Farklı klinik örneklerden izole edilen virülans ve antibiyogram profili ile E. Coli'nin filogenetik gruplaşmasının uygunluğu
Correspondance of phylogenetic grouping of E. Coli with virulence and antibiogram profile isolated from different clinical samples
- Tez No: 726002
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Escherichia coli, filogrup tipi veya biyofilm varlığı ve dolayısıyla patojenite adası gibi patogenez sürecine müdahale eden birçok faktörün bulunduğu, insan dahil olmak üzere hayvanlarda ciddi patojenezlere neden olan gram negatif bir bakteridir. Bakteri, idrar, dışkı ve hastane gibi farklı kaynaklardan alınan örneklerden izole edilmiştir. İzolasyon işlemi, izolatların laboratuarda seçici ve diferansiyel besiyerlerine yerleştirlmeleri ve aşılamada kullandığımız API20 gibi sıradan yöntemlerle yapılmıştır. Moleküler yöntemlerde ise (chuA, yjaA ve tsE4) genlerini bulmak için PCR kullanılmıştır. Bu çalışmada B2 (%70) en yüksek filogenetik gruplandırmayı gösterirken D en düşük (%0) gruplandırma oranına sahip olmuştur. Biyofilmde ise üç kategori ortaya çıkmıştır. Bunlar %50'den fazla olan güçlü, %43,3 orta ve %3,4 zayıf olarak belirlenmiştir. E. coli'nin Antibiyogramı incelendiğinde, antibiyotiklere karşı fazla direnç gösterdiği ortaya çıkmıştır. Belirlenen direnç oranları bakterilerin elde edildiği kaynaklara göre farklı değerler almıştır. Bunlar; İdrar izolatlarında %40 iken, dışkı ve hastane izolatlarında sadece %5,7 oranında tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Escherichia coli is a gram-negative bacterium that causes severe pathogenesis in animals, including humans, with many factors interfering with the pathogenesis process, such as the phylogroup type or the presence of biofilms and thus the pathogenicity island. The bacteria has been isolated from samples taken from different sources such as urine, feces, and hospitals. The isolation process was carried out by placing the isolates in selective and differential media in the laboratory and using ordinary methods such as API20, which we used for inoculation. In molecular methods, PCR was used to find genes (chuA, yjaA and tsE4). In this study, B2 (70%) showed the highest phylogenetic grouping, while D had the lowest (0%) grouping rate. Three categories emerged in biofilm. These were determined as more than 50% strong, 43.3% moderate and 3.4% weak. When the Antibiogram of E. coli was examined, it was revealed that it showed high resistance to antibiotics. The determined resistance rates took different values according to the sources from which the bacteria were obtained. These; While it was 40% in urine isolates, it was detected only 5.7% in stool and hospital isolates.
Benzer Tezler
- Gıda ve klinik örneklerden izole edilen koagülaz pozitif ve koagülaz negatif stafilokokların bazı virulens özellikleri ve antibiyotik dirençliliklerinin karşılaştırılması
Food and clinical isolates of coagulase positive and coagulase negative staphylococcus to compare some of virulence properties and antibiotic resistances
SAFİYE AKGÜN
- Ekstraintestinel enfeksiyonlardan izole edilen ve virulans faktörleri tanımlanan E.coli suşlarının filogenetik ilişkilerinin tespitinde rapd yönteminin önemi
Significance of rapd method for the detection of filogenetic relation between virulance factors identified E.coli strains isolated from extraintestinal infections
BAŞAK BEDİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen hipervirülan ve klasik klebsiella pneumoniae izolatlarında virülans genleri ve karbapenem direnç genlerinin araştırılması
Investigation of virulence genes and carbapenem resistance genes in hypervirulent and classical klebsiella pneumoniae isolates isolated from various clinical specimens
MERVE YÜREK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
MikrobiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURAL CEVAHİR
- Diyala (Irak) şehrindeki farklı klı̇nı̇k kaynaklardan ı̇zole edı̇len pseudomonas aerugınosa'da bazı dı̇renç ve vı̇rülans genlerı̇nı̇n moleküler tespı̇tı̇
Molecular determination of some resistance and virulance genes in pseudomonas aeruginosa isolated from different clinical sources in Di̇yala (Iraq)
OMAR HUSSEIN ALI AL-OBAIDY
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
MikrobiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞENUR KAYABAŞ AVŞAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALYAA ABDELHAMEED
- Klinik Enterobacteriaceae izolatlarında fosfomisin direncinin moleküler epidemiyolojisi ve biyolojik özelliklere etkisi
Molecular epidemiology of fosfomycin resistance and effect on biological properties in clinical Enterobacteriaceae isolates
MUSTAFA ÖKEER
Doktora
Türkçe
2023
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAYRI ERAÇ