Türkiye yerli tavuk ırklarındaki ALV-E alt tiplerinin belirlenmesi
Determination of ALV-E subtypes of Turkey indigenous chicken breeds
- Tez No: 727339
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUHAMMET KAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Hayvansal Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 115
Özet
Yerli hayvan ırkları, asırlar boyu bulundukları bölgenin her türlü çevre koşuluna uyum sağlamış, birçok hastalığa karşı direnç kazanarak günümüze kadar varlıklarını sürdürmüşlerdir. Denizli ve Gerze (Hacı Kadın) Türkiye'nin önemli yerli tavuk ırklarıdır. ALV, galliform kuşları enfekte eden bir alfaretrovirüstür ve hem eksojen hem de endojen aktiviteye sahip olarak bilinen tek tavuk (Gallus gallus) retrovirüsüdür. ALV, konakçı aralığı, antikor nötralizasyonu ve reseptör müdahalesi çalışmalarına dayalı olarak, altı alt grupta (A– E ve J) sınıflandırılmıştır. Bu alt gruplardan beşi eksojen (ALVA'dan ALVD' ya kadar ve ALVJ), diğer alt grup olan ALVE ise endojen kuş virüsüdür. Tam endojen retrovirüsler (ERV), konakçı genomundaki entegrasyon noktasında özdeş olan iki uzun terminal tekrarı (LTR) ile çevrelenmiş retroviral proteinlerin (gag, pol ve env) korunmuş bir yapısını oluşturur. Türkiye yerli tavuk ırkları olan Denizli ve Gerze popülasyonlarından 175 örnek kullanılarak yapılan çalışmada örneklerin ALVE (1, 9, 12, 15, 21, B5, TYR ve NSCA) lokuslarını taşımadıkları, ALVE3 ve ALVE6 lokuslarını ise taşıdıkları belirlenmiştir. ALVE6 lokusu sadece Gerze populasyonuda gözükürken ALVE6 taşıyan Gerze tavuklarının frekansı 0,6154 olarak hesaplanmıştır. ALVE3 lokusu taşıyan tavukların frekansı Denizli popülasyonunda 0,9799 iken Gerze populasyonuda 0,5577 olarak hesaplanmıştır.
Özet (Çeviri)
Native animal breeds have adapted to all kinds of environmental conditions of the region they are in for centuries, and have survived until today by gaining resistance against many diseases. Denizli and Gerze (Hacı Kadın) are important native chicken breeds of Turkey. ALV is an alpharetrovirus that infects galliform birds and is the only chicken (Gallus gallus) retrovirus known to have both exogenous and endogenous activity. ALV has been classified into six subgroups (A – E and J) based on studies of host range, antibody neutralization and receptor interference. Five of these subgroups are exogenous (ALVA to ALVD and ALVJ), while the other subgroup, ALVE, is endogenous avian virus. Intact endogenous retroviruses (ERV) form a conserved structure of retroviral proteins (gag, pol and env) flanked by two long terminal repeats (LTRs) that are identical at the point of integration in the host genome. The study was conducted by using 175 chickens from Denizli and Gerze populations, which are domestic chicken breeds of Turkey. The domestic breeds did not carry ALVE (1, 9, 12, 15, 21, B5, TYR and NSCA) loci, but they carried ALVE3 and ALVE6 loci. While the ALVE6 locus was only seen in the Gerze population, the frequency of Gerze chickens carrying ALVE6 was calculated as 0.6154. While the frequency of chickens carrying ALVE3 locus was 0.9799 in Denizli population, in Gerze population it was calculated as 0.5577.
Benzer Tezler
- Türkiye'deki yerli tavuk ırkları ve ticari tavuk tipleri arasındaki, MHC gen bölgesindeki, genetik farklılıkların belirlenmesi
Determination of genetic diversity in MHC gene region between commercial chicken types and indigenous chicken breeds in turkey
ÖMER FARUK LENGER
Doktora
Türkçe
2011
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMedikal Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. METİN ERDOĞAN
- Denizli tavuk populasyonunda mitokondriyal DNA D-loop polimorfizmi
Mitochondrial DNA D-loop polymorphism in Denizli chicken population
HULUSİ OZAN TAŞKESEN
- Türkiye'deki sultan ırkı tavuk popülasyonlarının mtDNA dizi analizine dayalı genetik karakterizasyonu
Genetic characterization of sultan breed chicken populations in Turkey based on mtDNA sequence analysis
KEMAL ESKİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DEMİR ÖZDEMİR
- Denizli ve Gerze tavuk populasyonlarındaki genetik çeşitliliğin bazı mikrosatelit markörler kullanılarak belirlenmesi
Determination of genetic variation by using some microsatellite markers in Denizli and Gerze poultry populations
MUHAMMET KAYA
- Kuzu ve oğlakların ağız bölgesinde orf virus (Ektima) nedeniyle meydana gelen dudak lezyonlarının moleküler ve virolojik yönden araştırılması ve papilend™ krem ile tedavi sürecinin incelenmesi
Investigation of molecular and virological of lip lesions caused by orf virus (Ecthyma) in mouth side of lamb and goat kids and examination of the papilend™ cream treatment process
GÜLER BERAT KAYA
Doktora
Türkçe
2022
Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiViroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KALE