Geri Dön

Hodgkin lenfoma hastalarında TNF-α (rs1800629) ve IKZF1 (rs4132601) genlerindeki polimorfizmlerin araştırılması

Investigation of polyorphisms in TNF-α (rs1800629) and IKZF1 (rs4132601) genes in hodgkin lymphoma patients

PDF İndir

  1. Tez No: 689281
  2. Yazar: EYLEM PARLAK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NURCAN ARAS
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 44

Özet

Hodgkin lenfoma (HL), B lenfositlerini etkileyen ve hastayı enfeksiyona duyarlı hale getiren, lenfatik sistemin nadir görülen bir kanseridir. B lenfositlerden kaynağını alan, Reed-Sternberg (RS) olarak tanımlanan anormal hale gelmiş B hücresi, kendi kopyasını yapmak amacıyla hızla bölünerek çoğalır. Vücudu enfeksiyonlara karşı korumayan bu hücrelerin artmasıyla tümör meydana gelir. Tümör nekroz faktör alfa (TNF-α) ve Ikaros ailesi çinko parmak 1 (IKZF1) genleri enfeksiyon, romatoid artrit, sistemik lupus eritematozus (SLE), Crohn hastalığı (CD) gibi çeşitli hastalıkların patogenezinde önemli bir role sahip olduğu bilinen proinflamatuar sitokinlerdir. TNF-α (rs1800629) geni, aktif makrofajlar ve T-lenfositler tarafından üretilir ve monositlerin makrofajlara ayrılmasını, nötrofil alımını ve granülomların oluşumunu uyarır. Transkripsiyon faktörü IKZF1 (rs4132601), lenfoid farklılaşmasında kritik regülatör bir işlev görür. Bu nedenle çalışmamızda bağışıklık sisteminde bulunan TNF-α (rs1800629) ve IKZF1 (rs4132601) genlerdeki polimorfizminlerin Hondgkin lenfoma üzerindeki etkisini ve patogenezini araştırmayı amaçladık. Çalışma grubumuza, Mersin Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Hastanesi Hematoloji bölümünde yapılan muayeneler sonucu Hodgkin lenfoma saptanan 34 hasta ve yine aynı anabilim dalında herhangi bir patoloji saptanmamış 35 sağlıklı birey katıldı. Elde edilen kan örneklerinden ilgili genetik analizler Mersin Üniversitesi İleri Teknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi (MEİTAM)'nde gerçekleştirilmiştir. Çalışmamızda TNF-α (rs1800629) genindeki polimorfizme ait allel istatistikleri incelendiğinde, yabanıl G allelinde görülme sıklığı kontrol grubunda % 44,4 (n=30) iken hasta grubunda % 44,1 (n=30), polimorfik olan A allelinde görülme sıklığı kontrol grubunda % 55,6 (n=35) iken hasta grubunda %55,9 (n=38) olarak belirlenmiştir. TNF-α (rs1800629) genindeki polimorfizme ait genotip istatistikleri incelendiğinde, GG genotip görülme sıklığı kontrol grubunda % 0,0 (n=0) iken hasta grubunda % 2,9 (n=1), GA genotip görülme sıklığı kontrol grubunda % 85,71 (n=30) iken hasta grubunda % 82,4 (n=28) olarak belirlenmiştir.Gruplara göre TNF-α (rs1800629) genotip ve allel dağılımları farklılık göstermemektedir (p>0,05). IKZF1 (rs4132601) genindeki polimorfizme ait allel istatistikleri incelendiğinde, yabanıl T allelinde görülme sıklığı kontrol grubunda % 85,7 (n=60) iken hasta grubunda % 73,5 (n=50), polimorfik olan G allelinde görülme sıklığı kontrol grubunda % 14,28 (n=10) iken hasta grubunda % 26,5 (n=18) olarak belirlenmiştir. IKZF1 (rs4132601) genindeki polimorfizme ait genotip istatistikleri incelendiğinde, TT genotip görülme sıklığı kontrol grubunda % 71,42 (n=25) iken hasta grubunda % 52,9 (n=18), TG genotip görülme sıklığı kontrol grubunda % 28,57 (n=10) iken hasta grubunda % 5,9 (n=2) olarak belirlenmiştir. Hasta ve kontrol gruplarında IKZF1 (rs4132601) genotipleri Hardy Weinberg dengesindedir (p>0,05). Gruplara göre IKZF1 (rs4132601) allel dağılımları farklılık göstermektedir (p=0,087). Hasta grubunda kontrol grubuna kıyasla G alleli T alleline göre 2,340 kat daha fazla tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

