Meme kanseri için seçici östrojen reseptörü düzenleyici (SERM) adayı olarak 1-(difenilboranil)piperidin ve trifenilboranamin türevi bileşiklerin in siliko yöntemler ile araştırılması
Investigation of 1- (diphenylboranyl) piperidine and triphenylboranamine derivative compounds as selective estrogen receptor modulator (SERM) for breast cancer by in silico methods
- Tez No: 676191
- Danışmanlar: DOÇ. DR. KORAY SAYIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 127
Özet
Kanser, değişik organlarda hücrelerin kontrolsüz çoğalmasından oluşan, klinik görünümü, tedavisi ve yaklaşımı birbirinden farklı olan bir hastalıklardır. Erkeklerde en yaygın olan akciğer, prostat, kolorektal, mide ve karaciğer kanseriyken, kadınlarda meme, kolorektal, akciğer, servikal ve tiroid kanseri olarak sıralanmaktadır. Meme kanserini tedavisinde kanseri engelleme mekanizmalarından birisi östrojen reseptörünün inhibe edilmesidir ve bu amaç doğrultusunda SERM inhibitörleri araştırılmaktadır. Bu çalışmada 40 adet 1-(difenilboranil)piperidin türevi ve 40 adet trifenilboranamin türevi bileşiklerinin SERM inhibitörü olma özellikleri in siliko yöntemlerle araştırıldı. Bu amaç doğrultusunda sözü edilen bor bileşikleri B3LYP-D3/6-31G(d) seviyesinde su fazında optimize edildi. IR ve NMR spektrumları aynı seviyede hesaplanarak yapıların spektral karakterizasyonları tamamlandı. Söz konusu yeni bor bileşiklerinin meme kanserine karşı etkinliklerinin öngörülebilmesi amacıyla tamoksifen benzeri 30 molekül ve bunların deneysel verileri kullanılarak QSAR analizi gerçekleştirildi. Türetilen 8 model kendi içlerinde değerlendirilerek en etkin model belirlendi ve yeni bor bileşiklerinin teorik IC50 değerleri hesaplandı, tamoksifenin sonucu ile karşılaştırıldı. QSAR analizi sonunda 19 molekülün etkili olabileceğine karar verildi. Seçilen bor bileşiklerinin moleküler doking analizi gerçekleştirildi ve elde edilen sonuçlar tamoksifenin sonuçları ile karşılaştırılarak 3 bileşiğin etkili olabileceği, özellikle 1 bor bileşiğinin potansiyelinin yüksek olduğu anlaşıldı.
Özet (Çeviri)
Cancer is a disease that consists of uncontrolled proliferation of cells in different organs, and their clinical appearance, treatment, and approach differ from each other. While the most common cancer in men is lung, prostate, colorectal, stomach and liver cancer, it is listed as breast, colorectal, lung, cervical and thyroid cancer in women. One of the cancer prevention mechanisms in the treatment of breast cancer is the inhibition of the austorege receptor, and SERM inhibitors are being investigated for this purpose. In this study, the SERM inhibitor properties of 40 new 1- (diphenylboranil) piperidines and 40 triphenylboranamine derivatives were investigated using silico methods. For this purpose, the said boron compounds were optimized in the water phase at the B3LYP-D3/6-31G (d) level. The spectral characterizations of the structures were completed by calculating the IR and NMR spectra at the same level. QSAR analysis was performed using 30 tamoxifen-like molecules and their experimental data in order to predict the effectiveness of these new boron compounds against breast cancer. The most efficient model was determined by evaluating the 8 derived models among themselves, and the theoretical IC50 values of the new boron compounds were calculated and compared with the result of tamoxifen. At the end of the QSAR analysis, it was decided that 19 molecules could be effective. Molecular docking analysis of related compounds was carried out and the results obtained were compared with the results of tamoxifen, and it was understood that 3 compounds could be effective, especially 1 boron compound had a high potency.
Benzer Tezler
- Identification of long non-coding RNAs overcoming tamoxifen resistance in estrogen receptor alpha positive breast cancer
Östrojen reseptörü alfa pozitif meme kanserinde tamoksifen direncini kıran uzun kodlanmayan RNA'ların belirlenmesi
HİLAL BAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. ÖZGÜR ŞAHİN
- Tamoksifen tedavisi alan meme kanserli hastalarda CYP2D6 gen polimorfizmlerinin araştırılması
İnvestigation of CYP2D6 gene polymorphisms in patients with breast cancer treated with tamoxifen
OSMAN JAFARLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Genel CerrahiBursa Uludağ ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ŞEHSUVAR GÖKGÖZ
- Endoplazmik retikulum aracılı yıkım (ERAD) ile ilişkili er membranında lokalize bazı E3 ligaz enzimlerinin meme kanseri hücrelerinde progesteron ve progesteron reseptörü aracılı regülasyonunun araştırılması
Investigation of progesterone and progesterone receptor-mediated regulati̇on of some E3 ligase enzymes localized in the er membrane i̇mplicated wi̇th endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) in breast cancer cells
HATİCE KÜBRA DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YALÇIN ERZURUMLU
- Fungal kaynaklı bassiatin'in (3R,6R) meme kanseri hücre hatları üzerindeki etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of fungal-sourced bassiatin (3R,6R) on breast cancer cell lines
ERKAY ÖZGÖR
- Yeni benzazol türevi bileşiklerin tasarımı, sentezi, yapılarının aydınlatılması, antiproliferatif aktivitelerinin araştırılması ve yapı-etki ilişkilerinin belirlenmesi
Design, synthesis, evaluation of structures, investigation of antiproliferative activities, and determination of structure-activity relationships of novel benzazole derivatives
BAYAN ZOATIER