İndolamin 2, 3 dioksijenaz (IDO) gen polimorfizminin covid-19 ve kliniği üzerine etkisi
Effect of indoleamine 2, 3 dioxygenase (IDO) gene polymorphism on covid-19 and clinic
- Tez No: 657707
- Danışmanlar: PROF. DR. HALUK BARBAROS ORAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Allerji ve İmmünoloji, Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Allergy and Immunology, Microbiology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İmmünoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Pandemi olarak ilan edilmiş, küresel bir sorun teşkil eden COVID-19 hastalığına, koronavirüs ailesinden SARS-CoV-2 virüsü ile enfeksiyonun neden olduğu bilinmektedir. İnsan bağışıklık sisteminin bu virüse karşı verdiği tepkiler halen anlaşılmaya çalışılmaktadır. Bu araştırmada önemli bir immünmodülatör olan IDO (indoleamine 2-3-dioxygenase)'nun COVID-19 üzerindeki etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamızın tasarlanmasında, SARS-CoV virüsünün özellikleri ve COVID-19'un klinik tablosu ile IDO'nun özellikleri ve diğer viral enfeksiyonlar ile ilişkileri göz önünde bulundurulmuştur. IDO gen bölgelerinde görülen polimorfizmlerin inflamatuvar epizodlarda etkili olduğu da bilinmektedir. Bu doğrultuda, IDO-1 ve IDO-2 için belirlenen iki ayrı IDO SNP gen bölgelesinde, 40 hasta için melting curve analizi ile tek nükleotid polimorfizm (SNP) tespiti yapılmıştır. Ek olarak serum örneklerinde ELISA yöntemiyle Th1, Th2, Th17 ilişkili bazı sitokin ve IDO-1 konsantrasyonları saptanarak, sitokinlerin IDO-1 seviyeleri ile korelasyonları incelenmiştir. Yapmış olduğumuz tek nükleotid polimorfizm çalışmamızın sonucunda; IDO-1 rs7820268 SNP bölgesinin COVID-19 hastalığına yatkınlıkla ilişkili olduğu sonucu elde edilmiştir. Bu SNP bölgesi için elde edilen sonuçlar üzerine yapmış olduğumuz analizler sonucunda, yatkınlık dışında, patogenez ile bir ilişki saptanamamıştır. IDO-2 için incelenen rs4503083 SNP bölgesinde ise hasta ve sağlıklı kontrol grubu ile anlamlı farklılık tespit edilmemiştir. ELISA sonuçlarımız da ise; IL-6 ve TNF-α ile IDO-1 arasında negatif yönlü korelasyonlar saptanmıştır. Önemli olarak, SARS-CoV-2 virüsünün diğer viral enfeksiyonların aksine IDO-1'i baskıladığı tespit edilmiştir. Yoğun bakım hastalarında, asemptomatik hastalardan daha düşük seviyelerde IDO-1 konsantrasyonu görülmüştür. Tez çalışma sonuçlarımız IDO'yu COVID-19 prognozu için terapötik hedef olarak önermektedir.
Özet (Çeviri)
The virus that causes COVID-19 disease is the SARS-CoV-2 virus from the coronavirus family, and people infected with this virus have the disease. This disease is a global problem and has been reported as a pandemic.The reaction of the human immune system to the COVID-19 virus is not well understood yet. In this study, it was aimed to reveal the importance of IDO (indoleamine 2-3-dioxygenase), which is an important immunomodulator, on the virus. In the design of our the study, the clinical course of COVID-19 and the characteristics of the SARS-CoV virus and the connection between IDO and other viral infections should be considered. The effect of polymorphisms in IDO gene regions on inflammatory conditions is also known. Considering these important issues, single nucleotide polymorphism (SNP) was analyzed with melting curve analysis in two different IDO SNP gene regions determined for IDO-1 and IDO-2 for 40 patients. Relationships between Th1, Th2, Th17-related cytokines and IDO-1 concentrations and IDO-1 levels of cytokines were investigated in serum samples by ELISA. As a result of the single nucleotide polymorphism study; The IDO-1 rs7820268 SNP region was determined to be associated with susceptibility to COVID-19 disease. In the analysis of the results obtained on the SNP region, it was found that there was a predisposition, but that there was not a relationship with pathogenesis. The rs4503083 SNP region was examined for IDO-2, no significant difference was found between the patient and healthy control groups. According to the ELISA results, it was observed that there was a negative correlation between IL-6 and TNF-α, and IDO-1. The important issue found in the study was that the SARS-CoV-2 virus suppressed IDO-1 unlike other viral infections. The IDO-1 levels were found to be lower in intensive care patients compared to asymptomatic patients. According to the results of the study, IDO can be recommended as a complementary marker for the diagnosis of COVID-19. Also, it may be therapeutic target for the treatment of the disease.
Benzer Tezler
- İndolamin 2, 3 dioksijenaz gen polimorfizminin behçet hastalığı ve kliniği üzerine etkisi
The effect of indolamnine 2, 3 dioxygenase gene polymorphism on behçet's diesase and clinical findings
ÜLKÜ UÇAR
Doktora
Türkçe
2022
Allerji ve İmmünolojiBursa Uludağ Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK BARBAROS ORAL
- Mesane kanserli olgularda indoleamin 2,3-dioksijenaz 1 (IDO-1) enzim aktivitesi ile RS10089084 gen polimorfizminin ilişkisi
The relationship of indoleamine 2,3-DİOXY-genase 1 (İDO-1) enzyme activity and RS10089084 gene polymophism in patients with bladder cancer
KEMAL KAYAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Moleküler TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. LEVENT VERİM
- Fare lokal artrit modelinde yangı sırasında indüklenebilen indolamin-2,3 dioksijenaz (İDO) gen aktarımının etkisi
The effect of inducible indolamine-2,3 dioxygenase (İDO) gene transfer during inflammation in local mouse arthritis model
AYŞE ÖZDEN SOYDAŞ
Doktora
Türkçe
2018
Allerji ve İmmünolojiGazi Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VEDAT BULUT
- İnsan indolamin -2,3-dioksijenaz (İDO) geninin ELAM-1 promotoru kontrolünde klonlanması ve ekspresyonu
Clonning and expression of human indolamine -2,3-dioxygenase gene under the control of the ELAM-1 promotor
MEHMET KARAÇAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Allerji ve İmmünolojiUludağ ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FİGEN ERSOY
PROF. DR. HALUK BARBAROS ORAL
- Bipolar 1 bozukluk hastalarında indolamin 2,3 dioksijenaz enzim ekspresyonu ve kinürenin yolağı metabolitlerinin incelenmesi
Investigation of indoleamine 2,3 dioxygenase enzyme expression and kynurenine pathway metabolites in patients with bipolar 1 disorder
BEKTAŞ ÖNAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
PsikiyatriSüleyman Demirel ÜniversitesiRuh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLİN ÖZDAMAR ÜNAL