Role of PLA2G2A rs11573156 C>G polymorphism in phospholipase activity and prostate cancer progression
PLA2G2A rs11573156 C>G polimorfizmin fosfolipaz aktivitesi ve prostat kanseri gelişimindeki rolü
- Tez No: 730546
- Danışmanlar: PROF. DR. DİLEK TELCİ TEMELTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 119
Özet
Prostat kanseri (PCa), dünya çapında erkeklerde kansere bağlı ölümlerin en yaygın nedenidir. Günümüzde yaygın olarak kullanılan birçok tedavi yöntemi bulunmasına rağmen PCa kemoterapiye karşı direnç gösteren, yüksek metastatik özelliklere sahip ve tekrarlaması olası bir hastalıktır. Fosfolipaz A2 (PLA2), fosfogliseritlerindeki asil ester bağının hidrolizinden, bu hidroliz sonucunda oluşan yağ asitleri ve lizofosfolipidlerin sentezinden sorumludur. PLA2 enzim grubunun tanımlanmış üyelerinden biri olan sekretuvar fosfolipaz A2 grup II (PLA2G2A), hücre dışı bir enzim olarak işlev gören, salgılanan bir PLA2 formudur. PLA2G2A, güçlü inflamatuar özelliklere sahip prostaglandinlerin ve lökotrienlerin biyosentezinden sorumludur. İnflamatuar yanıtlar, tümör gelişiminin farklı aşamalarında çok önemli rol oynar. PLA2G2A, prostat kanseri de dahil olmak üzere farklı kanser türleri ile ilişkilendirilmiştir. Önceki çalışmalar, prostat kanseri hastalarında yüksek PLA2G2A serum seviyesinin tümör derecesi ile ilişkili olduğunu göstermiştir. PLA2G2A serum seviyesinin yükselmesi kısmen 5'UTR gen bölgesindeki bir SNP'ye (rs11573156 C>G polimorfizmi) bağlı olabilir. Grubumuz tarafından daha önce yapılan bir çalışma, PLA2G2A geninin 5'UTR bölgesinde G aleli taşıyan hastaların, C aleli taşıyan hastalara kıyasla metastaz gelişimine 2,5 kat daha az meyilli olduğunu göstermiştir. Bu tezin amacı, metastatik PC-3 prostat kanseri hücre dizilerinde PLA2G2A'nın 5'UTR (rs11573156 C>G) polimorfizmini, CRISPR/Cas9 teknolojisini kullanarak GC genotipinden homozigot GG genotipine çevirerek modellemektir. Gen düzenlemesinin ardından GG genotipli PC-3 prostat kanseri hücre dizisinin fonksiyonel analizi yapılmıştır ve buna göre bulgularımız literatürde ilk kez homozigot G alelinin PLA2G2A ekspresyonunu yükselttiğini, inflamatuar tümör mikroçevresini taklit eden interferon-γ ve hidrojen perokside yanıt olarak G1 fazından S fazına geçişi ve PC-3 hücrelerinin proliferasyon hızını azalttığını göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Prostate cancer (PCa) is one of the most common health problems and cause of cancer-related mortality among men worldwide. Despite the existence of many treatment options, PCa is a recurrent disease with highly metastatic characteristics, often resistant to chemotherapy. The phospholipase A2 (PLA2) enzyme promotes the hydrolysis of the fatty acid acyl ester bond of phosphoglycerides, leading to the release of free acids and formation of lysophospholipids. Secretory PLA2 group II (sPLA2G2A) is one of the secreted forms in the PLA2 family members, which acts as an extracellular enzyme. PLA2G2A is responsible for the biosynthesis of prostaglandins and leukotrienes, which have potent inflammatory properties. Inflammatory responses have important roles at different stages of tumor development. PLA2G2A was associated with various types of cancer and malignancies, including prostate cancer. Previous studies have shown that elevated serum levels of PLA2G2A in patients with prostate cancer was in association with the tumor grade. This elevation in serum levels of PLA2G2A may in part be due to an SNP on the 5'UTR region (rs11573156 C>G polymorphism) on the gene. A previous study of our group suggested that patients carrying the G allele on the 5'UTR region of the PLA2G2A gene were 2.5 times less susceptible to development of metastatic PCa compared with those carrying the C allele. The aim of this thesis was to model the 5'UTR (rs11573156 C>G) polymorphism of PLA2G2A in metastatic PC-3 prostate cancer cell lines by editing GC genotype to the homozygous GG genotype using the CRISPR/Cas9 technology. Following gene editing, functional analysis of the PC-3 prostate cancer cell line with GG genotype was performed. This study is the first to investigate the effect of PLA2G2A rs11573156 SNP in PLA2G2A expression as well as proliferation and cell cycle regulation in PCa. Our findings demonstrate for the first time in literature that the homozygous G allele elevates the PLA2G2A expression, decreases the proliferation rate of PC-3 cells by attenuating the transition from G1 phase to S phase in response to hydrogen peroxide and interferon-γ that mimics the inflammatory tumor microenvironment.
Benzer Tezler
- Identifying functionally important missense mutations in cancer by dynamics-based analysis and predicting pathogenicity/disease category of missense mutations
Kanserde fonksiyonel öneme sahip yanlış anlam mutasyonların dinamik tabanlı analizle belirlenmesi ve yanlış anlam mutasyonların patojenite/hastalık kategorisinin tahmin edilmesi
JAN FEHMİ SAYILGAN
Doktora
İngilizce
2021
BiyofizikKoç ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET GÖNEN
- Nefs tezkiyesinde namazın rolü
Role of prayer (namaz) one one's own purification of personality
ABDÜLHAMİT TEK
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
DinAnkara ÜniversitesiTemel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ETHEM CEBECİOĞLU
- Pediatrik rinosinüzitlerde allerjik zemin
Role of the allergy in pediatric rhinosinusitis
VACİD MUHAMMED AHMET
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1999
Kulak Burun ve Boğazİstanbul ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENGİZ YAĞIZ
- Role of ISO 9000 standards in total quality management applications a case study: KORDSA
Toplam kalite yönetimi uygulamalarında ISO 9000 standardlarının rolü örnek çalışma: KORDSA
ERSOY ERKAZANCI
Yüksek Lisans
İngilizce
1996
İşletmeİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesiİşletme Yönetimi Ana Bilim Dalı
DR. ERDAL EREL
- Karaciğer iskemi reperfüzyon hasarında peroksinitritin rolü
Role of peroxynitrate in hepatic ischemia reperfusion injury
ALİ EKREM ÜNAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1998
Genel CerrahiAnkara ÜniversitesiCerrahi Onkoloji Bilim Dalı
PROF. DR. HİKMET AKGÜL