Zayıf asit stresinin cyc1 ve gpd1 genlerinin transkripsiyonuna ve hücre döngüsüne etkilerinin incelenmesi
Investigation of the effects of weak acid stress on the cell cycle and transcription of cyc1 and gpd1 genes
- Tez No: 706642
- Danışmanlar: PROF. DR. SEZAİ TÜRKEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
Mikroorganizmalar üreme ortamına metabolik aktiviteleri sonucu oluşan çeşitli organik asitleri salgılamaktadır. Mikroorganizma türüne göre değişebilen bu organik asitler laktik asit, sitrik asit, asetik asit ve suksinik asit olabilir. Bu araştırmada laktik asit, sitrik asit ve asetik asitin S. cerevisiae'da sitokrom 1 geni ve GPD1 geni transkripsiyonuna ve ayrıca hücre bölünmesine etkileri incelendi. Sitokrom C1 (CYC1) geni, Sitokrom C izoform-1 olarak da bilinen peptidi kodlamaktadır. Sitokrom C1 elektron taşıma zincirinde yer almakla birlikte apoptozu başlatıcı faktör olarak da işlev görür. GPD1 geni tarafından kodlanan NAD-bağımlı gliserol 3-fosfat dehidrogenaz enzimi de hem gliserol biyosentezi hem de hücrede redoks dengesi, (NAD/NADH) için gereklidir. Araştırmalarımızdan elde edilen sonuçlar sitrik asitin CYC1 transkripsiyonunu baskıladığını fakat GPD1 transkripsiyonunu ise 3-4 kat aktive ettiğini göstermektedir. Laktik asitin ise CYC1 geni transkripsiyonuna önemli bir etkisinin olmadığı fakat GPD1 transkripsiyonunu 3 kat aktive ettiği gösterilmiştir. Apoptozu aktive eden asetik asitin ise hem CYC1 ve hem de GPD1 transkripsiyonunda önemli ölçüde baskılamaya neden olduğu bulunmuştur. Sitrik asit stresine yanıt olarak GPD1 transkripsiyonundaki aktivasyonun tamamen protein kinaz Hog1p`ye bağlı olduğu bulundu. Ancak stresle aktive edilen transkripsiyon faktörleri olan Msn2p, War1p ve Haa1pnin GPD1 transkripsiyonunun aktivasyonu için gerekli olmadığı görüldü. Bu sonuçlara ek olarak, sitrik asit stresinin S. cerevisiae'da hücre bölünmesinde anomaliye neden olduğu da bulundu. Elde edilen sonuçlar zayıf asit stresinin GPD1 ve CYC1 geni transkripsiyonlarına etki ettiğini ve hücre bölünmesinde anomaliye neden olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Microorganisms secrete various organic acids, such as citric acid, lactic acid, acetic acid, and succinic acid, to their growth medium as a result of their metabolic activities. The type of these acids can vary depending on the microorganism's species. In this research, the effects of citric acid, lactic acid, and acetic acid on the transcription of GPD1 and CYC1 gene was investigated in S. cerevisiae. Besides, the effects of these organic acids on the cell division were also analyzed. Cytochrome C-1 (CYC1) gene encodes cytochrome C-isoform 1 peptide, which involves in the electron transfer chain in mitochondria and activation of apoptosis. GPD1 gene encodes NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase enzyme required for the redox balance (NAD/NADH ratio) and also catalyzes an essential step in glycerol biosynthesis in yeast. The results of this study indicated that citric acid represses the transcription of the CYC1 gene, but it activates the transcription of the GPD1 gene up to 3 to 4-fold. Acetic acid that activates apoptosis represses the transcription of CYC1 and GPD1 genes at significant levels. Moreover, our results indicated that citric acid-dependent activation of GPD1 transcription completely depends on the protein kinase Hog1p. Unlike Hog1p, it seems that the stress-activated transcription factors Msn2p, War1p, and Haa1p are not required for the activation of GPD1 gene transcription. Also, it appears that citric acid stress also results in abnormal cell division in S. cerevisiae. Altogether, the results of this research indicated that weak acid stress affects the transcription of GPD1 and the CYC1 gene and cause abnormal cell division in S. cerevisiae.
Benzer Tezler
- Saccharomyces cerevisiae'da asit stresinin SUC2 gen ekspresyonuna etkilerinin genetik ve biyokimyasal analizi
Genetic and biochemical analysis of the effects weak organic acid stress on the SUC2 gene expression and invertase activity in Saccharomyces cerevisiae
AYLİN KAHRAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
GenetikUludağ ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEZAİ TÜRKEL
- Gastroözofageal reflü hastalığı tanısında impedans tekniği ile tespit edilmeyen reflü ataklarında 'pH-ONLY olayları' fenomeni ve impedans ile phmetre tekniği arasında özofagusun asit etkisinde kalış sürelerinin karşılaştırılması
Phenomenon of 'pH–only events' i̇n the i̇mpedance techni̇que for di̇agnosi̇s of gastroesophageal reflux di̇sease and the compari̇son of aci̇d exposure durati̇on between phmeter and i̇mpedance techni̇que
AYŞE PARLAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Çocuk CerrahisiUludağ ÜniversitesiÇocuk Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN DOĞRUYOL
- Kapsaisin maddesinin kemik metabolizması üzerine olan etkisi
Effect of capcaisin on bone metabolism
ISMAHAN GÜRGEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonHarran ÜniversitesiFizik Tedavi ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. PELİN YAZGAN
- Doğal ve modifiye edilmiş şeker pancarı küspesi ve pülpü kullanılarak sulu çözeltilerden Cr(VI) iyonlarının uzaklaştırılması
Removal of Cr(VI) ions from aqueous solutions by natural and modified sugar beet bagasse and pulp
YUSUF FAİK DEMİRAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Kimya MühendisliğiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞE ÖZTÜRK
- Çocuk kistik fibrozis hastalarında gastroözofageal reflü özellikleri ve gastrik boşalma zamanı ile ilişkisi
Characteristics of gastroesophageal reflux in children with cystic fibrosis and relation with gastric emptying time
AYŞE İREM ZÖHRE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ENGİN TUTAR