Geri Dön

Implementation of crossbar web service for interactive visualizations of biological networks

Biyolojik ağların interaktif görselleştirilmesi için crossbar web servisinin implementasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 687961
  2. Yazar: AHMET ATAKAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET VOLKAN ATALAY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Biyoloji, Computer Engineering and Computer Science and Control, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 79

Özet

Deneysel biyomedikal araştırmalara yardımcı olmak için mevcut işlemsel araçlar ve hizmetlerin, veri çeşitliliği ve veri bağlantılılığı açılarından eksiklikleri bulunduğundan dolayı, gerçek problemlere çözüm üretme noktasında sınırlı kalmaktadır. Çeşitli biyomedikal kaynaklarla birlikte yapay ve derin öğrenmeye dayalı yöntemlerle geliştirilen kapsamlı bir hesaplama kaynağına dayalı tahminler, ilaç keşfi problemi için oluşturulan CROssBAR projesi kapsamındaki CROssBAR veritabanına (CROssBAR-VT) entegre edilmiştir. Kullanılar açısından CROssBAR-VT'de kolayca arama yapmak ve ardından arama sonuçlarının görsellenmesi büyük önem arz etmektedir. Bundan dolayı CROssBAR ağ servisinin tasarımı, geliştirilmesi ve gerçekleştirilmesi bu tez kapsamında yapılmıştır. CROssBAR ağ servisinde oluşturulan bilgi grafları, açık kaynak kodlu çizge kütüphanesi olan Cytoscape.js kullanırak üretilmiştir. CROssBAR ağ servisine crossbar.kansil.org bağlantısı üzerinden ulaşılabilir.

Özet (Çeviri)

Existing computational tools, resources, and services to assist experimental biomedical research lack data diversity and data connectivity and therefore, they are limited in helping to solve real world problems. Within the framework of CROssBAR project aiming for drug discovery, CROssBAR database (CROssBAR-DB) integrated diverse biomedical resources with the predictions of a comprehensive computing resource developed using machine learning and deep learning-based methods. It is crucial for the users to perform easily search on CROssBAR-DB, and then to visualize the result of the search. For this reason, CrossBAR web service (CROssBAR-WS) is designed, developed and implemented within the scope of this thesis. In CROssBAR-WS, knowledge graphs can be generated by using the open-source graph library Cytoscape.js. CROssBAR-WS is available at crossbar.kansil.org.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    467108

    Logic synthesis and power-delay-area modeling of nano-crossbar arrays

    Nano-dizinlerin güç-gecikme-alan başarım modellemesi ve mantık sentezi

    MUHAMMED CEYLAN MORGÜL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Elektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ALTUN

  2. Tez No

    633414

    Deep learning for prediction of drug-target interaction space and protein functions

    İlaç-hedef protein etkileşim uzayı ve protein fonksiyonlarının tahmini için derin öğrenme

    AHMET SÜREYYA RİFAİOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET VOLKAN ATALAY

    PROF. DR. RENGÜL ÇETİN ATALAY

  3. Tez No

    75538

    Yeni bir hata değişik delta ağ maddeli arttırılmış delta ağı (ADA)

    Başlık çevirisi yok

    M.EBRU KOLUSAYIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kontrol ve Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET BÜLENT ÖRENCİK

  4. Tez No

    815646

    Memristor based synapse design

    Memristör temelli sinaps tasarımı

    SEDA GÜNAKIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiYıldız Teknik Üniversitesi

    Elektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEHRA GÜLRU ÇAM TAŞKIRAN

  5. Tez No

    82483

    Implementation of linear programing based optimum power plan

    Lineer programlama tabanlı optimum yük akışı uygulaması

    İLHAN ALPAY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEZİH GÜVEN

Geri Dön