Patlıcan (Solanum melongena L.) bitkisinde regülatör RNA'ların ve transpozon lokusların karakterizasyonu
Characterization of regulatory RNAs and transposon loci in eggplant (Solanum melongena L.)
- Tez No: 732377
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİ TEVFİK UNCU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Patlıcan Solanaceae ailesinin en önemli üyelerinden, besleyicilik özellikleri ve ekonomik değeri yüksek bir bitki türü olmasına rağmen genetik ıslah, moleküler genetik çalışmalar bakımından domates ve patates, biber gibi ailenin diğer önemli türlerine kıyasla daha az çalışılmıştır. Sunulan tez kapsamında patlıcan genomuna ait referans genom verisi transpozon lokusları, kodlamayan RNA ve transmembran protein sınıflandırması bakımından biyoinformatik yaklaşımlar ile karakterize edilmiştir. Çalışma sonucunda elde edilen kodlamayan RNA sekansları, transpozon sekansları ve patlıcanın var olan EST sekansı verileri regülatör markör geliştirme potansiyelleri bakımından araştırılmıştır. Çalışma kapsamımda ilk kez patlıcan genomuna spesifik regülatör/fonksiyonel olma potansiyeline sahip tüm genom düzeyinde mikrosatellit markörler geliştirilmiş, yapısal ve fonksiyonları anotasyonları yapılmıştır. Çalıma sonucu üretilen veri patlıcan gen kaynaklarının karakterizasyonu başta olmak üzere patlıcanda markör destekli ıslah çalışmalarına katkı sağlayacaktır
Özet (Çeviri)
Although eggplant is one of the most important members of the Solanaceae family and is a plant species with high nutritional properties and economic value, genetic breeding has been less studied in terms of molecular genetic studies compared to other important species of the family such as tomato, potato and pepper. Within the scope of the presented thesis, the reference genome of the eggplant genome was featured by bioinformatics approaches in terms of transposon elements, non-coding RNA and transmembrane protein classification. The non-coding RNA sequences, transposon element sequences and the existing EST sequence data of eggplant obtained as a result of the study were investigated in terms of their regulatory marker development potential. Within the scope of my work, for the first time, microsatellite markers at the whole genome level, which have the potential to be regulatory/functional specific to the eggplant genome, were developed and their structural and functional annotations were made. The data produced as a result of the study will contribute to the characterization of eggplant gene sources and marker-assisted breeding studies in eggplant.
Benzer Tezler
- Patlıcan bitkisinin yaprak ve meyvesinde Cd ve Pb dağılımının tayini ve histidin ile ilişkisi
Determination of distribution of Cd and Pb in leaves and fruit of eggplant plant and correlation with histidine
GÜL NİLAY KORAL
- Yarı kurak iklim koşullarında, farklı su seviyelerinde patlıcanın (Solanum Melongena L.) sulama programlarının belirlenmesi ve verim bileşenlerine etkisi
The determination of irrigation programs of eggplant (Solanum Melongena L.) at the different water levels and its effects on the yield components under semi-arid climate conditions
MEHMET AKKUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ZiraatHarran ÜniversitesiTarımsal Yapılar ve Sulama Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ŞİMŞEK
- Patlıcan (Solanum melongena L.)'da melatonin içeriğinin ve üşüme stresine karşı etkisinin belirlenmesi
Determining melatonin content and its effectiveness against chilling stress in eggplant (Solanum melongena L.)
GÖKÇEN YAKUPOĞLU
Doktora
Türkçe
2016
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET KORKMAZ
- Yalova koşullarında bitki gelişme dönemlerine göre sulama uygulamalarının patlıcan (Solanum melongena L.) bitkisinin verim ve kalite özelliklerine etkisinin belirlenmesi
Determination of the effects of deficit irrigation applications based on plant growth stages on yield and quality of eggplant (Solanum melongena L.) in Yalova conditions
GÜLŞAH ÜĞLÜ TEKİN
Doktora
Türkçe
2020
ZiraatBursa Uludağ ÜniversitesiBiyosistem Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN BÜYÜKCANGAZ
- Farklı kısıntılı sulama uygulamalarının sera koşullarında yetiştirilen patlıcanda bitki su tüketimi, verim ve kalite parametrelerine etkileri
Effects of different irrigarion levels on plant water consumption, yield and quality of eggplant grown under glasshouse conditions
ÖMER ÖZBEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Yapılar ve Sulama Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HARUN KAMAN