilparaben maruziyetinin zebra balığı embriyoları üzerindeki biyokimyasal ve epigenetik etkilerinin araştırılması

Investigation of biochemical and epigenetic effects of methylparaben exposure on zebrafish embryos

  1. Tez No: 652255
  2. Yazar: PERİHAN SEDA ATEŞ KALKAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. EBRU IŞIK ALTURFAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Genetik, Moleküler Tıp, Biochemistry, Genetics, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya (Ecz) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 151

Özet

Amaç: Çalışmamızın amacı; metilparaben maruziyetinin yaratabileceği olumsuz etkilerin moleküler, biyokimyasal ve epigenetik düzeyde araştırılmasıdır. Gereç ve yöntem: Zebra balığı embriyolarında LC50 doz belirlenerek lokomotor aktivite testi, RT-PCR ile apoptoz ve metilasyonla ilgili genlerin ifadeleri belirlenmiştir. Apoptotik hücreler akridin, lipit birikmeleri oil red o boyaması, vitellogenin in situ hibridizasyon ile saptanmıştır. Biyokimyasal parametreler spektrofotometrik yöntemle, H3K27ac histon modifikasyonundaki değişimler kromatin immün çöktürme (ChIP) metoduyla saptanmıştır. RNA-dizileme NGS (yeni nesil dizileme); analizi için BlueBee biyoinformatik programı kullanılmıştır. Anlatımı değişen genlerin gen ontoloji ve gen kümelendirme analizi DAVID biyoinformatik web sitesi aracılığıyla yapılmıştır. Bulgular: Belirlenen LC50 dozlarında metilparaben maruziyeti; perikardiyal ödem, pigmentasyon ve kuyruk defektleri ile embriyo hareketlerinde azalmaya neden olmuştur. Apoptoz ve metilasyon ile ilişkili genlerin anlatımında değişimler, apoptotik hücreler, vitellogenin ile lipit birikimde, lipit peroksidasyonu ve nitrik oksid düzeyinde artış; glutatyon s-transferaz aktivitesinde ise azalma belirlenmiştir. Maruziyet grubunda H3K27ac histon modifikasyonları anlamsız, 172 genin anlatım seviyesi ise anlamlı seviyede değişmiştir. Anlatımı anlamlı ölçüde değişen gen kümeleri translasyon, lipit metabolizması, koagülasyon ve enerji metabolizması olarak belirlenmiştir. Sonuç: İncelenen dozlarda metilparaben maruziyeti histon modifikasyonlarını değiştirmezken apoptoz ve oksidan hasara neden olmuş, translasyon, lipit, koagülasyon ve enerji metabolizması ile ilgili gen ifadelerini değiştirmiştir.

Özet (Çeviri)

Objective: The aim of our study is to investigate the adverse effects of methylparaben exposure at molecular, biochemical and epigenetic levels.Materials and methods: LC50 dose was determined, locomotor activity test, expression of genes associated with apoptosis and methylation was determined by RT-PCR method. Apoptotic cells were determined by acridine orange staining method and lipid accumulations were determined by oil red o staining. Vitellogenin was detected by in situ hybridization. Biochemical parameters were determined by spectrophotometric methods and changes in H3K27ac histone modification by chromatin immunoprecipitation (ChIP) method. RNA-seq was performed by NGS (next-generation sequencing) method and the BlueBee bioinformatics program was used for analysis. Gene ontology and gene cluster analysis of significantly changed genes were made on the DAVID bioinformatics website. Results: Methylparaben exposure caused pericardial edema, pigmentation and tail defects, decreased movements. Changes in gene expressions associated with apoptosis and methylation, apoptotic cells, lipid accumulation, vitellogenin expression, increased lipid peroxidation nitric oxide levels; decreased glutathione s-transferase activities were observed. Changes in H3K27ac histone modifications were not significant but expressions of 172 genes significantly changed related to translation, lipid metabolism, coagulation, and energy metabolism according to the gene clusters analysis. Conclusion: Methylparaben exposure caused apoptosis, oxidant damage, did not change histone modifications but changed gene expressions related to translation, lipid metabolism, coagulation, and energy metabolism.

Benzer Tezler

  1. Prostat kanseri olgularında kanser dokusu paraben düzeylerinin belirlenmesi

    Başlık çevirisi yok

    YUNUS YAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ÜrolojiPamukkale Üniversitesi

    Üroloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİNAN ÇELEN

  2. Kozmetik ürünlerinde paraben tayini için kemometrik optimizasyona dayalı yeni analitik yöntem

    New analytical method for the determination of paraben in cosmetic products based on chemometric optimization

    AYŞENUR ÖZTÜRK ALTUNAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    KimyaSivas Cumhuriyet Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ADİL ELİK

  3. Amprolyum hidroklorür, vitamin K3, metil paraben ve propil paraben'in HPLC yöntemiyle ayrılması ve tayini

    Seperation and analysis of Amprolium Hydrochloride, vitamin K3, methyl paraben and propyl paraben with HPLC method

    AKIN OSANMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    KimyaDüzce Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÜMİT ERGUN

  4. Bazı parabenlerin genotoksik etkilerinin in vivo ve in vitro şartlarda kısa süreli test teknikleri ile belirlenmesi

    The determination of the genotoxic effects various parabens with short term test methods in vivo and in vitro

    ARİF AYAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HANDAN UYSAL

  5. Feniramin maleat, potasyum gayakolsülfonat, efedrin HCI, sodyum sitrat ve katkı maddeleri içeren şurup örneğinin analizleri

    Analysis of syrup sample containing pheniramine maleate, potassium gayacolsulfonate, ephedrine HCI, sodium citrate and additives

    DENİZ AVCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    KimyaYıldız Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞULE DİNÇ ZOR

    PROF. DR. ÖZLEM AKSU DÖNMEZ