Bazı gram negatif bakterilerde kontakt bağımlı inhibisyon mekanizmasının araştırılması
Investigation of contact-dependent inhibition (CDI) mechanism in some gram negative bacteria
- Tez No: 693851
- Danışmanlar: PROF. DR. NİLÜFER CİHANGİR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 74
Özet
Mikroorganizmaların birbirleriyle olan etkileşimlerini incelemek, mikrorganizmaları daha iyi tanıma fırsatını ayrıca onlarla nasıl mücadele edeceğimizin ipuçlarını bulmamızı sağlamaktadır. Antibiyotiğin keşfi, biyofilm oluşumları ve quorum sensing gibi mekanizmalar bu etkileşimlerin araştırılması sonucu ortaya çıkmıştır. Mikroorganizmların geliştirdikleri direnç mekanizmaları, mikroorganizmalara karşı mücadelemizde mevcut yöntemlerin etkisini azaltmakta bu da yeni mekanizmaların araştırılmasını zorunlu kılmaktadır. CDI (Kontak Bağımlı İnhibisyon) mekanizması özellikle tür içi rekabette bakterilerin birbirlerini inhibe ettikleri bir mekanizma olarak karşımıza çıkmaktadır. CDI mekanizmasına sahip olan bakteriler kendi türü içinde CDI mekanizmasına sahip olmayan bakterilerin reseptörlerine bağlanarak onların içersine toksin salmakta ve bu toksin hedef bakteride bakteriyostatik bir etki göstermektedir. Bu bağlamda sunulan tez çalışmasının amacı Protues ve Salmonella türlerinin CDI mekanizmalarının aydınlatılmasıdır.Bu tez çalışmasında hem Amerikan Kültür Koleksiyonuna ait hem de kendi izolatlarımız olan çeşitli Proteus ve Salmonella türleriyle çalışılmıştır. NCBI'da ASM226535v1 numaralı kayıtlı Proteus mirabilis suşuna ait RefSeq: WP_094959879.1 numaralı proteinin CdiB, WP_094959878.1 numaralı proteinin CdiA ve WP_063108584.1 numaralı proteinin ise CdiI proteini olabileceği saptanmıştır. Proteus mirabilis ATCC® 43071 suşundan homolog rekombinasyon yöntemiyle CDI negatif olan Proteus mirabilis ATCC® 43071 Δcdi BAI :: ampR mutant suşu elde edilmiş ve bu suşa ait kontakt bağımlı inhibisyon mekanizması çeşitli parametrelerle aydınlatılmıştır.
Özet (Çeviri)
Examining the interactions of microorganisms with each other provides us with the opportunity to get to know microorganisms better and find clues on how to deal with them. The discovery of antibiotics, biofilm formation and mechanisms such as quorum sensing emerged as a result of investigating these interactions. Due to the resistance mechanisms developed by microorganisms, the effect of existing methods decreases in our fight against microorganisms, and this makes it necessary to investigate new mechanisms. CDI (Contact Dependent Growth Inhibition) mechanism emerges as a mechanism by which bacteria inhibit each other, especially in competition within the species. After bacteria with CDI mechanism bind to the receptors of bacteria that do not have the CDI mechanism, they release toxins into them, and this toxin toxin causes a bacteriostatic effect in the target bacteria. In this context, the aim of the presented thesis is to elucidate the CDI mechanisms of Protues and Salmonella species. In this thesis, various Proteus and Salmonella species, both from the American Cultural Collection and our own isolates, were studied. It was determined that the RefSeq: WP_094959879.1 protein belonging to the Proteus mirabilis strain registered in NCBI with the number ASM226535v1 could be CdiB, the protein numbered WP_094959878.1 could be CdiA and the protein numbered WP_063108584.1 could be the CdiI protein. CDI negative Proteus mirabilis ATCC® 43071 Δcdi BAI :: ampR mutant strain was obtained from Proteus mirabilis ATCC® 43071 strain by homologous recombination method and the contact-dependent inhibition mechanism of this strain was elucidated with various parameters.
Benzer Tezler
- Vitreoscilla hemoglobin geni klonlanmış bakterilerde L-asparajinaz enziminin sentezi: Önemli bir kanser kemoterapi ajanı
The synthesis of L-asparaginase in bacteria carrying Vitreoscilla hemoglobin gene: An enzyme used in cancer therapy
SALİH GENCER
- SiRNA mediated downregulation of genes involved in biofilm formation in some pathogenic gram-negative bacteria and effect of reduced biofilm formation on antibiotic resistance
Bazı patojenik gram negatif bakterilerde biyofilm oluşumunda rol alan genlerin SiRNA aracılı aşağı regülasyonu ve azaltılmış biyofilm üretiminin antibiyotik direncine etkisi
WALAA YAHYA ABDULHUSSEIN SAEDI
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİKAİL AKBULUT
- Non-fermantatif gram negatif bakterilerde biyofilm oluşumu ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi
Biofilm formation of non fermantative gram negative bacteria and determination of antibiotic sensitivity
MUHAMMED FATİH TURSUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜLAL AŞÇI TORAMAN
- Pet hayvanlarından izole edilen insan sağlığı açısından risk oluşturabilecek gram negatif bakterilerde antibiyotik direncinin araştırılması
Investigation of antibiotic resistance in gram negative bacteria isolated from pet animals that may pose a risk to human health
SHAHLAA AMER HAMEEDI HAMEEDI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGÜR KUZUKIRAN