Bazı yeni paladyum (Pd (II)) ve bakır (Cu(II)) bileşiklerinin in vitro ve in silico değerlendirilmesi; sitotoksik etkiler, DNA kesimi ve moleküler kenetleme
In vitro and in silico evaluation of some new palladium (Pd (II)) and copper (Cu(II)) compounds; cytotoxic effects, DNA cleavage and molecular docking
- Tez No: 717948
- Danışmanlar: PROF. DR. BERRİN TÜYLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Moleküler Tıp, Biology, Biotechnology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
İlaç keşfi alanında yenilikçi yaklaşımların geçerliliği günden güne artarken, antikanser özellikli ilaçların geliştirilmesi adına yeni çalışmalar yapılmaktadır. Bu tez kapsamında, yeni sentezlenen Paladyum (Pd(II)) ve Bakır (Cu(II)) bileşiklerinin, DNA molekülü üzerinde moleküler kenetleme, pUC19 plazmid DNA'sı üzerinde kesme ve HCC1428 hücre hattı üzerinde MTT testi ile sitotoksik etkisi incelenmiştir. Bu yeni bileşiklerin kenetleme simülasyonlarında DNA yapısı ile moleküller arası bağlar yaptığı, pUC19 plazmidi üzerindeki DNA kesimi deneylerinde belirli konsantrasyonlarda DNA hasarına ve fragmentasyonuna neden olduğu, HCC1428 hücreleri üzerinde yapılan MTT testi ile de çalışılan bütün doz ve inkübasyon sürelerinde anlamlı bir sitotoksik aktivitesi olduğu belirlenmiştir. Bu sitotoksik aktivitelere paralel olarak IC50 değerleri hesaplanmıştır. DNA kesimi deneylerinde ise Sisplatin ve Karboplatin antikanser özellikli ajanlar kontrol olarak kullanılmış ve DNA üzerinde benzer sonuçlar elde edilerek, fragmentasyon sonucu oluşan bantlar agaroz jel elektroforezi tekniği ile görüntülenmiştir. Bileşiklerin moleküler kenetleme simülasyonlarında ise bağlanma afinitelerinin yüksek olduğu saptanmış ve bağlanma anındaki görüntüleri şekiller olarak gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
While the validity of innovative approaches in the field of drug discovery is increasing day by day, new studies are carried out to develop drugs with anticancer properties. Within the scope of this thesis, the cytotoxic effects of newly synthesized Palladium (Pd(II)) and Copper (Cu(II)) compounds were investigated by molecular docking on DNA molecule, cleavage on pUC19 plasmid DNA and cytotoxic effects on HCC1428 cell line by MTT assay. It was determined that these new compounds made intermolecular bonds with the DNA structure in docking simulations, caused DNA damage and fragmentation at certain concentrations in DNA cleavage experiments on pUC19 plasmid, and had a significant cytotoxic activity at all doses and incubation times studied with MTT assay performed on HCC1428 cells. Parallel to these cytotoxic activities, IC50 values were calculated. In DNA cleavage experiments, Cisplatin and Carboplatin anticancer agents were used as controls and similar results were obtained on DNA, and bands formed as a result of fragmentation were visualized by agarose gel electrophoresis technique. In the molecular docking simulations of the compounds, the binding affinities were found to be high and the images at the time of binding are shown as figures.
Benzer Tezler
- Bazı antienflamatuar ilaçların ve retinoik asitin Cu(II), Zn(II), Pt(II) ve Pd(II) metal komplekslerinin sentezi, karakterizasyonu ve DNA'ya bağlanabilme özelliklerinin incelenmesi
Synthesis, characterization, and DNA binding properties of Cu(II), Zn(II), Pt(II) and Pd(II) metal complexes of some anti-inflammatory drugs and retinoic acid
HARUN MUSLU
Doktora
Türkçe
2017
KimyaKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞEGÜL GÖLCÜ
- 1,3-BIS(2-alkoxyaryl) imidazolidine-2-ylidene complexes of platinum metals
Platin metallerinin 1,3-BİS(2-alkoksiaril) imidazolidin-2-ilinden kompleksleri
EMİN GÜNAY
- Çeşitli kanser hücreleri üzerinde sitotoksik etkili paladyum türevlerinin moleküler etki mekanizmalarının aydınlatılması
Elucidation of molecular action mechanisms of cytotoxic palladium derivatives on various cancer cells
ÖMER KAÇAR
Doktora
Türkçe
2016
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA
DOÇ. DR. CEYDA AÇILAN AYHAN
- Pd(II) and Pt(II) coordination compounds of novel schiff base ligands incorporating aromatic ring
Aromatik halka içeren yeni schiff bazı ligandlarının Pd(II) ve Pt(II) koordinasyon bileşikleri
MUSTAFA MUNDHER KHALAF AL-AZZAWI
- Perfloro sübstitüe tiyofen ligandlarının rodyum ve paladyum komplekslerinin sentezi ve süperkritik karbondioksit ortamında bazı olefinlerin hidrojenasyon tepkimelerine katalitik etkilerinin incelenmesi
Synthesis of perfluoro substitued thiophene ligand based rhodium and palladium complexes and investigating their catalytic activities by hydrogenation on some olefins in supercritical carbondioxide media
HAKAN ÜNVER
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Bilim ve TeknolojiAnadolu ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FİLİZ YILMAZ
