Production of virus like particles expressing alpha (B.1.1.7) or delta plus (B.1.617.2.1) spike variants and development of a pseudotyped virus neutralization assay
Alpha (B.1.1.7) veya delta plus (B.1.617.2.1) spike varyantlarını ifade eden virüs benzeri parçacıkların (VBP) üretimi ve yalancı tip virüsle nötralizasyon analizi geliştirme
- Tez No: 717214
- Danışmanlar: PROF. DR. MAYDA GÜRSEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 167
Özet
Aşılar, bulaşıcı hastalıkların yayılmasıyla mücadelede en önemli halk sağlığı müdahalelerinden biridir. Hali hazırda onaylanmış olan tüm COVID-19 aşıları, orijinal Wuhan soyundan türetilen Spike antijenini hedefler. Fakat, yeni varyantların ortaya çıkmasıyla birlikte, mevcut aşıların etkinliği, bazı endişe uyandıran varyantlara (VOC) karşı nötralizan antikor üretme yetenekleriyle orantılı olarak azaldı. Önümüzdeki 2 ila 4 yıl içinde yeni VOC'ların ortaya çıkacağı tahmin edildiğinden, varyant spesifik aşılara acilen ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada, Virüs Benzeri Parçacık (VBP) aşı platformundan yararlanarak, Delta plus (B 1.617.2.1) ve Alpha (B.1.1.7) varyantlarına karşı aşı antijenleri tasarlamayı amaçladık. Bu nedenle, bu varyantlara özgü VBP'ler, orijinal virüsün M, N, E proteinleri ve endişe uyandıran Delta plus (B 1.617.2.1) ve Alpha (B.1.1.7) varyantlarının mutasyonlarını taşıyan Spike (S) proteinlerinin birleştirilmesiyle oluşturulmuştur. Bunun için M ve N genleri, pVitro1 ekspresyon vektörüne klonlanırken, varyantlara özgü Spike genleri, Envelope geni ile birlikte pVitro2 ekspresyon vektörüne klonlandı. Bu vektörlerin Hek293 süspansiyon hücrelerine transfeksiyonu, süpernatantta VLP birikmesiyle sonuçlandı. Burada, Alpha (B.1.1.7) ve Delta plus (B.1.617.2.1) VOC'larından türetilen Spike versiyonlarının ifade edildiği VBPlerin üretiminin uygulanabilirliğini gösteriyoruz. Ayrıca, yalancı tip virüs nötralizasyon analizi oluşturduk ve analizin kullanılabilirliğini Delta plusS-6p-VLP veya AlphaS-6p-VLP aşıları ile aşılanmış gönüllülerden ve farelerden alınan serumları kullanarak test ettik.
Özet (Çeviri)
Vaccines are one of the most important public health interventions to combat the spread of infectious diseases. All currently approved COVID-19 vaccines target Spike antigen derived from the authentic Wuhan strain. However, with the emergence of new variants effectiveness of the current vaccines declined, commensurate to their ability to generate neutralizing antibodies against some variants of concern (VOC). Since new VOCs are predicted to emerge the next 2-4 years, variant specific vaccines are urgently needed. In this study, we aimed to design vaccine antigens against Delta plus (B 1.617.2.1) and Alpha (B.1.1.7) variants of concern by exploiting the Virus Like Particle (VLP) vaccine platform. Consequently, these variant specific VLPs were formed by assembling the Membrane (M), Nucleocapsid (N), Envelope (E) proteins of the authentic virus and Spike (S) proteins bearing mutations of Delta plus (B 1.617.2.1) and Alpha (B.1.1.7) variants of concern. For this, the M and N genes were cloned into the pVitro1 expression vector, whereas variant specific Spike genes were cloned together with the Envelope gene into the pVitro2 expression vector. Transfection of these vectors to Hek293 suspension cells resulted in VLP accumulation in the supernatant. Herein, we demonstrate the feasibility of producing variant spike expressing VLPs derived from Alpha (B.1.1.7) and Delta plus (B.1.617.2.1) VOCs. Furthermore, we established a pseudotyped virus neutralization assay and tested its utility using sera taken from volunteers and mice immunized with Delta plusS-6p-VLP or AlphaS-6p-VLP vaccines.
Benzer Tezler
- Large-scale manufacturing and characterization of a SARSCOV-2 virus-like particle vaccine adsorbed onto alhydrogel and adjuvanted with K3 CPG oligodeoxynucleotide for phase 1/2 clinical trials
SARSCOV-2 pandemisine karşı virüs benzeri parçacık temelli, alum absorbe ve K3 CPG olıgodeoksinükleotid adjuvantlı aşı adayının faz 1/2 klinik deneyler için üretimi ve incelenmesi
ARTUN BÜLBÜL
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Allerji ve İmmünolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İHSAN GÜRSEL
- Development and immunological evaluation of SARS-CoV-2 virus-like particles (VLP) expressing the prefusion stabilized variants of the spike protein
Prefüzyon stabilize Spike proteini varyantlarını taşıyan SARS-CoV-2 virüs benzeri parçacıkların geliştirilmesi ve immünolojik değerlendirilmesi̇
EMRE MERT İPEKOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Allerji ve İmmünolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAYDA GÜRSEL
- Membran biyoreaktörlerde (MBR) tıkanmaların önlenmesi için yetersayı etkisinin azaltılması (Quorum quenching) mekanizmasının kullanılması
Using Quorum quenching mechanism to prevent fouling in membran bioreactors
MELTEM AĞTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL KOYUNCU
- İnşaat firmalarının kriz yönetim yaklaşımları ve liderlik stilleri: COVID-19 küresel salgın krizi örneği
Crisis management approaches and leadership styles in construction companies: Example of COVID-19 global pandemic crisis
GÖZDE CEYLAN ERASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMRAH ACAR
- Generation of plasmid-based eukaryotic model to investigate biology of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus nucleoprotein and glycoproteins
Kırım Kongo kanamalı ateşi virüsü nükleoproteinin ve glikoproteinlerinin biyolojisinin çalışılmasında plazmit temelli ökaryotik model oluşturulması
NESİBE SELMA ÇETİN
Doktora
İngilizce
2023
BiyoteknolojiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ZİYA DOYMAZ