Cloning and determination of tissue specific expression pattern of Astacus leptodactylus Na+/Ca 2+ exchanger gene
Astacus leptodactylus Na+/Ca 2+ karşı değiştirici geninin klonlanması ve doku spesifik ifade deseninin belirlenmesi
- Tez No: 383181
- Danışmanlar: PROF. DR. NUHAN PURALI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Kerevit, Na+/Ca2+ karşı değiştirici, sinir sistemi, klonlama, kantitatif PCR, Astacus leptodactylus, Kalsiyum, Sodyum, Crayfish, Na+/Ca2+ exchanger, nervous system, cloning, quantitative PCR, Astacus leptodactylus, Calcium, Sodium
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyofizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ERGİN, B., Astacus leptodactylus Na+ / Ca 2+ karşı değiştirici geninin klonlanması ve doku spesifik ifade deseninin belirlenmesi, Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyofizik Anabilim Dalı, Yüksek lisans tezi, Ankara, 2014. Sitozolik Ca2+ birçok hücresel fonksiyonda hayati rol oynar. Sitozolik Ca2+ derişimindeki değişiklikler, kas kasılması ve nörotransmitter salınımı gibi hücresel aktiviteler için önemlidir. İstirahat kalsiyum derişiminin idamesinden ve kalsiyum geçişlerinin gerçekleştirilmesinden bir takım kanallar ve karşı değiştiriciler sorumludur. Na+/Ca2+ karşı değiştirici, üzerine etkiyen net elektrokimyasal sürücü güç uyarınca Ca2+'u iki yönlü taşıyabilir. Na+/Ca2+ karşı değiştiricinin yapısı ve fonksiyonu hayvanlar âlemi içerisinde korunmuştur. Kerevitte Na+/Ca2+ karşı değiştirici varlığını işaret eden bazı fonksiyonel çalışmalar yakın zamanda gerçekleştirilmiştir. Buna rağmen, kerevit karşı değiştiricisinin genetik ve moleküler özelliklerine ilişkin bir rapor henüz mevcut değildir. Kerevit Na+/Ca2+ karşı değiştiricisi geninin özelliklerini açığa çıkarmak amacıyla, yakın türler arasında gözlenen benzerlikler göz önüne alınarak moleküler teknikler kullanılmıştır. Bu çalışmanın sonucunda, kerevit Na+/Ca2+ karşı değiştiricisinin kodlayan bölgesinin sekansının tamamı ortaya çıkarılmıştır. İlgili amino asit sekansı bilinen Na+/Ca2+ karşı değiştiricileri ile % 58 – 65 oranın benzerlik göstermekte ve karşı değiştirici protein ailesinin özelliklerini taşımaktadır. Kerevit Na+/Ca2+ karşı değiştirici geninin doku spesifik ifade deseni, karşı değiştiricinin sinir düğümü, kas ve antennal bez gibi uyarılabilen ya da biyolojik olarak aktif olan dokularda ifade edilirken etrafındaki sıvıyı pasif olarak filtreleyen solungaç gibi dokularda ifade edilmediğini göstermektedir. Devam edecek çalışmalarda bulunan genin yapı-fonksiyon ilişkisinin belirlenmesi amaçlanacaktır.
Özet (Çeviri)
ERGIN, B., Cloning and determination of tissue specific expression pattern of Astacus leptodactylus Na+ / Ca 2+ exchanger gene, Hacettepe University Faculty of Medicine, Department of Biophysics, Master Thesis, Ankara, 2014. Cytosolic Ca2+ plays an essential role in various cellular functions. Changes in cytosolic Ca2+ concentration is important for different cellular activities like muscle contraction and neurotransmitter release. A set of channels and exchangers are responsible for maintenance of resting calcium concentration and the generation of the calcium transient. Na+/Ca2+ exchanger can move Ca2+ in either direction depending on net electrochemical driving force acting on the exchanger. Structure and function of Na+/Ca2+ exchanger is conserved within the animal kingdom. In the crayfish there are some recent functional studies indicating the presence of Na+/Ca2+ exchanger. However, there is no report focusing onto genetic and molecular properties of the crayfish exchanger yet. To reveal properties of the crayfish Na+/Ca2+ exchanger gene, various molecular techniques have been employed by considering the homology observed among closely related species. As a result, the complete coding sequence of the putative crayfish Na+/Ca2+ exchanger gene has been revealed. Corresponding amino acid sequence has been found to be 58 – 65 % similar to known Na+/Ca2+ exchangers, sharing characteristics of the exchanger protein family. Tissue specific expression pattern of crayfish Na+/Ca2+ exchanger gene indicates that exchanger is expressed in excitable or biologically active tissues like ganglia, muscle and antennal gland while its expression is almost absent in gill which passively filters the neighboring fluid. Future efforts will be dedicated to define structure-function relationship of the discovered gene.
Benzer Tezler
- Recombinant production and characterization of aquaporin protein isolated from geobacillus thermoleovorans ARTR1 and virgibacillus sp. agtr strains
Vırgıbacıllus sp. agtr, geobacıllus thermoleovorans ARTR1 suşlarından izole edilen akuaporin proteininin rekombinant üretimi ve karakterizasyonu
ŞEVVAL UYSALCAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
DR. ÖĞR. ÜYESİ NACİYE ESRA ATEŞ GENCELİ
- Akciğer kanserine karşı DNA aşısının geliştirilmesi ve fareler üzerinde tümöre karşı tedavi edici etkisinin belirlenmesi
Development of DNA vaccine against lung cancer and determination of therapeutic effects against tumor in mice
EZGİ DAĞ TAŞKESENLİGİL
Doktora
Türkçe
2025
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YAĞMUR ÜNVER
- Hücre kültürü pasajlarının PPR virus P geni düzeyinde etkisinin araştırılması ve tanısal amaçlı gerçek zamanlı reverz transkritaz polimeraz zincir reaksiyonu (rtRT ? PCR) protokollerinin geliştirilmesi
The investigation of the effects of cell culture passages on the PPR virus P gene and development of realtime reverse transcriptase polymerase chain reaction (rtRT ? PCR) methods for diagnostic purposes
ENDER DİNÇER
- Şırnak-Üçkardeşler asfaltit filonunun gaz içeriği ve kendiliğinden yanma özelliklerinin araştırılması
Investigation of gas content and spontaneous combustion characteristics of Şirnak-Üçkardeşler asphaltite vein
ANIL SOYLU
Doktora
Türkçe
2024
Maden Mühendisliği ve Madencilikİstanbul Teknik ÜniversitesiMaden Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDULLAH FİŞNE
- Sigortada dağıtım ve tutundurma metodları
Başlık çevirisi yok
BANU GÖNENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
1994
SigortacılıkMarmara ÜniversitesiSigortacılık Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN GÜRBÜZ