Homogeneous time resolved fluorescence assay with candida auris BDF1 for inhibitor screening
Inhibitör taraması için candida auris BDF1 ile homojen zaman çözümlü floresans deneyi
- Tez No: 670631
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEYNEP KANLIDERE, DR. DİMİTRİOS SKOUFİAS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
Yeni ortaya çıkan bir Candida türü olan Candida auris, sebep olduğu hastane içi salgınlar ve bağışıklık sistemi zayıflamış hastalarda yüksek ölüm oranı nedeniyle sağlık uzmanlarını alarma geçirdi. Candida auris, günümüzde bilinen tüm antifungal ilaç sınıflarına dirençlidir. Bu çalışma, bir DNA modülatörü olan bromodomain içeren protein Bdf1'i hedefleyen yeni bir epigenetik stratejiye dayanmaktadır. Çalışmanın temel amacı bu proteine karşı bileşiklerin bulunması için yüksek verimli taramaya gerekli araçları geliştirmektir. Bu hedef doğrultusunda, C. auris varsayılan Bdf1 bromodomainleri spesifik olarak ifade edildi, saflaştırıldı ve homojen zamanla çözümlenmiş floresan deneyleri için optimize edildi. Ek olarak testte kullanılacak asetil ve butiril içeren modifiye histon kuyruk peptidleri sentezlendi. Elde edilen sonuçlar, C. auris bromodomainlerine karşı inhibitörlerin bulunması için hazırlanan reaktiflerin yüksek verimli tarama ile kullanılabileceğini göstermiştir. Bir ön çalışma olarak, C. glabrata Bdf1 inhibitörü olan 409 isimli bileşiğin etkisi test edildi. C. auris Bdf1'in yalnızca bir bromodomaininin 409 bileşiğine duyarlı olduğu görüldü. Bu çalışma ile ayrıca, asetil dışındaki translasyon sonrası modifikasyonlara bromodomain afinitesi, ilk kez mantar türleri üzerinde değerlendirilecek ve ilerideki in vitro ve in vivo deneylerde mantarlara karşı daha spesifik bileşiklerin seçilmesine yardımcı olacaktır.
Özet (Çeviri)
Candida auris, a newly emerging Candida species, has put the healthcare professionals on alert because of the endonosocomial outbreaks it causes and its high mortality rate with immune compromised patients. To date, Candida auris is resistant to all known classes of available antifungal drugs. This work is based on a novel epigenetic strategy targeting Candida auris Bdf1 bromodomain containing protein, a DNA modulator protein and has its main goal to develop the necessary tools for high throughput screening of compounds against it. In that goal C. auris putative Bdf1 bromodomains were specifically expressed, purified and optimized for homogeneous time resolved fluorescence assays. Additionally modified histone tail peptides bearing acetyl and butyryl to be used in the assay were synthesized. The results have shown that the reagents prepared can be used for high throughput screening of inhibitors against C. auris bromodomains. As a preliminary study C. glabrata Bdf1 inhibitor compound 409 was tested. Only one bromodomain of C. auris Bdf1 seemed sensitive to compound 409. Furthermore bromodomain affinity to post-translational modifications other than acetyl will be monitored for fungal species for the first time that will help select more specific antifungal compounds to be assessed for later in vitro and in vivo assays.
Benzer Tezler
- White-emitting conjugated polymer nanoparticles:Tuning emission via förster resonance energy transfer in nanostructures assembled through click reactions
Beyaz ışıma yapan konjuge polimer nanoparçacıkları: Çıtçıt tepkimeleriyle oluşturulan nanoyapıların ışımalarının förster rezonans enerji transferi ile ayarlanması
HAMİDOU KEİTA
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Kimyaİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DÖNÜŞ TUNCEL
- NMR imaging of curing of alkyds and moisture transport through coatings on wood
Başlık çevirisi yok
ÖZLEM GEZİCİ KOÇ
- Investigation of pyrrole end capped polytetrahydrofuran graft copolymers via mass spectrometry
Pirol uçlu sonlandırılmış politetrahidrofuran aşı kopolimerlerinin kütle spektrometre tekniği ile karakterizasyonu
CEREN ÖZDİLEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2001
KimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEVENT KAMİL TOPPARE
- Türkiye Cumhuriyeti'nin azınlık politikası kapsamında Türk Musevi Cemaati'nin durumu ve faaliyetleri
The situation and activities of the Turkish Jewish Society under the minority policy of the Turkish Republic
ELİF KANDÖKER
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
SosyolojiAnkara Hacı Bayram Veli ÜniversitesiTarih Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İHSAN ŞERİF KAYMAZ
- Öğretmenlerin örgütsel sosyalleşmelerinin okul yöneticilerinin liderlik tarzlarına ilişkin algılarına göre incelenmesi:Özel eğitim öğretmenleri örneği
Organizational leadership style of teachers regarding their perception of social according to school administrators review: Special education teachers sample
İSENBİKE GÜNİZ ÇALIŞKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Eğitim ve ÖğretimMaltepe ÜniversitesiEğitim Bilimleri Bölümü
YRD. DOÇ. DR. AYNUR EREN GÜMÜŞ