Geri Dön

Biyosistemlerle uyumlu polimerlere yönelik hesapsal yaklaşımlar

Computational approaches for biopolymers compatible with biosystems

PDF İndir

  1. Tez No: 728676
  2. Yazar: SEMA NUR BOZTEPE
  3. Danışmanlar: PROF. DR. CENK SELÇUKİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Biyopolimerler, Biyouyumluluk, Epiklorhidrin, Hidrojeller, Moleküler modelleme, Polimer jel, Polimerler, Siklodekstrinler, Yoğunluk fonksiyonu teorisi, Biopolymers, Biocompatibility, Epichlorhydrin, Hydrogels, Molecular modeling, Polymer gel, Polymers, Cyclodextrins, Density function theory
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Malzeme uygulamaları için yenilenebilir kaynaklardan türetilen çok çeşitli doğal olarak oluşan polimerler mevcuttur. Selüloz ve nişasta gibi bunlardan bazıları bugün ürünlerde aktif olarak kullanılırken, birçoğu yeterince kullanılmamaktadır. Temel biyosentetik yolakların ve bu yolakları genetik manipülasyonlar yoluyla modüle etme veya uyarlama seçeneklerinin anlaşılmasındaki hızlı ilerlemeyle, yenilenebilir kaynaklardan polimerlerin kullanımı için yeni fırsatlar düşünülmektedir (Kaplan, 1998). Bu tez için hidrojel oluşumu seçildi. Polimerizasyon için monomerolarakbetasiklodekstrin ve çapraz bağlayıcı olarak epiklorohidrin seçildi. Polimerizasyon basamakları sırasında oluşan yapıların konformasyonel analizi için Spartan 16 programı kullanıldı. Daha sonra bu yapıların optimizasyonu yarı ampirik yöntemler kullanılarak MOPAC2016 programı yardımıyla yapıldı. Burada elde edilen yapılar arasından seçilecek kararlı sistemler için sonraki aşamalarda Yoğunluk Fonksiyoneli Teorisi (Density Functional Theory, DFT) yaklaşımı kullanıldı. Dispersif etkileşimleri dikkate alan ωB97XD fonksiyoneli 6-31+G(d,p) baz seti ile birlikte hesaplamalar için seçildi. Bütün optimizasyonlar öncelikle suda yapıldı, hesaplamalar Polarizable Continuum Model (PCM) kullanılarak çözücü ortamında tekrar edildi.

Özet (Çeviri)

A wide variety of naturally occurring polymers derived from renewable resources are available for material applications. While some of these, such as cellulose and starch, are actively used in products today, many of them are not used enough. With rapid progress in the understanding of key biosynthetic pathways and the options to modulate or adapt these pathways through genetic manipulations, new opportunities are being considered for the use of polymers from renewable resources (Kaplan, 1998). Hydrogel formation was chosen for this thesis. Betacyclodextrin was chosen as monomer and epichlorohydrin as crosslinker for polymerization. Spartan 16 program was used for the conformational analysis of the structures formed during the polymerization steps. Later, these structures were optimized using semiempirical methods with the help of the MOPAC2016 program. Density Functional Theory (DFT) approach was used in the next steps for the stable systems to be selected among the structures obtained here. The ωB97XD functional, which takes into account dispersive interactions, was selected for calculations with the base set 6-31+G(d,p). All optimizations were performed primarily in water, and the calculations were repeated in solvent medium using the Polarizable Continuum Model (PCM).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    636048

    Poli(metil vinil eter-alt-maleik anhidrit)-pregabalin ilaç taşıma sisteminin sentezlenmesi ve karakterizasyonu

    Synthesis and characterization of poly (methyl vinyl ether-alt-maleic anhydride)-pregabalin drug delivery system

    KADİR ÇAKIRAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Polimer Bilim ve TeknolojisiYıldız Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DOLUNAY ŞAKAR DAŞDAN

  2. Tez No

    121271

    PV (photo-voltaic) temelli enerji sistemleri ve ülkemiz için bir güneş santrali modellemesi

    Photo-voltaic sourced energy systems and a solar power plant for our country

    BARIŞ KÖKDEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    EnerjiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Enerji Sistemleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HAKAN HOCAOĞLU

    YRD. DOÇ. DR. GÖKHAN ÖZER

  3. Tez No

    442643

    Doğal hidroksiapatit toz üretimi, karakterizasyonu ve antibakteriyel özelliklerinin belirlenmesi

    Natural hydroxyapatite powder production characterization and determination of antibacterial properties

    SERDAR GÖKHAN AKÇA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Mühendislik BilimleriSakarya Üniversitesi

    İmalat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİH ÇALIŞKAN

  4. Tez No

    468001

    Tümleyen yarık halka elemanlarını temel alan implant anten tasarımı ve üretimi

    Implantable antenna design and fabrication based on complement split ring elements

    MERVE USLUER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiAkdeniz Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SIDDIK CUMHUR BAŞARAN

  5. Tez No

    921131

    Damlacık temelli bir mikroakışkan sistemde akış koşullarının hücre enkapsülasyonu için optimizasyonu ve hücre dağılımının stokastik analizi

    Optimization of flow conditions in a droplet based microfluidic system for cell encapsulation and stochastic analysis of cell distribution

    ELİF GÖKÇEN DİLCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Kimya MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELİS ÖNEL KAYRAN

Geri Dön