Klinik örneklerden izole edilen enterobacteriaceae izolatlarında plazmid aracılı kolistin direncinin moleküler yöntemler ile araştırılması
Investigation of plasmid mediated colistin resistance by molecular methods in enterobacteriaceae isolates isolated from clinical samples
- Tez No: 665398
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MAHMUT ÜLGER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Enterobacteriaceae, Enterobacteriaceae enfeksiyonları, Kolistin, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, İlaçlara direnç, İndikatör dilüsyon teknikleri, Enterobacteriaceae, Enterobacteriaceae infections, Colistin, Polymerase chain reaction, Drug resistance, Indicator dilution techniques
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Antimikrobiyal direnç 21. Yüzyılda insan sağlığına yönelik en ciddi tehditlerden biridir. Polimiksin B ve polimiksin E (kolistin), genellikle birçok ilaca dirençli Gram negatif basiller, karbapenem dirençli Enterobacteriaceae'nin neden olduğu enfeksiyonlar için son çare tedavi seçeneği olarak kabul edilmektedir. 2015'in sonlarında, Çinli araştırmacılar ilk plazmid aracılı kolistin direnç geni olan“mobile colistin resistance”(mcr)-1'i rapor etmişlerdir ve o zamandan beri diğer kıtalarda da bu genin Enterobacteriaceae ailesi üyelerindeki varlığı bildirilmiştir. Kromozomal mutasyonlara kıyasla plazmid kökenli direncin daha hızlı yayılabilmesi ve artan kolistin direnç oranı nedeniyle bu konu büyük önem kazanmıştır. Bu çalışmanın amacı, kolistin direnci saptanan klinik izolatlarda, direncin belirlenmesinde referans yöntem olarak kabul edilen sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile, kolistin direncin doğrulanmasının yapılması ve ayrıca kolistin direncine sebep olan mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 ve mcr-5 genlerinin varlığının Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) yöntemi ile araştırılmasıdır. Çalışmaya dahil edilen 67 hastanın 38 (%56,72)'i erkek, 29 (%43,28)'u kadındı ve yaş ortalamaları 52,95 idi (minimum: 1, maksimum: 91). Klinik materyallerin kültür dağılımına baktığımızda en çok yara (15, %22,39), trakeal aspirat (14, %20,90) ve kan (13, %19,40) kültürlerinin çalışıldığı belirlendi. Çalışmaya 37 (%55,22) adet K. pneumoniae, 28 (%41,79) adet E. coli ve 2 (%2,99) adet E. cloacae klinik izolatı dahil edildi. Klinik izolatların referans yöntem ile kolistin MİK sonuçlarının >64-8 arasında değişen oranlarda olduğu belirlendi. İzolatların hiç birinde plazmid aracılı kolistin direncine sebep olan mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 ve mcr-5 gen bölgelerinin varlığı PZR yöntemi ile gösterilemedi. Sonuç olarak, çalışmamıza dahil edilen klinik izolatların hiç birinde mcr gen bölgesine rastlanılmamıştır. Kolistinin özellikle karbapeneme dirençli Gram negatif bakterilerin enfeksiyonlarının tedavisinde son seçenek olarak kullanılması, direnç yayılım mekanizmasının anlaşılmasının ve dirençli izolatlarla ilgili sürveyans çalışmalarının yürütülmesini oldukça önemli hale getirmiştir.
Özet (Çeviri)
Antimicrobial resistance is one of the most serious threats to human health in the 21st century. Polymyxin B and polymyxin E (colistin) are generally accepted as a last-resort treatment option for multi drug-resistant Gram-negative bacilli and infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. In late 2015, Chinese researchers reported the first plasmid mediated colistin resistance gene,“mobile colistin resistance”(mcr)-1 and since then, the presence of this gene in members of the Enterobacteriaceae family has been reported in other continents. This issue has gained great importance due to the rapid spread of plasmid-based resistance compared to chromosomal mutations and the increasing rate of colistin resistance. The aim of this study is to verify the colistin resistance by liquid microdilution method, which is accepted as a reference method for determining the resistance, in colistin resistance clinical isolates and also is to investigate the presence of mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 and mcr-5 genes that cause colistin resistance, by Polymerase Chain Reaction (PCR) method. Of the 67 patients included in the study, 38 (56.72%) were male, 29 (43.28%) were female, and their mean age was 52.95 (minimum: 1, maximum: 91). When we look at the culture distribution of the clinical materials, it was determined that wound (15, 22.39%), tracheal aspirate (14, 20.90%) and blood (13, 19.40%) cultures were the most common studied cultures. 37 (55.22%) K. pneumoniae, 28 (41.79%) E. coli and 2 (2.99%) E. cloacae clinical isolates were included in the study. It was determined that colistin MIC results of the clinical isolates varied between >64-8 with reference method. The presence of mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 and mcr-5 gene regions that cause plasmid mediated colistin resistance could not be demonstrated by PCR method in any of the isolates. As a result, no mcr gene was found in the clinical isolates included in our study. The use of colistin as a last option in the treatment of infections of Gram-negative bacteria resistant to carbapenem has made it very important to understand the mechanism of resistance spread and to conduct surveillance studies on resistant isolates.
Benzer Tezler
- Doğuştan kalça çıkıklı hastalarda kalça patolojilerinin bilgisayarlı tomografi ile değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
NECDET ŞÜKRÜ ALTUN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Ortopedi ve TravmatolojiGazi ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ORHAN ASLANOĞLU
- Türkiye'de serebral hareket bozukluklarının etiyolojisi epidemiyolojisi ve bazı klinik özellikleri
Başlık çevirisi yok
AŞER BENSUSAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1986
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Pre-eklampsi ve eklampsi vakalarında immünoglobülin düzeylerinin değerlendirilmesi (Klinik ve immünobiolojik araştırma)
Examination des valeurs d'immunoglobulines en cas de la toxemie gravidique
M. MURAT SEMİZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MÜLAZIM YILDIRIM
- Çocuklarda akut stres hiperglisemisinde hormonal değişikliklerin ve kısa süreli prognozun incelenmesi
Başlık çevirisi yok
AYGÜN DİNDAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Hemşireliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜLYA GÜNÖZ