Characterization of the binding of Apolipophorin III to Lipopolysaccharides
Apolipophorin III'ün Lipopolysakkaritlere Bağlanmasının Karakterizasyonu
- Tez No: 709873
- Danışmanlar: PROF. DR. PAUL WEERS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyoloji, Biyofizik, Biochemistry, Biology, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Calıfornıa State Unıversıty-Long Beach
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Apolipophorin III (apoLp-III), model olarak kullanılan küçük bir böcek apolipoproteinidir. Apolipoproteinler, lipopolisakkaritleri nötralize eder, ancak ayrıntılar tam olarak anlaşılamamıştır. Gram negatif bakterilerin lipopolisakkaritleri, yaygın bir ölümcül durum olan septik şoku indükleyebilir. Bu çalışmada, çeşitli bakteri türlerinden lipopolisakkaritlerle apoLp-III bağlanma etkileşimi, FPLC, dinamik ışık saçılımı, tirozin floresan ve doğal PAGE kullanılarak araştırıldı. ApoLp-III'ün Escherichia coli lipopolisakkaritlerine bağlanması, moleküler kütlesi 400 kDa, çapı 18.7 nm, 4 apoLp-III ve 24 LPS molekülü ile komplekslerin oluşmasıyla sonuçlandı. Klebsiella pneumoniae LPS ile kompleksler biraz daha küçüktü. Kesilmiş ve detoksifiye edilmiş lipopolisakaritlerle yapılan analiz, apoLp-III'ün tercihen lipid A'ya bağlandığını, O-antijen tekrarının ise daha zayıf bir bağlanma etkileşimi ortaya çıkardığını gösterdi. Bu bulgular yeni bir apolipoprotein-lipopolisakkarit etkileşimi modeline yol açtı ve sepsis tedavisinde yeni terapötik yaklaşımların geliştirilmesi için kullanılabilir.
Özet (Çeviri)
Apolipophorin III (apoLp-III) is a small insect apolipoprotein used as a model. Apolipoproteins neutralize lipopolysaccharides but the details are poorly understood. Lipopolysaccharides of gram-negative bacteria can induce a septic shock, a common lethal condition. In the present study, the apoLp-III binding interaction with lipopolysaccharides from a variety of bacterial species was investigated using FPLC, dynamic light scattering, tyrosine fluorescence, and native PAGE. ApoLp-III binding to Escherichia coli lipopolysaccharides resulted in the formation of complexes with a molecular mass of 400 kDa, a diameter of 18.7 nm, with 4 apoLp-III and 24 LPS molecules. The complexes with Klebsiella pneumonia LPS were somewhat smaller. Analysis with truncated and detoxified lipopolysaccharides indicated that apoLp-III preferably binds to lipid A, while the O-antigen repeat elicited a weaker binding interaction. These findings led to a new model of apolipoprotein-lipopolysaccharide interaction and may be used for the development of new therapeutic approaches to treat sepsis
Benzer Tezler
- Kemikli balıklarda RNA'ya bağlanan LARP6 proteinlerinin n-terminal alanının karakterizasyonu
Characterization of the n-terminal domain of the RNA-binding LARP6 proteins from teleost fish
HATİCE KÜLKÖYLÜOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyokimyaOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARİF GÖNÜLOL
YRD. DOÇ. DR. KAREN ADELL LEWIS
- Tükürük müsinleri MG1 ve MG2'nin izolasyonu ve müsin-bağlanan oral streptococ adezinlerinin tespiti ve tanımlanması
The Identification and characterization of salivary mucin-binding adhesins from oral streptococci
MEHMET KESİMER
- Tarihi yapıların onarımına yönelik doğal taş tozu ile polimer bağlayıcılı harçların üretimi ve karakterizasyonu; Sille taşı örneği
Production and characterization of natural stone powder and polymer binding mortars for the repair of historic buildings; Sille stone example
AHMET CİHAT ARI
- Kahverengi alabalıklarda (Salmo trutta) crabp (hücresel retinoik sit bağlayıcı protein) geninin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of the crabp (cellular retinoic acid binding protein) gene in brown trout (Salmo trutta)
EMRE SEFA
- Pro-inflamatuvar sitokin makrofaj migrasyonunu engelleyici faktör (MIF)'ün ilişkide olduğu proteinlerin tanımlanması ve bunların moleküler özelliklerinin belirlenmesi
Identification and molecular characterization of binding partners for the pro-inflammatory cytokine macrophage migration inhibitory factor (MIF)
SEVİL ÇAYLI
Doktora
Türkçe
2009
Histoloji ve EmbriyolojiAkdeniz ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ANDREAS MEİNHARDT
PROF. DR. RAMAZAN DEMİR