Geri Dön

Entomopatojen funguslara ait hidrofobin genlerinin araştırılması, hidrofobin-infektivite ilişkisinin belirlenmesi ve in vitro sistemde ifadesi

Investigation of hydrophobin genes of entomopathogenic fungi, determination of hydrophobin-infectivity relationship and expression in the in vitro system

PDF İndir

  1. Tez No: 729880
  2. Yazar: DİLEK CİVELEK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 105

Özet

Hidrofobinler, moleküler kütlesi yaklaşık 10 kDa olan filamentli funguslarda üretilen sistein açısından zengin, amfipatik proteinlerdir. Bu özelliklerinden dolayı yüzey kaplamaları, biyosensörler, rekombinant proteinlerin saflaştırılması ve kendi kendini temizleyen yüzeyler gibi birçok endüstriyel uygulamada önemli rol oynarlar. Bu tezde, entomopatojenik funguslarda (EPF) bulunan hidrofobin genlerinin belirlenmesi, hidrofobin özellikleri ile insektisidal özelliklerin karşılaştırılması ve seçilen hidrofobin geninin Pichia pastoris maya sisteminde ifade edilerek endüstriyel kullanıma hazırlanması amaçlanmıştır. Bu amaçla Karadeniz Teknik Üniversitesi fungus koleksiyonundan elde edilen 20 adet entomopatojenik fungus izolatında hidrofobin geninin varlığı araştırılmış ve bu izolatların 14'ünde hidrofobin geni (hyd) tespit edilmiştir. hyd taşıyan tüm izolatların sınıf I hidrofobin grubuna ait oldukları belirlenmiştir. Hidrofobin geni ihtiva eden entomopatojenik funguslar değerlendirildiğinde, insektisidal aktivite, morfolojik özellikler, hızlı büyüme, konak spektrumu, konak yüzeylerindeki adhezyon derecesi ve yüksek mortaliteye sahip olma özellikleri göz önünde bulundurulduğunda Beauveria bassiana KTU-57 izolatına ait hidrofobin geninin P. pastoris maya sisteminde ifade edilmesine karar verildi. Bu doğrultuda fungal genomdan ribozomal RNA elde edilerek revers transkriptaz enzimi ile cDNA'sı oluşturuldu. RT-PCR (Reverse Transcriptase-Ters Transkriptaz) ile elde edilen hidrofobin geni, pPICZC vektörüne klonlandı ve rekombinant maya vektörünün (pPICZC+hyd) P. pastoris X-33 gen ifade konağında ifadesi sağlandı. Önemli miktarda protein ifadesi gerçekleştirilmiş olmakla birlikte hidrofobin proteinin endüstriyel amaçlı kullanılması için üretim kapasitesinin arttırılmasına yönelik optimizasyon çalışmaları devam etmektedir.

Özet (Çeviri)

Hydrophobins are cysteine-rich, amphipathic proteins produced in filamentous fungi with a molecular mass of about 10 kDa. Because of these properties, they play an important role in many industrial applications such as surface coatings, biosensors, purification of recombinant proteins and self-cleaning surfaces. In this thesis, it was aimed to determine the hydrophobin genes found in entomopathogenic fungi (EPF), to compare the hydrophobin properties and insecticidal properties, and to prepare the selected hydrophobin gene for industrial use by expressing it in Pichia pastoris yeast system. For this purpose, the presence of hydrophobin gene was investigated in 20 entomopathogenic fungus isolates obtained from the fungus collection of Karadeniz Technical University, and the hydrophobin gene (hyd) was detected in 14 of these isolates. It was determined that all isolates carrying the hydrophobin gene belong to the class I hydrophobin group. When the entomopathogenic fungi containing the hydrophobin gene were evaluated, considering the insecticidal activity, morphological features, rapid growth, host spectrum, degree of adhesion on the host surfaces and high mortality, it was decided to express the hydrophobin gene of Beauveria bassiana KTU-57 in the P. pastoris yeast system. In this direction, ribosomal RNA was obtained from the fungal genome and its cDNA was created with the reverse transcriptase enzyme. The hydrobin gene obtained by RT-PCR (Reverse Transcriptase-Reverse Transcriptase) was cloned into the pPICZC vector and expression of the recombinant yeast vector (pPICZC+hyd) in the P. pastoris X-33 gene expression host was achieved. Although a significant amount of protein expression has been achieved, optimization studies are continuing to increase the production capacity for the industrial use of hydrophobin protein.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    539840

    Bazı entomopatojen fungusların patates böceği [Leptinotarsa decemlineata Say. (Coleoptera: Chrysomelidae)] üzerine etkilerinin belirlenmesi

    Determination of the effects of some entomopathogenic fungi on potato beetle [Leptinotarsa decemlineata Say. (Coleoptera: Chrysomelidae)]

    SATİ YAĞMUR KARAMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ İSLAM SARUHAN

  2. Tez No

    213672

    Conidiobolus osmodes drechsler (Arcylistaceae:Entomophthorales) zigosporlarının çimlenmesine pre-inkübasyon ve inkübasyon şartlarının etkisi

    Effects of certain pre-incubation and incubation conditions on the zygospore germination of Conidiobolus osmodes drechsler (Arcylistaceae:Entomophthorales)

    ABDURRAHMAN ADİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET KUBİLAY ER

  3. Tez No

    827658

    Entomopatojen funguslar Beauveria bassiana (Balsamo) Vuillemin (Sordariomycetes: Hypocreales) ve Isaria farinosa (Holmsk.) fries (Sordariomycetes: Hypocreales)' nın domates güvesi Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)' ya karşı endofitik etkileri

    Endophytic effects of the entomopathogenic fungi Beauveria bassiana (Balsamo) Vuillemin (Sordariomycetes: Hypocreales) and Isaria farinosa (Holmsk.) fries (Sordariomycetes: Hypocreales) against the tomato moth Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)

    ZEYNEP DİKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT MUŞTU

  4. Tez No

    482366

    Entomopatojen fungus Paecilomyces lilacinus (Thom) Samson ve Beauveria bassiana (Balsamo)Vuillemin iki noktalı kırmızı örümcek [Tetranychus urticae Koch (Acarina:Tetranychidae)]'e üzerine etkinliklerinin araştırılması

    Efficacy of Entomopatogenic Fungi Paecilomyces lilacinus (Thom) Samson and Beauveria bassiana (Balsamo) Vuillemin against two spotted spider mite Tetranychus urticae Koch (Acarina:Tetranychidae)]

    BİRCAN ÖZBEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    ZiraatGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AYŞE YEŞİLAYER

    PROF. DR. FİKRET DEMİRCİ

  5. Tez No

    360644

    Tuzak böcek yöntemi İle Entomopatojen Fungus izolasyonunun bazı yönleri ile incelenmesi

    A study on certain aspects of Entomopathogenic Fungus isolation by using insect bait method

    SANİYE ÖZCAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Ziraat Bölümü

    DOÇ. DR. MEHMET KUBİLAY ER

Geri Dön