Clouing and sequencing of a PCR amplican of a novel dehalogeuase gene from pseudomonas sp strain SEC 896
Pseudomonas sp. SEC 836 suşundan yeni bir dehalogeuaz geninin bir PCR ampli kanunun klonlanması ve nükleik asit dizisinin belirlenmesi
- Tez No: 68523
- Danışmanlar: PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilim ve Teknoloji, Science and Technology
- Anahtar Kelimeler: Pseudomonas sp. strain SEC 896, haloasit dehalogenaz, klonlama, nükleik asit dizi analizi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, biyolojik yıkım. VI, Pseudomonas sp. strain SEC 896, haloasit dehalogenaz, klonlama, nükleik asit dizi analizi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, biyolojik yıkım. VI
- Yıl: 1997
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
öz PSEUDOMONAS SP. SEC 896 SUSUNDAN YENİ BİR DEHALOGENAZ GENİNİN BİR PCR AMPÜKONUNUN KLONLANMASI VE NÜKLEİK ASİT DİZİSİNİN BELİRLENMESİ Gürol M., Süei M.S., Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı Danışman : Prof. Dr. Semra Kocabıyık Yardımcı Danışman : Yrd. Doç. Dr. Mahinur Akkaya Temmuz 1997, 80 sayfa Bu çalışmada, Pseudomonas sp. strain SEC 896 susundan yeni bir dehalogenaz geninin klonlanması için bir strateji geliştirilmiştir. Bu strateji izlenerek, haloasit dehalogenaz genlerinin amino asit dizilerine homolog bir fragman, Polimeraz Zincir Reaksyonu (PCR) kullanılarak spesifik olarak çoğaltılmıştır. Dejenere PCR primer seti, bugüne dek nükleik asit dizileri saptanmış sekiz dehalogenaz enziminin büyük ölçüde korunmuş iki amino asit motifi dikkate alınarak tasarlanmıştır. Optimize edilmiş koşullar altında, PCR ~ 0.96 kb büyüklüğünde hiç birkontaminasyon içermeyen özgün bir amplikon oluşturmuştur. Bu amplikon pBS SK (+) fazmiti vektör olarak kullanılarak E. coli TG1 susunda klonlanmıştır. Klonlanmış PCR amplikonu,“Southern Blöf HybridizasyonuncJa prob olarak kullanıldığında, Pseudomonas sp. SEC 896 susunun kromozomal ONA sında olası haloasit dehalogenaz geninin pozisyonunu saptamada başarılı olmuştur. Ayrıca, klonlanmış PCR amplikonunun nükleik asit dizisi ”dideoxy chain termination" yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
öz PSEUDOMONAS SP. SEC 896 SUSUNDAN YENİ BİR DEHALOGENAZ GENİNİN BİR PCR AMPÜKONUNUN KLONLANMASI VE NÜKLEİK ASİT DİZİSİNİN BELİRLENMESİ Gürol M., Süei M.S., Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı Danışman : Prof. Dr. Semra Kocabıyık Yardımcı Danışman : Yrd. Doç. Dr. Mahinur Akkaya Temmuz 1997, 80 sayfa Bu çalışmada, Pseudomonas sp. strain SEC 896 susundan yeni bir dehalogenaz geninin klonlanması için bir strateji geliştirilmiştir. Bu strateji izlenerek, haloasit dehalogenaz genlerinin amino asit dizilerine homolog bir fragman, Polimeraz Zincir Reaksyonu (PCR) kullanılarak spesifik olarak çoğaltılmıştır. Dejenere PCR primer seti, bugüne dek nükleik asit dizileri saptanmış sekiz dehalogenaz enziminin büyük ölçüde korunmuş iki amino asit motifi dikkate alınarak tasarlanmıştır. Optimize edilmiş koşullar altında, PCR ~ 0.96 kb büyüklüğünde hiç birkontaminasyon içermeyen özgün bir amplikon oluşturmuştur. Bu amplikon pBS SK (+) fazmiti vektör olarak kullanılarak E. coli TG1 susunda klonlanmıştır. Klonlanmış PCR amplikonu,“Southern Blöf HybridizasyonuncJa prob olarak kullanıldığında, Pseudomonas sp. SEC 896 susunun kromozomal ONA sında olası haloasit dehalogenaz geninin pozisyonunu saptamada başarılı olmuştur. Ayrıca, klonlanmış PCR amplikonunun nükleik asit dizisi ”dideoxy chain termination" yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.
Benzer Tezler
- Cloning, expression and sequencing of citrate synthase from Thermoplasma volcanium
Thermoplasma volcaniumun sitrat sentaz geninin klonlanması, ekspresyonu ve nükleik asit diziliminin belirlenmesi
ÇAĞLAR ÇEKİÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA
- Heat shock response in Thermoplasma volcanium: Cloning and differential expression of molecular chaperonin (thermosome) genes
Thermoplasma volcanium'un ısı şoku yanıtı: Moleküler şaperonin (termozom) genlerinin klonlanması ve değişimsel anlatımı
FÜSUN DOLDUR
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
- Cloning sequencing and expression of L-lactate dehydrogenase gene from Clostridium thermocellum and isolation, characterization and transformation of various cellulolytic, thermophilic, ethanol-producing bacteria
Clostridium thermocellum'dan L-laktat dehidrogenaz geninin klonlanması ekspresyonu ve çeşitli sellülolitik, termofilik, etanol üreten bakterilerin izolasyonu, karakterizasyonu ve transformasyonu
MELEK ÖZKAN
Doktora
İngilizce
2002
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
DOÇ. DR. ZÜMRÜT ÖGEL
- Establishment of Cas9 endonuclease technology in rye
Çavdarda Cas9 endonükleaz teknolojisinin kullanilmasi
MUHAMMAD ARSLAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
ZiraatEge ÜniversitesiTohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EVREN KOBAN BAŞTANLAR
DR. SAMEH SELİM
- Hepatit delta virüsünün delta antijen geninin klonlanması.
Delta antigen gene cloning of hepatitis delta virus
SERAP SARIALİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
MikrobiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HAKAN ABACIOĞLU