Geri Dön

30 InDel lokusunun zamana ve sıcaklığa bağlı stabilitesinin araştırılması

Investigation of the time and temperature stability of 30 InDel locus

  1. Tez No: 729595
  2. Yazar: TOYGÜN ANIL ÖZESEN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BEHNAN ALPER
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Adli Tıp, Forensic Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Adli Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 66

Özet

Amaç: DNA profilleme teknikleri, adli kimliklendirme gerektiren ya da delil ile kişi arasında direkt bağlantının araştırıldığı olayların tamamında kullanılabilmektedir. Adli amaçlı DNA incelemeleri için birçok farklı materyal (saç/kıllar, kan, idrar, semen ve diğer biyolojik sıvılar ile bunlara ait lekeler) kullanılmaktadır. Adli DNA laboratuvarlarında çalışılan olay yeri kaynaklı biyolojik örnekler, çoğunlukla idealden çok daha az miktarda ve çevresel koşullardan olumsuz etkilenmiş şekilde olmaktadır. Bazı durumlarda olay yerinin tespiti saatler, günler hatta yıllar sürebilmektedir. Bu nedenle olay yerinde bulunan biyolojik materyaller hem zamana hem de olay yerinin olumsuz çevresel koşullarına maruz kalmaktadır. Bu çalışma ile üzerinden uzun süre geçen biyolojik materyaller üzerinde 30 InDel lokusu genotiplendirilerek, bu lokuslarının zamana ve sıcaklığa bağlı stabilitelerinin belirlenmesi ve diğer DNA profilleme yöntemleriyle karşılaştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada sıcaklık ve zamanın Indel lokuslarınının stabilitesine etkisini araştırmak amacıyla, 25 yıl önce sağlık çalışanlarından oluşan sağlıklı gönüllülerden alınmış kan örneklerinden, steril gazlı bez üzerine damlatılarak hazırlanmış; +4°C, oda sıcaklığı (22-25°C) ve +37°C (Etüv)'de saklanmış, toplam 33 adet kan lekesi ve referans olarak güncel tarihli kan örnekleri kullanılmıştır. Bulgular: Örnekler üzerinde yapılan kantitasyon çalışmasında; oda sıcaklığı için ortalama DNA miktarının 0,168 ng/μl, +4°C'için ortalama DNA miktarının 0,205 ng/μl olduğu, referans örnekleri için ortalama DNA miktarının 0,938 ng/μl olduğu, 37 °C için ise çalışılan tüm örneklerde DNA miktarının tespit edilebilir düzeyin altında olduğu görüldü. Çalışmamızda, tek tek lokus bazında incelediğimizde bazı lokusların diğerlerine göre daha az stabil olduğu görülmektedir. Stabilite fragman uzunluğu ile doğrudan etkili olduğundan daha spesifik değerlendirme için aynı uzunlukta olanlar arasında bir karşılaştırma yaptığımızda, çalışılan örneklerden sadece ikisinde 140bp altında fragmana sahip lokus saptanamamıştır. Bunlardan biri fragman uzunluğu 108-113 bp olan HLD99 lokusu, diğeri ise fragman uzunluğu 113-121 bp olan HLD128 lokusudur. Tanımlama yapılamayan diğer lokusların tamamı 140 bp ve üzerinde fragman uzunluğuna sahiptir. Bu durum örneklerde fragmantasyonun 140bp uzunluğuna kadar azaldığını göstermektedir. Kit içinde bulunan 140-158 bp uzunluğundaki nispeten daha uzun fragmanlı lokuslar incelendiğinde, en fazla kaybın HLD 67, ardından HLD81 ve üçüncü olarak HLD84 olduğu görülmektedir. Sonuç: 25 yılın üzerinde uzun yıllar eski kan lekelerinde, özellikle doğrudan uzun süre herhangi bir yapay ısıya veya güneş ışığına maruz kalmamışsa ve özellikle kapalı alanlarda kalmış örneklerde genel olarak Investigator Diplex kit ile 30 Indel lokusunun başarılı bir şekilde analiz edilebileceği anlaşılmaktadır.