Hodgkin lymphoma (HL) is a rare cancer of the lymphatic system that affects B lymphocytes and makes the patient susceptible to infection. The abnormal B cell, defined as Reed-Sternberg (RS), originating from B lymphocytes, multiplies rapidly by dividing to make a copy of itself. With the increase of these cells, which do not protect the body against infections, a tumor occurs. Tumor necrosis factor alpha (TNF-α) and Ikaros family zinc finger 1 (IKZF1) genes are proinflammatory cytokines known to have an important role in the pathogenesis of various diseases such as infection, rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE), Crohn's disease (CD). The TNF-α (rs1800629) gene is produced by activated macrophages and T-lymphocytes and stimulates the differentiation of monocytes into macrophages, neutrophil recruitment, and formation of granulomas. The TNF-α (rs1800629) gene is produced by activated macrophages and T-lymphocytes and stimulates the differentiation of monocytes into macrophages, neutrophil recruitment, and formation of granulomas. The transcription factor IKZF1 (rs4132601) functions as a critical regulator in lymphoid differentiation. Therefore, in our study, we aimed to investigate the effect and pathogenesis of polymorphisms in TNF-α (rs1800629) and IKZF1 (rs4132601) genes in the immune system on Hondgkin lymphoma. Our study group included 34 patients who were diagnosed with Hodgkin lymphoma as a result of the examinations performed in the Hematology Department of Mersin University Health Research and Application Hospital, and 35 healthy individuals without any pathology in the same department. Related genetic analyzes from the blood samples obtained were carried out at Mersin University Advanced Technology Research and Application Center (MEİTAM). When the allele statistics of the polymorphism in the TNF-α (rs1800629) gene were examined in our study, the frequency of the wild G allele was 44.4 % (n=30) in the control group, while it was 44.1 % (n=30) in the patient group. While it was 55.6 % (n=35) in the patient group, it was % 55.9 (n=38) in the patient group. When the genotype statistics of the polymorphism in the TNF-α (rs1800629) gene were examined, the incidence of GG genotype was % 0.0 (n=0) in the control group, % 2.9 (n=1) in the patient group, and 85 % in the control group. 71 (n=30) while it was 82.4 % (n=28) in the patient group. TNF-α (rs1800629) genotype and allele distributions did not differ according to the groups (p>0.05). When the allele statistics of the polymorphism in the IKZF1 (rs4132601) gene were examined, the incidence of the wild T allele was 85.7 % (n=60) in the control group, while the incidence of the polymorphic G allele was 73.5 % (n=50) in the patient group and 14% in the control group. 28 (n=10), while it was 26.5 % (n=18) in the patient group. When the genotype statistics of the polymorphism in the IKZF1 (rs4132601) gene were examined, the incidence of TT genotype was 71.42 % (n=25) in the control group, while it was 52.9 % (n=18) in the patient group, and 28.57 % in the control group ( n=10), it was determined as 5.9 % (n=2) in the patient group. The IKZF1 (rs4132601) genotypes in the patient and control groups were in Hardy Weinberg equilibrium (p>0.05). The IKZF1 (rs4132601) allele distributions differ between the groups (p=0.087). Compared to the control group, the G allele was detected 2,340 times more than the T allele in the patient group.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    637588

    Hodgkin lenfoma hastalarında sitokin (tümör nekrozis faktör alfa (TNF-α), transforming growth faktör beta-1 (TGF-β1), interferon gamma (IFN-γ), interlökin-6 (IL-6) ve interlökin-10 (IL-10)) gen polimorfizmleri ile gen ekspresyonlarının etiopatogenezdeki rolünün ve klinik parametrelerle ilişkisinin değerlendirilmesi

    The role of gene polymorphisms and gene expression of cytokines (tumour necrosis factor alfa (RNF-α), transforming growth factor beta-1 (TGF-β1), interferon gamma (İFN-Y), interleukin-6 (IL-6), and interleukin-10 (IL-10)) in the etiopathogenesis of the disease, clinical parameters and prognosis in hl patients

    DUYGU DENİZ DEMİRBAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    HematolojiGaziantep Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HANDAN HAYDAROĞLU ŞAHİN

  2. Tez No

    786095

    Çukurova Bölgesi Üniversite hastanesinde inflamatuar bağırsak hastalığı ile takipli hastalarda malignite sıklığı ve ilişkili faktörlerin değerlendirilmesi

    The frequency of malignancy and risk factors associated with malignancies in inflammatory bowel disease patients at Çukurova University

    ALİ ABBAS GEZGİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GastroenterolojiÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEDEF KURAN

  3. Tez No

    194700

    Non-hodgkin lenfoma hastalarında apoptosis molekülleri traıl ve reseptörleri dr-4 ve dr-5 serum düzeyleri ve fas/fas ligand sistemi ile ilişkilerinin araştırılması: patogenetik ve prognostik değerlendirme

    Serum levels of apoptosis molecules trail and receptors dr-4 and dr-5 and their relation with fas/fas ligand system in patients with non-hodgkin?s lymphoma: evaluation of their role in the pathogenesis and prognosis.

    VELİ BERK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    OnkolojiGazi Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. MUSTAFA BENEKLİ

  4. Tez No

    242796

    Yeni tanı veya relaps lenfomalı hastalarda otoantikor sıklığı ve serum sitokin düzeylerinin prognostik belirteçler ile ilişkisi

    Frequency of autoantibodies in newly diagnosed or relapsed lymphoma patients and the association of serum cytokine levels with prognostic markers

    HAVA ÜSKÜDAR TEKE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    HematolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZAFER GÜLBAŞ

  5. Tez No

    224981

    Non-hodgkin lenfomalı hastalarda tedavi öncesi ve sonrası ( 3 ay) CD4, CD8, CD20, CD25, CD56 ve akut faz reaktantları (C-reaktif protein, ferritin, prokalsitonin) IL1, IL6, TNF? düzeylerinin değerlendirilmesi

    The Levels of serum acut phase reactants (C-reactive protein, ferritin, procalcitonin), IL1, IL6, TNF? and CD4, CD8, CD20, CD25, CD56 in patients with non -hodgkin's lymphoma before and after treatment ( 3 month)

    HACI İBRAHİM PETEKKAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    OnkolojiÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELEK KÖKSAL ERKİŞİ

Geri Dön