Geri Dön

Farklı klinik örneklerden izole edilen virülans ve antibiyogram profili ile E. Coli'nin filogenetik gruplaşmasının uygunluğu

Correspondance of phylogenetic grouping of E. Coli with virulence and antibiogram profile isolated from different clinical samples

  1. Tez No: 726002
  2. Yazar: DHURGHAM ABDULKADHIM ALFARHAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Escherichia coli, filogrup tipi veya biyofilm varlığı ve dolayısıyla patojenite adası gibi patogenez sürecine müdahale eden birçok faktörün bulunduğu, insan dahil olmak üzere hayvanlarda ciddi patojenezlere neden olan gram negatif bir bakteridir. Bakteri, idrar, dışkı ve hastane gibi farklı kaynaklardan alınan örneklerden izole edilmiştir. İzolasyon işlemi, izolatların laboratuarda seçici ve diferansiyel besiyerlerine yerleştirlmeleri ve aşılamada kullandığımız API20 gibi sıradan yöntemlerle yapılmıştır. Moleküler yöntemlerde ise (chuA, yjaA ve tsE4) genlerini bulmak için PCR kullanılmıştır. Bu çalışmada B2 (%70) en yüksek filogenetik gruplandırmayı gösterirken D en düşük (%0) gruplandırma oranına sahip olmuştur. Biyofilmde ise üç kategori ortaya çıkmıştır. Bunlar %50'den fazla olan güçlü, %43,3 orta ve %3,4 zayıf olarak belirlenmiştir. E. coli'nin Antibiyogramı incelendiğinde, antibiyotiklere karşı fazla direnç gösterdiği ortaya çıkmıştır. Belirlenen direnç oranları bakterilerin elde edildiği kaynaklara göre farklı değerler almıştır. Bunlar; İdrar izolatlarında %40 iken, dışkı ve hastane izolatlarında sadece %5,7 oranında tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

Escherichia coli is a gram-negative bacterium that causes severe pathogenesis in animals, including humans, with many factors interfering with the pathogenesis process, such as the phylogroup type or the presence of biofilms and thus the pathogenicity island. The bacteria has been isolated from samples taken from different sources such as urine, feces, and hospitals. The isolation process was carried out by placing the isolates in selective and differential media in the laboratory and using ordinary methods such as API20, which we used for inoculation. In molecular methods, PCR was used to find genes (chuA, yjaA and tsE4). In this study, B2 (70%) showed the highest phylogenetic grouping, while D had the lowest (0%) grouping rate. Three categories emerged in biofilm. These were determined as more than 50% strong, 43.3% moderate and 3.4% weak. When the Antibiogram of E. coli was examined, it was revealed that it showed high resistance to antibiotics. The determined resistance rates took different values according to the sources from which the bacteria were obtained. These; While it was 40% in urine isolates, it was detected only 5.7% in stool and hospital isolates.

Benzer Tezler

  1. Gıda ve klinik örneklerden izole edilen koagülaz pozitif ve koagülaz negatif stafilokokların bazı virulens özellikleri ve antibiyotik dirençliliklerinin karşılaştırılması

    Food and clinical isolates of coagulase positive and coagulase negative staphylococcus to compare some of virulence properties and antibiotic resistances

    SAFİYE AKGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NESLİHAN GÜNDOĞAN

  2. Ekstraintestinel enfeksiyonlardan izole edilen ve virulans faktörleri tanımlanan E.coli suşlarının filogenetik ilişkilerinin tespitinde rapd yönteminin önemi

    Significance of rapd method for the detection of filogenetic relation between virulance factors identified E.coli strains isolated from extraintestinal infections

    BAŞAK BEDİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATİH KÖKSAL

  3. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen hipervirülan ve klasik klebsiella pneumoniae izolatlarında virülans genleri ve karbapenem direnç genlerinin araştırılması

    Investigation of virulence genes and carbapenem resistance genes in hypervirulent and classical klebsiella pneumoniae isolates isolated from various clinical specimens

    MERVE YÜREK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAL CEVAHİR

  4. Diyala (Irak) şehrindeki farklı klı̇nı̇k kaynaklardan ı̇zole edı̇len pseudomonas aerugınosa'da bazı dı̇renç ve vı̇rülans genlerı̇nı̇n moleküler tespı̇tı̇

    Molecular determination of some resistance and virulance genes in pseudomonas aeruginosa isolated from different clinical sources in Di̇yala (Iraq)

    OMAR HUSSEIN ALI AL-OBAIDY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞENUR KAYABAŞ AVŞAR

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ALYAA ABDELHAMEED

  5. Klinik Enterobacteriaceae izolatlarında fosfomisin direncinin moleküler epidemiyolojisi ve biyolojik özelliklere etkisi

    Molecular epidemiology of fosfomycin resistance and effect on biological properties in clinical Enterobacteriaceae isolates

    MUSTAFA ÖKEER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAYRI ERAÇ