Identification of a Gene Underlying a Major Fruit Texture QTL in Tomato
Domateste Meyve Sertliği ile İlişkili Temel QTL Bölgesine Ait Genin Tanımlanması
- Tez No: 710600
- Danışmanlar: PROF. GRAHAM SEYMOUR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: The University of Nottingham
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Adalet Yönetimi Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 228
Özet
Domateste (Solanum lycopersicum) diğer olgunlaşma ile ilişkili faktörler üzerinde olumsuz bir etki oluşturmadan meyve yumuşamasını kontrol etmek büyük bir zorluktur, ancak raf ömrünü korumak için hayati önem taşımaktadır. Bu çalışma, domatesin diğer kalite özelliklerini etkilemeden meyve doku sertliğini seçici olarak kontrol etmek için bir mekanizma sağlayan kantitatif özellik lokusunun (QTL) altında yatan gen ya da genlerin tanımlanmasına odaklanmıştır. Daha önce yapılan çalışmada domatesin doku sertliği ile ilişkili bir QTL, Zamir tarafında geliştirilen Solanum pennellii introgresyon hatları (IL) kullanılarak domatesin 3. Kromozomuna haritalanmıştır. IL3-4 hattı kullanılarak yapılan detaylı haritalama çalışması ile sertlik lokusunu barındıran QTL 1 Mb'lik bir bölgeye haritalanmıştır. Bu QTL bölgesi içinde, yumuşak dokuya sahip M82 ebeveyninde yüksek oranda ifade edilen, sert bir dokuya sahip olan IL3-4 ebeveynin de ise oldukça düşük düzeyde ifade edilen pektat liyazı enzimini kodlayan bir gen bulunmuştur. Pektat liyaz genini kodlayan gen (Solyc03g111690), bu çalışmada aday gen olarak belirlenmiş ve fonksiyonu RNAi yaklaşımı kullanılarak transgenik bitkilerde test edilmiştir. Tamamen kırmızı olgun RNAi PL meyveleri kontrol meyvelerine göre daha sert bir dokuya sahip olarak renk, şekerler, asitler ve aroma uçucularının gelişimi açısından normal olarak olgunlaşmıştır. Pektat liyaz, hücre duvarında bulunan pektinin çözünürlüğü ve depolimerizasyonu için gereklidir ve domatesin yumuşamasında daha önce karakterize edilen hücre duvarını modifiye edici enzimlerden çok daha önemli bir rol oynamaktadır. Bu çalışmada açıklanan transgenik yaklaşımlar ve doğal varyasyonun mevcudiyeti, meyve kalitesinden ödün vermeden domateste dokuyu geliştirmek ve raf ömrünü uzatmak için yöntemler sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Controlling fruit softening in tomato (Solanum lycopersicum), in the absence of a negative impact on other ripening events, is a major challenge, but vital to maintain good shelf life. This work was focused on identification of the gene underlying a major texture quantitative trait locus (QTL) in tomato to provide a mechanism for selectively controlling fruit texture in the absence of effects on other quality attributes. A texture QTL was mapped to tomato chromosome 3 in a previous study using the Zamir Solanum pennellii introgression lines (IL) (Eshed and Zamir, 1995). Fine mapping within IL3-4 revealed a 1 Mb region harbouring the texture QTL. Within this region was a gene encoding a pectate lyase that was strongly expressed in the soft M82 parent, but lowly expressed in the firm fruit of the IL3-4 parent. This PL (Solyc03g111690) was nominated as the QTL candidate gene and the effect of modulating its expression was tested in transgenic plants using an RNAi approach. Fully red ripe RNAi PL fruits were substantially firmer than wild type, but ripened normally with respect to colour, sugars, acids and the development of flavour volatiles. PL was necessary for cell wall pectin solubilisation and depolymerisation, linked to cell-to-cell adhesion, and played a much more significant role in softening than previously characterised cell wall modifying enzymes. The GM approaches and availability of natural variation described in this thesis provide methods to enhance texture and extend shelf life in tomato without compromising fruit quality.
Benzer Tezler
- Identification and characterization of a new mosquitocidal Bacillus sphaericus and its toxin proteins
Sivrisinek öldürücü yeni bir suş olan Bacillus sphaericus ve toksin proteinlerinin tanımlanması ve karakterizasyonu
FATİH ÇAKAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyoteknolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN
- Servikal spinal travmalı 109 olgunun retrospektif incelenmesi
Retrospective evaluation of 109 patients with cervical spine trauma
HAYDAR ÇELİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
NöroşirürjiSağlık BakanlığıBeyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
UZMAN YAVUZ ERDEM
- Cinsel yolla bulaşan enfeksiyon etkenlerinin tanısında kullanılan konvansiyonel yöntemler ve DPO TM (dual priming oligonükleotid) tabanlı multipleks PCR yönteminin karşılaştırılması
Comparison of conventional methods used in the diagnosis of sexually transmitted infectionsand DPO TM (Dual priming oligonükletid) based multiplex PCR method
DEMET FURKAN SEVİNDİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BERRİN ESEN
- Doğu karadeniz bölgesinde osteoporoz için risk faktörlerinin tespiti
Identification of risk factors for osteoporosis in the region of east black sea
MÜNEVVER SERDAROĞLU BEYAZAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonKaradeniz Teknik ÜniversitesiFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET TOSUN
- İnvaziv meme karsinom olgularında her2 ekpresyonunun sısh (gümüş insitu hibridizasyon)yöntemiyle tespit edilerek sonuçların immünohistokimyasal ve fısh (floresan insitu hibridizasyon) yöntemleriyle karşılaştırılması
Determination of her2 status in invasive ductal breast carcinoma using sish and correlation between fish and ihc
BETÜL ÜNAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
PatolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA ŞEYDA KARAVELİ