Türkiye'de yayılış gösteren Carum L. (Apiaceae) cinsine ait türlerin ıts, trnL-F, trnL intron ve rbcL sekans dizilerine dayalı filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of the species belonging to the genus Carum L. (Apiaceae) growing in Turkey based on its, trnL-F, trnL intron and rbcL sequences
- Tez No: 670868
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EMRE SEVİNDİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 127
Özet
Bu çalışma ile Türkiye de yayılış gösteren Carum L. cinsine ait türlerin çekirdek (nrDNA) ITS ve kloroplast (cpDNA) trnL-F, trnL intron ve rbcL bölgelerinin moleküler sistematik analizi yapılarak nükleotid kompozisyon oranları ve türler arası genetik uzaklık değerleri belirlenmiş ve filogenetik ilişkileri değerlendirilmiştir. Çalışma sonucunda ITS (A + T) içeriği %47,4, (G + C) içeriği %52,5; trnL-F (A + T) içeriği %64,2, (G + C) içeriği %35,7; trnL intron (A + T) içeriği %64,3, (G + C) içeriği %35,7 ve rbcL (A + T) içeriği %54,8, (G + C) içeriği %45,1 olarak netleştirilerek sekans analiz sonuçlarına göre ML ve NJ ağaçları oluşturulmuştur. ML sonuçlarına göre ITS, trnL intron ve rbcL sonuçlarında türler arasında ayrım oluşurken, trnL-F sonuçlarında ayrım olmamıştır. NJ ağacında, ITS ağacımızda türler arasında gruplaşma oluşurken, trnL-F, trnL intron ve rbcL sonuçlarında gruplaşma olmadığı tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, phylogenetic analysis of Turkish Carum L. species was conducted based on nuclear ribosomal DNA (nrITS) and chloroplast DNA trnL intron, trnL-F and rbcL regions molecular systematic analysis, nucleotide composition ratios and interspecies genetic distance values were determined and their phylogenetic relationships were evaluated. As a result of the study, ITS (A + T) content was 47.4%, (G + C) content was 52.5%; trnL-F (A + T) content 64.2%, (G + C) content 35.7%; By clarifying trnL intron (A + T) content 64.3%, (G + C) content 35.7% and rbcL (A + T) content 54.8%, (G + C) content 45.1%, the sequence ML and NJ trees were created according to the analysis results. According to ML results, while differentiation was formed between species in ITS, trnL intron and rbcL results, there was no distinction in trnL-F results. It was determined that there was no resolution in trnL intron, trnL-F and rbcL results, while grouping occurred between species in our ITS tree in the NJ tree.
Benzer Tezler
- Türkiye' de yayılış gösteren Onopordum L. (Asteraceae) cinsi taksonları üzerine morfolojik, palinolojik, karyolojik, moleküler ve ekolojik araştırmalar
Morphological, palynological, karyological, molecular and ecological studies on taxa belonging to the genus Onopordum L. (Asteraceae) distributed in Turkey
SÜLEYMAN MESUT PINAR
- Türkiye'deki Helianthemum mill. (Cistaceae) cinsi üzerinde taksonomik çalışmalar
Taxonomical studies on the genus Helianthemum mill. (Cistaceae) in Turkey
EMİNE BURCU YEŞİLYURT
Doktora
Türkçe
2014
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBotanik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SADIK ERİK
PROF. DR. GALİP AKAYDIN
- Türkiye'de dağılım gösteren Hyalomma marginatum Koch, 1844'ün populasyon yapısına yönelik araştırmalar
An investigation of the population structure of Hyalomma marginatum Koch, 1844 distributed in Turkey
OLCAY HEKİMOĞLU
- Sağpazarı ve Toyhane (Çankırı- Çorum havzası) antiklinallerinin petrol potansiyellerinin incelenmesi
Investigation of oil possibilities of the Sağpazari and Toyhane anticlines, Çankiri-Çorum basin
DOĞA KIRMIZILAOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Jeoloji MühendisliğiAnkara ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT COŞKUN