Geri Dön

Siirt eğitim ve araştırma hastanesinde klinik örneklerden izole edilen metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarının antibiyotik direnç profilleri ve metisilin direnç genlerinin araştırılması

Investigation of antibiotic resistance profiles and methicillin resistance genes of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples in Siirt training and research hospital

PDF İndir

  1. Tez No: 730632
  2. Yazar: MUSTAFA ERDOĞAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BEHCET İNAL, DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖMER ACER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Microbiology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Gen dizilimi, Metisilin direnci, Staphylococcus aureus, 16S rRNA, mecA geni, mecC geni, Gene sequencing, methicillin resistance, Staphylococcus aureus, 16S rRNA, the mecA gene, mecC gene
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Siirt Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 64

Özet

Giriş & amaç: Metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) suşları, insanlarda ve hayvanlarda çeşitli enfeksiyonlardan sorumlu en yaygın bakterilerden biri olarak kabul edilmektedir. Bu çalışmada Siirt Eğitim ve Araştırma Hastanesi klinik örneklerinden izole edilen metisiline dirençli S. aureus suşlarının moleküler profilini saptamayı amaçladık. Materyal-Metod: Bu çalışmada Temmuz 2020-Temmuz 2021 tarihleri arasında Siirt Eğitim ve Araştırma Hastanesine başvuran hastalardan 20 koagülaz pozitif S. aureus suşunun kültür işlemi yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılık testi ve tanımlama işlemleri için farklı klinik örnekler kullanılmıştır. Bakteri kültürleri yapılmış ve değerlendirilmiştir. MRSA, klinik örneklerden alınan kültürler arasında tanımlanmıştır ve aşağıda nükleotid dizileri verilen evrensel primer çiftleri kullanılarak mecA-F: 5′'-CCTAGTAAAAGCTCCGGAA-3′'-mecA-R5′'-CTAGTC-CATTCGGTCCA-3′' ve mecC-F: 5′' TGTTGTAGCAATGTTCACAC 3′'-mecC-R: 5′' CAAGCACTTAATATCAACGC 3′' mecA ve mecC genleri PZR ile çoğaltılmıştır. İzole edilmiş S. aureus suşları, PZR amplifikasyonu ile evrensel primerler 68f-TNANACATGCAAGTCGRRCG-518r WTTACCGCGGC GTGCTGG kullanılarak 16S rRNA gen analizi ile akrabalık ilişkileri tanımlanmıştır. Bulgular: Bu çalışmada, Siirt Eğitim ve Araştırma Hastanesi'ne başvuran hastalardan 20 koagülaz pozitif S. aureus suşu izole edildi ve tanımlandı. 16S rRNA gen dizileri, izole edilen suşların, NCBI GenBank'ta bulunan S. aureus suşlarının 16S rRNA genlerine yüksek benzerliğe (%99-100) sahip olduğunu gösterdi. 20 suşun 18'inde mecA geni tespit edilirken, suşların hiçbirinde mecC geni tespit edilmedi. MRSA'nın yüksek bir yüzdesinin penisiline dirençli olduğu (%75) bulundu. Sonuç: Bu çalışmanın bulguları, MRSA tespitinde mecA, mecC ve 16S rRNA genlerinin önemini doğrulamış veTürkiye'de artan MRSA sıklığının yanı sıra moleküler tekniklerin epidemiyolojik bir araç olarak değerini vurgulamıştır.

Özet (Çeviri)

Introduction and Aim: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains are considered to be one of the most common bacteria responsible for various infections in humans and animals. In this study, it was aimed to determine the molecular profile of methicillin-resistant S. aureus strains isolated from clinical samples of Siirt Training and Research Hospital. Materials and methods: In this study, 20 coagulase positive S. aureus strains were cultured from patients admitted to Siirt Training and Research Hospital between July 2020 and July 2021. Different clinical samples were used for antibiotic susceptibility testing and identification procedures. Bacterial cultures were made and evaluated. MRSA has been identified across cultures from clinical specimens and using universal primer pairs with the following nucleotide sequences mecA-F: 5′'-CCTAGTAAAAGCTCCGGAA-3''-mecA-R5''-CTAGTC-CATTCGGTCCA-3′' and mecC-F: 5 ′' TGTTGTAGCAATGTTCACAC 3′'-mecC-R: 5′' CAAGCACTTAATATCAACGC 3′' for amplification mecA and mecC genes. Isolated S. aureus strains were identified by 16S rRNA gene analysis using universal primers 68f-TNANACATGCAAGTCGRRCG-518r WTTACCCGGC GTGCTGG by PCR amplification. Results: In this study, 20 coagulase positive S. aureus strains were isolated and identified from patients admitted to Siirt Training and Research Hospital. The 16S rRNA gene sequences showed that the isolated strains had high similarity (99-100%) to the 16S rRNA genes of S. aureus strains available in the NCBI GenBank. While the mecA gene was detected in 18 of 20 strains, the mecC gene was not detected in any of the strains. A high percentage of MRSA was found to be penicillin resistant (75%). Conclusion: The findings of this study confirmed the importance of mecA, mecC, and 16S rRNA genes in MRSA detection and emphasized the value of molecular techniques as an epidemiological tool, as well as the increasing frequency of MRSA in Turkey.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    445058

    Fuzzy knapsack problem for operating room scheduling

    Ameliyathane çizelgeleme için bulanık sırt çantası problemi yaklaşımı

    DİLARA AZAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İşletme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERHAN ÇEBİ

  2. Tez No

    825577

    Siirt ilindeki diyaliz hastalarının beden imajı, sosyal görünüş kaygısı ve yaşam doyumu arasındaki ilişkinin incelenmesi

    The relationship between body image, social appearance anxiety and life satisfaction of dialysis patients in Siirt province

    BİLAL VURAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Psikolojiİstanbul Gelişim Üniversitesi

    Psikoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜJEN İLNEM

  3. Tez No

    794004

    Osteoporozda demografik veriler, riskfaktörleri, klinik bulgular

    Demographic findings, risk factorsand clinical findings in osteoporosis

    ÖZNUR UZUN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonSağlık Bakanlığı

    Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KURTULUŞ KÖKLÜ

  4. Tez No

    805245

    Ailesel akdeniz ateşi (AAA) ve ankilozan spondilit (AS)'nin birlikte görüldüğü hastalar ile aaa ve as'nin tek başına görüldüğü hastaların klinik, laboratuvar, görüntüleme bulguları ve tedavi yanıtlarının karşılaştırılması

    Comparison of clinical, laboratory, imaging findings and treatment response of patients with familial mediterranean fever (FMF) and ankylosing spondylitis(As), and of patients with FMF and as exclusively

    MELİH FİLİZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    RomatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELDA ÇELİK

  5. Tez No

    466383

    Aydın merkez, 2. ve 3. basamak sağlık kuruluşlarında iş sağlığı ve güvenliği uygulamaları geliştirme önerileri

    Recommendations for development of occupational health and safety practice at secondary and tertiary hospitals, aydin

    ALİ ARIKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Halk SağlığıAdnan Menderes Üniversitesi

    Halk Sağlığı Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL BEŞER

Geri Dön