Geri Dön

Comparative analysis of the molecular mechanisms of brain regeneration and glioma using zebrafish model to develop therapeutic approaches for gliomas

Beyin rejenerasyonu ve glioma moleküler mekanizmalarının zebrabalığı modeli kullanılarak gliomalarda terapötik yaklaşımlar geliştirilmesi için karşılaştırmalı olarak analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 694049
  2. Yazar: YELİZ DEMİRCİ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 173

Özet

Araştırmalar, proliferasyon, hücre yenilenmesi ve farklılaşma gibi olayların kanser ve rejenerasyon arasında ortak olduğunu göstermiştir. Ancak bu olaylar rejenerasyonda uygun şekilde sonlandırılırken, kanserde durdurulamazlar ve hücreler sürekli olarak anormal doku bütünlüğü ve anormal doku kütlesi ile sonuçlanan proliferasyona uğrar. Memelilerin aksine, zebrabalığı, beyin dokusunu da içeren birçok organ ve dokularını yenileyebilme kabiliyetine sahiptir. Bu özelliği zebrabalığını vertebralı rejenerasyon çalışmaları için elverişli bir organizma haline getirmiştir. Bu çalışma, telensefalon dokusunda erken yara iyileşmesi, erken proliferasyon ve farklılaşma evrelerinde rejenerasyonda rol alan mekanizmaları tüm transkriptom düzeyinde araştırmayı ve verilerin kanser veritabanlarından elde edilen insan beyin kanseri verileriyle kıyaslayarak beyin dokusunda rejenerasyon ve kanser arasındaki ilişkiyi aydınlatmayı hedeflemektedir. Bu çalışmada, mikro-manipülasyon teknikleri, histolojik teknikler, qPCR ve transkriptom dizileme gibi çeşitli moleküler biyoloji teknikleri kullanılmıştır. Transkriptom dizilemesi sonuçlarını analiz etmek için, kalite analizleri, okumaların referans genoma haritalanması ve sayısal olarak hesaplanması, diferansiyel olarak eksprese olan genlerin tespiti ve sonuçların kanser veritabanlarından elde edilen kanser verileriyle karşılaştırılmasını içeren biyoenformatik analizler yapılmıştır. Sonuç olarak, (i) beyin rejenerasyonunun üç evresi birbirinden farklı karakteristikte transkriptoma sahiptir; (ii) erken yara iyileşmesi evresi, beyin kanserlerine protein translasyonu, hücre gelişimi, nörogenez ve sinaptik sinyal yolakları açısından; (iii) erken hücre çoğalması evresi ile beyin kanserleri hücre bölünmesi ve DNA replikasyonu açısından; (iv) beyin rejenerasyonunun farklılaşma evresi ile beyin kanserleri sinir sistemi gelişimi, damar gelişimi ve organ morfogenezi açısından benzerlik göstermektedir. Bu çalışma, ilk defa telensefalon yenilenmesinin üç farklı evresi ile iki farklı beyin kanserini tüm transkriptom düzeyinde araştıran bir kaynak niteliğindedir. Sonuçlar, beyin kanserlerinin, nörodejeneratif hastalıkların ve beyin hasarının tedavisinde yeni yaklaşımların geliştirilmesi için literatüre katkı sağlamaktadır.

Özet (Çeviri)

Studies have shown that events such as proliferation, renewal of cells and differentiation are shared between cancer and regeneration. However, while these events are terminated properly in regeneration, they cannot be halted in cancer and the cells undergo proliferation consistently resulting with abnormal tissue integrity and abnormal tissue mass. Unlike mammals, zebrafish has the ability to regenerate many organs and tissues, including brain tissue. This feature has made zebrafish a suitable model organism for vertebral regeneration studies. This study aims to investigate the mechanisms involved in regeneration in early wound healing, early proliferation and differentiation stages in telencephalon tissue at the whole transcriptome level and to elucidate the relationship between cancer and regeneration in brain tissue by comparing these results with human brain cancers obtained from cancer databases. In this study, various molecular biology techniques such as micro-manipulation techniques, histological techniques, qPCR and RNA-sequencing were used. Bioinformatics analyses, including quality control, mapping to the reference genome, read counting, detection of differentially expressed genes, and comparison of results with cancer data from cancer databases were performed to analyse RNA-sequencing data. As a result, (i) the transcriptome of three phases of brain regeneration shows different characteristics; (ii) early wound healing stage is similar to the brain cancers in terms of protein translation, cell development, neurogenesis and synaptic signaling pathways; (iii) early cell proliferation stage and brain cancers are similar each other in terms of cell division and DNA replication; (iv) the differentiation stage and brain cancers resembles each other in terms of nervous system development, vascular development and organ morphogenesis. This study is a resource that investigates three different stages of brain regeneration and two different brain cancers at the whole transcriptome level for the first time. The results will be able to contribute to the literature on the development of new approaches in the treatment of brain cancers, neurodegenerative diseases and brain injury.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    684793

    Curcumin (Zerdeçal)'in primer astroglial hücre hattında penisilin ile indüklenen astrosit stresine – ölümüne (nekrosis - apoptosis) koruyucu etkisi

    Protective effect of curcumin (curcuma longa) on astrocyte stress - death (necrosis - apoptosis) in primary astroglial cell line

    NURİYE KURBETLİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    AnatomiPamukkale Üniversitesi

    Anatomi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞAHİKA PINAR AKYER

  2. Tez No

    245856

    Temporal and comparative analysis of genes that play a role in brain vascular development

    Beynin damarsal gelişiminde rol oynayan genlerin zamansal ve karşılaştırmalı analizi

    ABDULKADİR ÖZKAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    Moleküler TıpBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. TÜRKER KILIÇ

    PROF. AYŞE NAZLI BAŞAK

  3. Tez No

    620803

    Investigation of autophagy related markers in brain tissue of early-onset tay - sachs disease mouse models

    Erken başlangıçlı tay-sachs hastalığı fare modellerinin beyin dokusunda otofajiyle ilişkili belirteçlerin araştırılması

    NURSELİN ATEŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Genetikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VOLKAN SEYRANTEPE

  4. Tez No

    926989

    Yenidoğan ratlarda tek ve tekrarlayan sevofluran anestezisine bağlı oluşabilecek nörotoksisitenin ve preanestezik melatonin kullanımının, glutamat metabolizması üzerine etkisinin araştırılması

    The impact of single and repeated sevoflurane-induced neurotoxicity and preanesthetic melatonin administration on glutamate metabolism i̇n neonatal rats

    ALİ SELÇUK BİNDAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Anestezi ve ReanimasyonAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DUYGU KARA

  5. Tez No

    951325

    Farklı makroalg türlerinden elde edilmiş biyoaktif bileşiklerin antikanser ve antioksidan özelliklerinin araştırılması

    Investigation of anticancer and antioxidant properties of bioactive compounds from different macroalgae species

    CEYLAN FİDAN BABAT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    BiyokimyaVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CAN YILMAZ

    PROF. DR. ŞEVKİ ARSLAN

Geri Dön