Molecular properties of crayfish potassium channels
Kerevit potasyum kanalları moleküler özellikleri
- Tez No: 654763
- Danışmanlar: PROF. DR. NUHAN PURALI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyofizik, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyofizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
İyon kanalı süper-ailesi içerisindeki en büyük aileyi Potasyum Kanalı ailesi oluşturmaktadır. Bu ailenin üyelerine bakterilerden en gelişmiş memelilere kadar tüm organizmalarda rastlanmaktadır. Potasyum kanalları, hücre büyümesinde, aksiyon potansiyelinin sonlandırılmasında, hücre şeklinin ve zar istirahat potansiyelinin belirlenmesinde önemli rollere sahiptir. Kerevit potasyum kanallarının varlığı yapılan fonksiyonel çalışmalar ile gösterilmiştir. Ancak, kerevit genomunun henüz tamamlanmamış olması nedeniyle Potasyum Kanallarının moleküler özelliklerine dair bilinenler sınırlıdır. Kerevitte Potasyum Kanallarını kodlayan genlerin tespit edilebilmesi için konvansiyonel klonlama teknikleri kullanılmıştır. Bu çalışma sonucunda Kerevit İçe Rektifiye (Kir) ve Kalsiyumla Aktive olan (KCa) Potasyum Kanalı genlerine ait sekanslar ortaya çıkarılmıştır. İlgili sekansların yakın türlere ait bilinen kanal genleri ile yüksek oranda benzerlik gösterdikleri ve Potasyum Kanalı ailesine has temel özellikleri taşıdıkları tespit edilmiştir. Tespit edilen genler uygun birer ifade vektörüne aktarılmıştır. Kerevit Kir Kanalı Xenopus yumurtalarında ifade ettirilerek, iki elektrotlu voltaj kıskacı tekniği ile içe yönelik potasyum akım kayıtları elde edilmiştir. Dizi analizi, üç boyutlu yapısal analiz ve heterelog ifade deneyleri sonucunda klonlanan genin içe rektifiye olan tipte bir potasyum kanalına ait olduğu sonucuna varılmıştır. Bu çalışmada elde edilen bulgular sonucunda kerevit genomunda birden fazla potasyum kanalı geninin mevcut olduğu ve bunların fonksiyonel olarak ifade edildiği ve de novo klonlanmış olan genlerin iki farklı tipte potasyum kanalını kodladığı anlaşılmaktadır.
Özet (Çeviri)
Potassium channel family is the largest group in the ion channel superfamily. Family members are reported in all organisms ranging from bacteria to higher mammals. Potassium channels have important roles in cell growth, termination of action potential and determination of cell shape and resting membrane potential. Presence of crayfish potassium channels has been documented in previous functional studies. However, as the genome of the crayfish is not complete yet, there is limited information about the molecular properties of potassium channels. To reveal potassium channel coding genes in the crayfish, conventional cloning methods have been employed. As a result of the present study, gene sequences have been revealed for an Inward Rectifier Potassium Channel (Kir) and a Calcium-activated (KCa) type of Potassium Channel. Gene sequences show strong similarity to known potassium channels from closely related species and they share characteristic features of the potassium channel family. Revealed genes have been cloned to appropriate expression vectors. Crayfish Kir channel has been expressed in Xenopus oocytes and inward currents have been recorded via two electrode voltage clamp. Compiled data indicates that in crayfish genome are present multiple Potassium Channel genes which have been functionally expressed. It was identified that the cloned genes are belonging to two different potassium channels.
Benzer Tezler
- Cloning and determination of tissue specific expression pattern of Astacus leptodactylus Na+/Ca 2+ exchanger gene
Astacus leptodactylus Na+/Ca 2+ karşı değiştirici geninin klonlanması ve doku spesifik ifade deseninin belirlenmesi
BORA ERGİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyofizikHacettepe ÜniversitesiBiyofizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NUHAN PURALI
- Mekanosensitif iyon kanalı adayı genlerin Astacus leptodactylus türünde klonlanması ve ilgili proteinlerin fonksiyonel ve yapısal özelliklerinin belirlenmesi
Cloning of candidate mechanosensitive ion channel genes and determining the functional and structural properties of the related proteins in Astacus leptodacylus
KAAN ARSLAN
- Kerevitte (astacus leptodactylus) varsayılan voltaj kapılı sodyum kanalı α alt birimi geninin klonlanması ve kanal proteininin moleküler özelliklerinin belirlenmesi
Cloning putative voltage gated sodium channel alpha subunit gene in the crayfish (astacus leptodactylus) and molecular characterization of the channel protein
ÇAĞIL COŞKUN
- Cloning putative voltage-gated calcium channel gene in Astacus Leptodactylus and determination of structural and functional properties of related protein
Astacus Leptodactylus türünde voltaj kapılı kalsiyum kanalına ait genlerinin klonlanması ve ilgili proteinlerin yapısal ve fonksiyonel özelliklerinin belirlenmesi
BERK SAĞLAM
- Farklı kabuklu su ürünleri atıklarından elde edilen kitosan biyopolimerinin karakterizasyonu yenilebilir film üretimi ve fizikokimyasal özellikleri
Extraction and characterization of chitosan biopolymer from different shellfish wastes and edible film production and physicochemical properties
ALİ ESLEM KADAK
Doktora
Türkçe
2017
Su ÜrünleriÇukurova ÜniversitesiSu Ürünleri Avlama ve İşleme Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYGÜL KÜÇÜKGÜLMEZ YANDIM