Cloning and determination of tissue specific expression pattern of Astacus leptodactylus Na+/Ca 2+ exchanger gene
Astacus leptodactylus Na+/Ca 2+ karşı değiştirici geninin klonlanması ve doku spesifik ifade deseninin belirlenmesi
- Tez No: 383181
- Danışmanlar: PROF. DR. NUHAN PURALI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Kerevit, Na+/Ca2+ karşı değiştirici, sinir sistemi, klonlama, kantitatif PCR, Crayfish, Na+/Ca2+ exchanger, nervous system, cloning, quantitative PCR
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyofizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
ERGİN, B., Astacus leptodactylus Na+ / Ca 2+ karşı değiştirici geninin klonlanması ve doku spesifik ifade deseninin belirlenmesi, Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyofizik Anabilim Dalı, Yüksek lisans tezi, Ankara, 2014. Sitozolik Ca2+ birçok hücresel fonksiyonda hayati rol oynar. Sitozolik Ca2+ derişimindeki değişiklikler, kas kasılması ve nörotransmitter salınımı gibi hücresel aktiviteler için önemlidir. İstirahat kalsiyum derişiminin idamesinden ve kalsiyum geçişlerinin gerçekleştirilmesinden bir takım kanallar ve karşı değiştiriciler sorumludur. Na+/Ca2+ karşı değiştirici, üzerine etkiyen net elektrokimyasal sürücü güç uyarınca Ca2+'u iki yönlü taşıyabilir. Na+/Ca2+ karşı değiştiricinin yapısı ve fonksiyonu hayvanlar âlemi içerisinde korunmuştur. Kerevitte Na+/Ca2+ karşı değiştirici varlığını işaret eden bazı fonksiyonel çalışmalar yakın zamanda gerçekleştirilmiştir. Buna rağmen, kerevit karşı değiştiricisinin genetik ve moleküler özelliklerine ilişkin bir rapor henüz mevcut değildir. Kerevit Na+/Ca2+ karşı değiştiricisi geninin özelliklerini açığa çıkarmak amacıyla, yakın türler arasında gözlenen benzerlikler göz önüne alınarak moleküler teknikler kullanılmıştır. Bu çalışmanın sonucunda, kerevit Na+/Ca2+ karşı değiştiricisinin kodlayan bölgesinin sekansının tamamı ortaya çıkarılmıştır. İlgili amino asit sekansı bilinen Na+/Ca2+ karşı değiştiricileri ile % 58 – 65 oranın benzerlik göstermekte ve karşı değiştirici protein ailesinin özelliklerini taşımaktadır. Kerevit Na+/Ca2+ karşı değiştirici geninin doku spesifik ifade deseni, karşı değiştiricinin sinir düğümü, kas ve antennal bez gibi uyarılabilen ya da biyolojik olarak aktif olan dokularda ifade edilirken etrafındaki sıvıyı pasif olarak filtreleyen solungaç gibi dokularda ifade edilmediğini göstermektedir. Devam edecek çalışmalarda bulunan genin yapı-fonksiyon ilişkisinin belirlenmesi amaçlanacaktır.
Özet (Çeviri)
ERGIN, B., Cloning and determination of tissue specific expression pattern of Astacus leptodactylus Na+ / Ca 2+ exchanger gene, Hacettepe University Faculty of Medicine, Department of Biophysics, Master Thesis, Ankara, 2014. Cytosolic Ca2+ plays an essential role in various cellular functions. Changes in cytosolic Ca2+ concentration is important for different cellular activities like muscle contraction and neurotransmitter release. A set of channels and exchangers are responsible for maintenance of resting calcium concentration and the generation of the calcium transient. Na+/Ca2+ exchanger can move Ca2+ in either direction depending on net electrochemical driving force acting on the exchanger. Structure and function of Na+/Ca2+ exchanger is conserved within the animal kingdom. In the crayfish there are some recent functional studies indicating the presence of Na+/Ca2+ exchanger. However, there is no report focusing onto genetic and molecular properties of the crayfish exchanger yet. To reveal properties of the crayfish Na+/Ca2+ exchanger gene, various molecular techniques have been employed by considering the homology observed among closely related species. As a result, the complete coding sequence of the putative crayfish Na+/Ca2+ exchanger gene has been revealed. Corresponding amino acid sequence has been found to be 58 – 65 % similar to known Na+/Ca2+ exchangers, sharing characteristics of the exchanger protein family. Tissue specific expression pattern of crayfish Na+/Ca2+ exchanger gene indicates that exchanger is expressed in excitable or biologically active tissues like ganglia, muscle and antennal gland while its expression is almost absent in gill which passively filters the neighboring fluid. Future efforts will be dedicated to define structure-function relationship of the discovered gene.
Benzer Tezler
- Recombinant production and characterization of aquaporin protein isolated from geobacillus thermoleovorans ARTR1 and virgibacillus sp. agtr strains
Vırgıbacıllus sp. agtr, geobacıllus thermoleovorans ARTR1 suşlarından izole edilen akuaporin proteininin rekombinant üretimi ve karakterizasyonu
ŞEVVAL UYSALCAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
DR. ÖĞR. ÜYESİ NACİYE ESRA ATEŞ GENCELİ
- Cloning and expressing analyses of arabidopsis CLAVATA2 and CRABSLAW gene homologs from Thermopsis turcica
Arabidopsis CLAVATA2 ve CRABSCLAW gen homologlarının T. turcica'dan klonlanması ve gen ifade analizleri
SULTAN DEMİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FERRUH AŞÇI
- Muskarinik reseptör alt tiplerinde İmperialin' in antagonistik etkisinin in vitro araştırılması
Antagonistic affinity profile of Imperialine on different subtypes of muscarinic receptors
HÜSEYİN AKBULUT
- Türkiye'de sert çekirdekli meyve ağaçlarındaki Prunus necrotic ringspot virüsü (PNRSV)'nün moleküler tekniklerle tanımı ve izolatlar arasındaki farlılıkların belirlenmesi
Molecular detection and determination of isolate variability for Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) of stonefruit trees in Turkey
MELİKE YURTMEN
- Pieris brassicae'den izole edilen serratia ficariabakterisine ait kitinaz proteinlerinin moleküler karakterizasyonu ve virulans etkisinin belirlenmesi
Molecular characteri̇zati̇on of chi̇ti̇nase protei̇ns of serratia ficaria bacteri̇a i̇solated from pieris brassicae and determi̇nati̇on of thei̇r vi̇rulence effects
MERVE ALMULA BAKIRDÖĞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiErzurum Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÖZDE BÜŞRA EROĞLU