Özet (Çeviri)

Objective: DNA profiling techniques can be used in all cases that require forensic identification or where a direct link between the evidence and the person is investigated. Many different materials (hair/hairs, blood, urine, semen and other biological fluids and their stains) are used for forensic DNA analysis. Crime scene-derived biological samples studied in forensic DNA laboratories are often much less than ideal and negatively affected by environmental conditions. In some cases, the detection of the crime scene can take hours, days or even years. For this reason, biological materials found at the crime scene are exposed to both time and adverse environmental conditions of the crime scene. In this study, it was aimed to genotype 30 InDel loci on biological materials that have passed for a long time, to determine the time and temperature stability of these loci and to compare them with other DNA profiling methods. Materials and Methods: In this study, blood samples taken from healthy volunteers in 1996, dried on gauze and stored in 3 different ambient conditions were used to investigate the effects of temperature and time on the stability of Indel loci. These blood samples were stored at +4°C, room temperature (22-25°C) and +37°C (oven) for 25 years. Among the stored samples, those whose current dated reference samples could be accessed were included in the study. A total of 33 blood stains and current dated blood samples were used as reference. Results: In the quantitation study on the samples; At room temperature, the average DNA amount is 0.168 ng/μl, for +4°C the average DNA amount is 0.205 ng/μl, for reference samples the average DNA amount is 0.938 ng/μl, and for 37 °C, the DNA amount can be detected in all samples studied. was found to be below the level. In our study, when we analyze it on the basis of loci one by one, it is seen that some loci are less stable than others. When we make a comparison between the stability fragment length and those of the same length for more specific evaluation, since it is directly effective, loci with fragments below 140bp could not be detected in only two of the studied samples. One is the HLD99 locus with a fragment length of 108-113 bp, and the other is the HLD128 locus with a fragment length of 113-121 bp. All other unidentified loci have fragment lengths of 140 bp or more. This indicates that the fragmentation in the samples is reduced up to 140bp length. Examining the 140-158 bp long fragmented loci with relatively longer fragments included in the kit, it is seen that HLD 67 lost the most, followed by HLD81 and thirdly by HLD84. Conslusion: It is understood that 30 Indel loci can be successfully analyzed with the Investigator Diplex kit in blood stains that have been kept for more than 25 years, especially if they have not been directly exposed to any artificial heat or sunlight for a long time (especially in samples left in closed areas).

Benzer Tezler

  1. Yeni Cami'nin akustik açıdan performans değerlendirmesi

    Evaluation of the acoustical performance of the New Mosque

    EVREN YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Mimarlıkİstanbul Teknik Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVTAP YILMAZ DEMİRKALE

  2. İnsersiyon/delesyon (InDel) lokuslarına ait kimliklendirme panelinin geliştirilmesi ve validasyonu

    Development and validation of the identification panel for insertion/deletion (InDel) locus

    ARZU DÜVENCİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖNÜL FİLOĞLU TÜFEK

  3. Obez ve nonobez tip 2 diyabetli hastalarda serum adipositokin düzeylerinin karşılaştırılması

    Comparison of serum adipocytokine levels in obese and non-obese type 2 diabetic patients

    MEHMET KARA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyokimyaEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEMA USLU

  4. İnterkondiler notch ile ön ve arka çapraz bağ volüm ilişkisi

    Başlık çevirisi yok

    NUMAN İLTERİŞ ÇEVİK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Radyoloji ve Nükleer TıpSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Radyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEMRA DURAN

  5. Tek taraflı üreteropelvik darlık oluşturulan sıçanlarda enalaprilin renal rezistif indeks, idrar elektrolitleri ve böbrek dokusu TGF ß-1 düzeylerine etkisi

    The effect of enalapril on the renal resistive index measurements, urine electrolytes and renal TGF ß-1 levels in a rat model of unilateral ureteropelvic obstruction

    SÜLEYMAN CÜNEYT KARAKUŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Çocuk CerrahisiGazi Üniversitesi

    Çocuk Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZAFER TÜRKYILMAZ