Geri Dön

Şırnak ili buğday üretim alanlarındaki arpa sarı cücelik virüs (Barley yellow dwarf viruses; BYDVs)'lerinin multipleks RT-PCR yöntemiyle araştırılması ve bazı virüs izolatlarının moleküler karakterizasyonu

Molecular characterizations of some virus isolates andinvestigation of Barley yellow dwarf viruses (BYDVs) in the wheatproduction areas in Şirnak province by multiplex RT-PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 706746
  2. Yazar: ORHAN KAPAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSTAFA USTA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 102

Özet

Şırnak ili ve ilçelerinde buğday üretim alanlarında Arpa sarı cücelik virüslerini (BYDV-PAV, BYDV-MAV, BYDV-SGV, BYDV-RMV ve CYDV-RPV) belirlemek amacı ile 2020 yılında survey çalışmaları yapılmıştır. Survey çalışması kapsamında toplanan 411 örnekte virüs tespiti için multipleks RT-PCR ve RT-PCR yöntemleri kullanılmıştır. Bölgeden toplanan 411 buğday örneğine uygulanan PCR testleri sonucu sonrası toplamda 55 (% 13.38) tane pozitif örnek tespit edilmiş ve bu örnekler içerisinde 40 tane örnekte BYDV-PAV (% 9.73), 3 örnekte CYDV-RPV (% 0.73) virüsleri tespit edilirken 12 örnekte BYDV-PAV+CYDV-RPV (% 2.91) karışık infeksiyonları tespit edilmiştir. Tespit edilen virüslerin kılıf protein gen bölgesinin karakterizasyonu için herbir virüs türünden ikişer pozitif izolat seçilerek kılıf protein gen bölgeleri karakterize edilmiştir. BYDV-PAV Şırnak 1 izolatı OL685734 ve Şırnak 4 izolatı OL685736 erişim numaralarıyla, CYDV-RPV Şırnak 12 izolatı OL685735 ve Şırnak 33 izolatı OL685737 erişim numaralarıyla Gen bankası (NCBI)'na kaydı yapılmıştır. Şırnak ili ve ilçelerinde Arpa sarı cücelik virüslerinin tespiti için yapılan bu çalışmada BYDV-MAV, BYDV-SGV ve BYDV-RMV virüsleri görülmezken, BYDVPAV ve CYDV-RPV virüsleri tespit edilip burada ilk defa raporlanmıştır.

Özet (Çeviri)

Survey studies were carried out in 2020 in order to determine Barley yellow dwarf viruses (BYDV-PAV, BYDV-MAV, BYDV-SGV, BYDV-RMV, and CYDV-RPV) in wheat production areas in Şırnak province and its districts. Multiplex RT-PCR and RTPCR methods were used for virus detection in 411 samples collected within the scope of the survey study. As a result of PCR tests applied to 411 wheat samples collected from the region, a total of 55 (13.38%) positive samples were detected. Among these samples, BYDV-PAV (9.73%) viruses were detected in 40 samples, CYDV-RPV (0.73%) viruses were detected in 3 samples, and BYDV-PAV+CYDV-RPV (2.91%) mixed infections were detected in 12 samples. For the characterization of the coat protein gene region of the detected viruses, two positive isolates from each virus species were selected and the complete coat protein gene regions were characterized. BYDV-PAV Şırnak 1 isolate was registered in Genbank (NCBI) with accession numbers OL685734 and Şırnak 4 isolate with OL685736. On the other hand, CYDV-RPV Şırnak 12 isolate were registered in Genbank (NCBI) with OL685735 and Şırnak 33 isolate OL685737. While BYDV-MAV, BYDV-SGV, and BYDV-RMV viruses were not observed in this study for the detection of Barley yellow dwarf viruses in Şırnak province and its districts, BYDV-PAV and CYDV-RPV viruses were detected and reported here for the first time.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    904915

    Organomineral ve kimyasal gübre uygulamalarının buğday bitkisinin verim ve kalite özellikleri ile toprakların azot formlarına etkisinin belirlenmesi

    Determination of the effects of organomineral and chemical fertilizer applications on the yield and quality characteristics of wheat plant and the nitrogen forms of soils

    NİHAN TAZEBAY ASAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYFER ALKAN TORUN

    PROF. DR. KADİR SALTALI

  2. Tez No

    380343

    Dihaploid makarnalık buğday(Triticum durum L.) üretiminde Imperata cylindrica L. temelli kromozom eliminasyon tekniğinin uygulanması

    Production of dihaploids in durum wheat (Triticum durum L.) using Imperata cylindrica L. mediated chromosome elimination

    DUYGU KUTLAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    ZiraatMustafa Kemal Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NAFİZ ÇELİKTAŞ

  3. Tez No

    547275

    Bazı makarnalık buğday genotiplerinin bitkisel ve dane kalite özelliklerinin belirlenmesi, Sds-Page yöntemi ile genetik karakterizasyonu

    Determining the plant and wheat grain quality features of certain varieties of durum wheat, genetic characterization through the Sds-Page method

    SELÇUK KIRMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT TİRYAKİOĞLU

  4. Tez No

    711353

    Organik, düşük gübre girdili ve konvansiyonel koşullarda makarnalık buğday (Triticum durum L.) genotiplerinin morfolojik, fizyolojik ve moleküler karakterizasyonu

    Morphological, physiological and molecular characterization of durum wheat (Triticum durum L.) genotypes under organic, low fertilizer input and conventional conditions

    REMZİ ÖZKAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatDicle Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CUMA AKINCI

    DOÇ. DR. BEHCET İNAL

  5. Tez No

    777008

    Şırnak ili akrep (Arachnida: Scorpiones) faunası

    Detection of the Şırnak scorpion (Arachnida: Scorpiones) fauna

    RIDVAN KURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiHarran Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞAHİN TOPRAK

Geri Dön