Geri Dön

Nested ve Non-Nested RT-PCR ile HCV-RNA'nın araştırılması

Detection of HCV-RNA by using Nested and NON-Nested RT-PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 70533
  2. Yazar: NAZİF ESİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HÜSEYİN GÜN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 1998
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: GATA
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 60

Özet

ÖZET Bu çalışmada Şubat 1997- Ocak 1998 yılları arasında Gülhane Askeri Tıp Akademisi ve Askeri Tıp Fakültesi Gastroenteroloji ve İnfeksiyon Hastalıkları klinikleri tarafından HCV hepatiti şüphesi ile gönderilen 50 hasta serumunda HCV- RNA'sı iki farklı RT-PCR yöntemiyle araştırıldı. Olguların tamamı Hepatit B virüs markırları dahil diğer viral nedenlerle, toksik.metabolik ya da otoimmün etyolojinin ekarte edildiği olgulardı. Yaş ortalaması 39 (11-66) olan hastaların 22'si kadın, 28' i erkekti ve tümünde anti-HCV antikorları pozitifti. HCV-RNA varlığını araştırmak amacıyla uygulanan nested-RT-PCR yöntemiyle 50 hastanın 31 (%62)'inin serum örneğinde HCV-RNA'sı pozitif bulunurken, bu oran non-nested-RT-PCR yöntemiyle 25 (%50) olarak bulunmuştur. Kontrol grubunu oluşturan 40 sağlıklı bireyin hiçbirisinde her iki PCR yöntemiyle HCV-RNA pozitifliği gösterilemedi. Nested'a göre daha ucuza mal olan ve daha pratik olarak uygulanan, ayrıca kontaminasyondan hayli uzak olan non-nested yöntemin duyarlılığını daha düşük bulduk (%74). Duyarlılığın düşük olması nedeniyle non-nested yöntemin rutinde tek başına kullanılmasının yeterli olmayacağı, ancak Southern veya radyoaktif oligonukleotid problarla sıvı hibridizasyon gibi ilave tekniklerle duyarlılığın artırılabileceği sonucuna varıldı.

Özet (Çeviri)

SUMMARY In the period between February 1997 and January 1998, HCV-RNA was investigated in sera of fifty patients, from those examined and suspected to have hepatitis due to HCV in Gastroenterology and Infections Diseases Clinics at Gülhane Military Medical Academy and School of medicine, using two different RT- PCR methods. In all of the patients, the other possible aetiologies including HBV and other viral agents, toxic, metabolic or otoimmun pathologies were excluded. Anti-HCV antibodies were found to be positive in sera of all patients. The mean age of the patients was 39 (1 1-66) years and 28 out of 50 patients was male. By using nested-RT-PCR and non-nested-RT-PCR methods, HCV-RNA was found to be positive in 31 (62%) and in 25 (50%) out of 50 patients, respectively. In control group,HCV-RNA was found to be negative in sera of fourty (all) healthy individuals by both PCR methods. Although the non-nested-RT-PCR method was cheaper, more practical and has low contamination rate than nested method, we found its sensitivity relatively low (74%). Due to this low sensitivity rate, it was concluded that the routine use of non-nested-RT-PCR alone was not suitable. By additional methods such as Southern blot or liquid hibridisation, the non-nested-RT-PCR might be more valuable tool. 44

Benzer Tezler

  1. Tez No

    132321

    İnterferon+ribavirin tedavisinde virolojik yanıtsız kronik hepatit C hastalarında genotip 1b virüs genomunun interferona hassasiyeti belirleyici (ISDR) dizisinde mutasyonların belirlenmesi

    Identification of mutations within the sequence of interferon sensitivity determining region (ISDR) of virus genotype 1b in chronic hepatitis C patients who are virologically nonresponsive to ifn+ribavirin therapy

    NEVİM AYGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN TERZİOĞLU

    PROF. DR. HAKAN ABACIOĞLU

  2. Tez No

    69261

    Kronik parankimal karaciğer hastalarında ve hemodiyaliz hastalarında hepatit G virüs prevalansı

    The Prevalence of GB virus C infection in patients with chronic hepatitis and in patients with chronic hepatitis and in hemodialysis patients

    ALİ HAFTA

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİKMET AKKIZ

  3. Tez No

    856991

    Detection of Pegivirus and SEN virus among patients on hemodialysis

    Hemodiyalizdeki hastalarda Pegivirüs ve SEN virüsünün tespiti

    FATIMAH KHAZAAL KHAMEES AL-MAJMAIE

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZCAN ÖZKAN

    PROF. DR. İSMAİL İBRAHİM LATİF

  4. Tez No

    828548

    Buzağılarda norovirus enfeksiyonunun virolojik olarak araştırılması

    Virological investigation of norovirus infection in calves

    TEVHİDE AYDIN DÖNMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Veteriner HekimliğiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Veterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURAL EROL

  5. Tez No

    878724

    Karadeniz bölgesi'ndeki gökkuşağı alabalıklarında Aquareovirus Aenfeksiyonlarının varlığının araştırılması

    Investigation of the presence of Aquareovirus A infections in rainbow trout in the black sea region

    SEMRA GÜNDÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Veterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CÜNEYT TAMER

Geri Dön