Geri Dön

Characterization of the binding of Apolipophorin III to Lipopolysaccharides

Apolipophorin III'ün Lipopolysakkaritlere Bağlanmasının Karakterizasyonu

  1. Tez No: 709873
  2. Yazar: MERVE ÖZTUĞ KILINÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. PAUL WEERS
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyofizik, Biyokimya, Biyoloji, Biophysics, Biochemistry, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: California State University-Long Beach
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 89

Özet

Apolipophorin III (apoLp-III), model olarak kullanılan küçük bir böcek apolipoproteinidir. Apolipoproteinler, lipopolisakkaritleri nötralize eder, ancak ayrıntılar tam olarak anlaşılamamıştır. Gram negatif bakterilerin lipopolisakkaritleri, yaygın bir ölümcül durum olan septik şoku indükleyebilir. Bu çalışmada, çeşitli bakteri türlerinden lipopolisakkaritlerle apoLp-III bağlanma etkileşimi, FPLC, dinamik ışık saçılımı, tirozin floresan ve doğal PAGE kullanılarak araştırıldı. ApoLp-III'ün Escherichia coli lipopolisakkaritlerine bağlanması, moleküler kütlesi 400 kDa, çapı 18.7 nm, 4 apoLp-III ve 24 LPS molekülü ile komplekslerin oluşmasıyla sonuçlandı. Klebsiella pneumoniae LPS ile kompleksler biraz daha küçüktü. Kesilmiş ve detoksifiye edilmiş lipopolisakaritlerle yapılan analiz, apoLp-III'ün tercihen lipid A'ya bağlandığını, O-antijen tekrarının ise daha zayıf bir bağlanma etkileşimi ortaya çıkardığını gösterdi. Bu bulgular yeni bir apolipoprotein-lipopolisakkarit etkileşimi modeline yol açtı ve sepsis tedavisinde yeni terapötik yaklaşımların geliştirilmesi için kullanılabilir.

Özet (Çeviri)

Apolipophorin III (apoLp-III) is a small insect apolipoprotein used as a model. Apolipoproteins neutralize lipopolysaccharides but the details are poorly understood. Lipopolysaccharides of gram-negative bacteria can induce a septic shock, a common lethal condition. In the present study, the apoLp-III binding interaction with lipopolysaccharides from a variety of bacterial species was investigated using FPLC, dynamic light scattering, tyrosine fluorescence, and native PAGE. ApoLp-III binding to Escherichia coli lipopolysaccharides resulted in the formation of complexes with a molecular mass of 400 kDa, a diameter of 18.7 nm, with 4 apoLp-III and 24 LPS molecules. The complexes with Klebsiella pneumonia LPS were somewhat smaller. Analysis with truncated and detoxified lipopolysaccharides indicated that apoLp-III preferably binds to lipid A, while the O-antigen repeat elicited a weaker binding interaction. These findings led to a new model of apolipoprotein-lipopolysaccharide interaction and may be used for the development of new therapeutic approaches to treat sepsis

Benzer Tezler

  1. Pro-inflamatuvar sitokin makrofaj migrasyonunu engelleyici faktör (MIF)'ün ilişkide olduğu proteinlerin tanımlanması ve bunların moleküler özelliklerinin belirlenmesi

    Identification and molecular characterization of binding partners for the pro-inflammatory cytokine macrophage migration inhibitory factor (MIF)

    SEVİL ÇAYLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Histoloji ve EmbriyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ANDREAS MEİNHARDT

    PROF. DR. RAMAZAN DEMİR

  2. Characterization of the NLRP3 inflammasome involvement in cellular immunity to SARS-CoV-2

    SARS-CoV-2 virüsüne karşı hücre bağışıklığında NLRP3 inflamazomunun rölünün belirlenmesi

    SAFA RAMADAN SALEEM FITOURI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Allerji ve İmmünolojiBahçeşehir Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ELİF EREN

  3. Initial characterization of CXXC5 as a putative DNA binding protein

    Potensiyel olarak DNA'ya bağlanan CXXC5 proteininin ön karakterizasyonu

    PELİN YAŞAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MESUT MUYAN

  4. Bazı yağlı tohum kabuklarından elde edilen antioksidanca zenginleştirilmiş mikrokristal selülozun karakterizasyonu ve mayonezde kullanım olanaklarının araştırılması

    Characterization of antioxidant-enriched microcrystalline cellulose obtained from shell and hull of some oil seeds and investigation of usage in mayonnaise

    NACİYE ÜNVER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Gıda MühendisliğiHarran Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞERAFETTİN ÇELİK