Arabidopsis thaliana'nın endoplazmik retikulum stresine verdiği yanıtta cle peptidlerinin rolünün araştırılması
An investigation on the role of cle peptides in response to endoplasmic reticulum stress in Arabidopsis thaliana
- Tez No: 664703
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL TÜRKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Botanik, Botany
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genel Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
Hücresel salgı proteinleri ve membran proteinleri granüllü endoplazmik retikulumda (GER) sentezlenmektedir. GER'da sentezlenen salgı proteinleri, endoplazmik retikulum (ER) lümeninde katlanmakta ve posttranslasyonel modifikasyonlara uğramaktadır. Yüksek sıcaklık, tuz stresi gibi abiyotik stresler ER'de yanlış katlanmış veya katlanmamış proteinleri arttırarak ER stresine neden olmaktadır. ER stresi katlanmamış protein yanıtını uyararak hücrenin protein katlama kapasitesini arttırmaktadır. Salgı peptidleri olan CLE peptidleri de ER'de katlanmakta, modifikasyonlara uğramakta ve son hallerini burada almaktadır. CLE peptidleri bitki büyüme ve gelişminde işlev görmektedir. Bu peptidlerin kök ve sürgün apikal meristem homeostazının koruması, vasküler gelişim ve stoma hareketlerinin düzenlenmesi gibi birçok rolü olduğu bilinmektedir. Fakat Arabidopsis thaliana'nın endoplazmik retikulum stresine verdiği yanıtlarda CLE peptidlerinin rolü hakkında literatürde hiçbir çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmada çeşitli konsantrasyonlarda tunikamisin ajanı uygulanarak ER stresi uyarılan A.thaliana bitkisinde CLE peptidlerinin rolleri araştırılmıştır. Sonuçlara göre CLV3, CLE4, CLE10, CLE21, CLE22, CLE27, CLE41, CLE44, CLE45, BAM3, CLE2, CLE5, CLE6, CLE40 genlerinin ER stresiyle ilişkili olduğu tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Cellular secretory proteins and membrane proteins are synthesized in the rough endoplasmic reticulum (ER) to undergo posttranslational modifications. Abiotic stresses such as high temperature and salt stress cause ER stress by increasing the misfolded or unfolded proteins in the ER. ER stress induce the unfolded protein response by increasing the protein folding capacity of the cell. CLE peptides are secretory peptides and has function in plant growth and development. They are fold in ER, and undergo modifications to gain their final form here. These peptides are known to have many roles such as the maintenance of root and shoot apical meristem homeostasis, vascular development and regulation of stomatal movements. There is no research in the literature on the role of CLE peptides in Arabidopsis thaliana's response to endoplasmic reticulum stress. In here, we investigated the roles of CLE peptides on the ER stress in A. thaliana by using different concentrations of ER stress inducer compund Tunicamycin. According to the results CLV3, CLE4, CLE10, CLE21, CLE22, CLE27, CLE41, CLE44, CLE45, BAM3, CLE2, CLE5, CLE6, CLE40 genes were found that are related with ER stress.
Benzer Tezler
- Arabidopsis thaliana'da endoplazmik retikulum (ER)-faji'nin hücre redoksu ile ilişkisinin araştırılması
An investigation on the relation between ER-phagyand cell redox in Arabidopsis thaliana
FERİT ALTUNDAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiEge ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ RENGİN ÖZGÜR UZİLDAY
- Glikofit Arabidopsis thaliana ve halofit Schrenkiella parvula bitkilerinin er stresine yanıtının karşılaştırılması
Comparison of er stress response in glycophyte Arabidopsis thaliana and halophyte Schrenkiella parvula plants
HATİCE EKİN
- GTP bağlayıcı proteinlerden ARF1 ve SAR1'in Medicago truncatula bitki türünde incelenmesi
Investigation of GTP binding proteins ARF1 and SAR1 in Medicago truncatula
ESRA YÜCA
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
BiyolojiYıldız Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ABDÜLREZZAK MEMON
PROF.DR. NEZHUN GÖREN
- Vitamin B6'nın tuz stresine maruz bırakılan arabidopsis mutantı (pdx1.3) üzerindeki fizyolojik ve biyokimyasal etkilerinin araştırılması
Investigation on the biochemical and physiological effects of vitamin B6 on arabidopsis mutant (pdx1.3) under salt stress
MERVE SARAY
- Mathematical modelling of arabidopsis flowering time gene regulatory network
Arabidopsis çiçeklenme zamanı gen düzenleyici ağının matematiksel modellenmesi
EMRAH HASPOLAT
Doktora
İngilizce
2018
BiyoistatistikUniversity of Northumbria at NewcastleMatematik Ana Bilim Dalı
DR. BENOIT HUARD
PROF. DR. MAIA ANGELOVA