Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen enterobacteriaceae izolatlarında plazmid aracılı kolistin direncinin moleküler yöntemler ile araştırılması

Investigation of plasmid mediated colistin resistance by molecular methods in enterobacteriaceae isolates isolated from clinical samples

PDF İndir

  1. Tez No: 665398
  2. Yazar: TOLGA TOROL
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MAHMUT ÜLGER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Pharmacy and Pharmacology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 57

Özet

Antimikrobiyal direnç 21. Yüzyılda insan sağlığına yönelik en ciddi tehditlerden biridir. Polimiksin B ve polimiksin E (kolistin), genellikle birçok ilaca dirençli Gram negatif basiller, karbapenem dirençli Enterobacteriaceae'nin neden olduğu enfeksiyonlar için son çare tedavi seçeneği olarak kabul edilmektedir. 2015'in sonlarında, Çinli araştırmacılar ilk plazmid aracılı kolistin direnç geni olan“mobile colistin resistance”(mcr)-1'i rapor etmişlerdir ve o zamandan beri diğer kıtalarda da bu genin Enterobacteriaceae ailesi üyelerindeki varlığı bildirilmiştir. Kromozomal mutasyonlara kıyasla plazmid kökenli direncin daha hızlı yayılabilmesi ve artan kolistin direnç oranı nedeniyle bu konu büyük önem kazanmıştır. Bu çalışmanın amacı, kolistin direnci saptanan klinik izolatlarda, direncin belirlenmesinde referans yöntem olarak kabul edilen sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile, kolistin direncin doğrulanmasının yapılması ve ayrıca kolistin direncine sebep olan mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 ve mcr-5 genlerinin varlığının Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) yöntemi ile araştırılmasıdır. Çalışmaya dahil edilen 67 hastanın 38 (%56,72)'i erkek, 29 (%43,28)'u kadındı ve yaş ortalamaları 52,95 idi (minimum: 1, maksimum: 91). Klinik materyallerin kültür dağılımına baktığımızda en çok yara (15, %22,39), trakeal aspirat (14, %20,90) ve kan (13, %19,40) kültürlerinin çalışıldığı belirlendi. Çalışmaya 37 (%55,22) adet K. pneumoniae, 28 (%41,79) adet E. coli ve 2 (%2,99) adet E. cloacae klinik izolatı dahil edildi. Klinik izolatların referans yöntem ile kolistin MİK sonuçlarının >64-8 arasında değişen oranlarda olduğu belirlendi. İzolatların hiç birinde plazmid aracılı kolistin direncine sebep olan mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 ve mcr-5 gen bölgelerinin varlığı PZR yöntemi ile gösterilemedi. Sonuç olarak, çalışmamıza dahil edilen klinik izolatların hiç birinde mcr gen bölgesine rastlanılmamıştır. Kolistinin özellikle karbapeneme dirençli Gram negatif bakterilerin enfeksiyonlarının tedavisinde son seçenek olarak kullanılması, direnç yayılım mekanizmasının anlaşılmasının ve dirençli izolatlarla ilgili sürveyans çalışmalarının yürütülmesini oldukça önemli hale getirmiştir.

Özet (Çeviri)

Antimicrobial resistance is one of the most serious threats to human health in the 21st century. Polymyxin B and polymyxin E (colistin) are generally accepted as a last-resort treatment option for multi drug-resistant Gram-negative bacilli and infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. In late 2015, Chinese researchers reported the first plasmid mediated colistin resistance gene,“mobile colistin resistance”(mcr)-1 and since then, the presence of this gene in members of the Enterobacteriaceae family has been reported in other continents. This issue has gained great importance due to the rapid spread of plasmid-based resistance compared to chromosomal mutations and the increasing rate of colistin resistance. The aim of this study is to verify the colistin resistance by liquid microdilution method, which is accepted as a reference method for determining the resistance, in colistin resistance clinical isolates and also is to investigate the presence of mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 and mcr-5 genes that cause colistin resistance, by Polymerase Chain Reaction (PCR) method. Of the 67 patients included in the study, 38 (56.72%) were male, 29 (43.28%) were female, and their mean age was 52.95 (minimum: 1, maximum: 91). When we look at the culture distribution of the clinical materials, it was determined that wound (15, 22.39%), tracheal aspirate (14, 20.90%) and blood (13, 19.40%) cultures were the most common studied cultures. 37 (55.22%) K. pneumoniae, 28 (41.79%) E. coli and 2 (2.99%) E. cloacae clinical isolates were included in the study. It was determined that colistin MIC results of the clinical isolates varied between >64-8 with reference method. The presence of mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 and mcr-5 gene regions that cause plasmid mediated colistin resistance could not be demonstrated by PCR method in any of the isolates. As a result, no mcr gene was found in the clinical isolates included in our study. The use of colistin as a last option in the treatment of infections of Gram-negative bacteria resistant to carbapenem has made it very important to understand the mechanism of resistance spread and to conduct surveillance studies on resistant isolates.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    652378

    Sefoksitin Dirençli ya da Az Duyarlı Saptanan Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli ve Proteus mirabilis Suşlarındaki Plazmid Aracılı AmpC Beta Laktamaz Enzim Tiplerinin PCR Yöntemi ve Dizi Analizi ile Araştırılması

    Detection of Plasmid-Borne AmpC Beta Lactamase Enzyme Types in Cefoxitin Resistant or Intermediate Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli and Proteus mirabilis Isolates by using Multiplex PCR and Sequencing

    HADİYE DEMİRBAKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MERAL DİLARA ÖĞÜNÇ

  2. Tez No

    753670

    İdrar yolu enfeksiyonlarından izole edilen Enterobacteriaceae'lerde antibiyotik direnç genlerinin moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of antibiotic resistance genes in Enterobacteriaceae isolated from urinary tract infections (UTI)

    HUSAM MAHDI SALEH ALSHABBANI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELİF SEVİM

  3. Tez No

    379224

    Kan kültürlerinden izole edilmiş kinolon dirençli escherichia coli ve klebsiella spp. izolatlarında plazmid aracılı kinolon direncinin araştırılması

    Investigation of plasmid-mediated quinolone resistance among quinolone-resistant isolates of escherichia coli and klebsiella spp. isolated from blood cultures

    HİKMET ÖZTEL OCAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FARUK AYDIN

  4. Tez No

    817591

    Klinik Enterobacteriaceae izolatlarında fosfomisin direncinin moleküler epidemiyolojisi ve biyolojik özelliklere etkisi

    Molecular epidemiology of fosfomycin resistance and effect on biological properties in clinical Enterobacteriaceae isolates

    MUSTAFA ÖKEER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAYRI ERAÇ

  5. Tez No

    351236

    Enterobacteriaceae klinik izolatlarında karbapenemaz varlığının fenotipik yöntemlerle araştırılması

    Exploration of carbapenemase presence via phenotypic methods in clinical enterobacteriaceae isolates

    EMRAH AYDIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ABDURRAHMAN KİREMİTÇİ

Geri Dön