Investigation on the bioactive secondary metabolites of the endophytic fungus Penicillium roseopurpureum
Endofitik Penicillium roseopurpureum fungusundan elde edilen sekonder metabolitleri ve biyoaktiviteleri
- Tez No: 732455
- Danışmanlar: PROF. DR. ERDAL BEDİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Bioengineering, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
Son yıllarda endofitik funguslar yeni biyoaktif sekonder metabolitlerin üretimi için önemli kaynaklar olarak değerlendirilmiştir ve özellikle ilaç endüstrisi açısından ilaç keşfi ve geliştirilmesine büyük katkı sağlayacağı öngörülmektedir. Ön çalışmamızda, Astragalus angustifolius'tan izole edilen bir endofitik fungus olan Penicillium roseopurpureum 1E4BS1'in kimyasal çeşitliliği ve sitotoksik aktivitesi gösterilmiştir. Bu verilerden hareketle, bu tez kapsamında P. roseopurpureum 1E4BS1'in biyoaktif sekonder metabolitlerinin elde edilmesi amaçlanmıştır. İlk olarak 20 gün boyunca 25 ºC 180 rpm'de çalkalamalı inkübatörde fermentasyon işlemi gerçekleştirilmiş ve elde edilen broth EtOAc ile ekstraksiyon işlemine tabii tutulmuştur. EtOAc ekstresinden kromatografik yöntemlerle dokuz metabolit izole edilmiş ve spektral yöntemlerle (1D-, 2D-NMR ve MS) yapıları belirlenmiştir. Yapı tayini çalışmaları yedi metabolitin antrakinon iki metabolitin ise makrolid grubu curvularin iskeletine sahip olduğunu göstermiştir. Gerçekleştirilen kimyasal yapı taraması elde edilen beş metabolitin doğa için yeni olduğunu ortaya koymuştur. Bileşiklerin ve EtOAc ekstresinin sitotoksik etkileri, üç kanser (DU145, LnCaP ve PC3) ve bir normal (RWPE-1) hücre hattına karşı MTT hücre canlılığı testi ile araştırılmıştır. Metabolit PR-EB-01 LnCaP, PC3, DU145 ve RWPE-1 hücrelerine karşı sırasıyla 26, 37.2, 24.7 ve 30.9 μM IC50 değerleri ile en yüksek aktiviteyi göstermiştir.
Özet (Çeviri)
In recent years, endophytic fungi have been considered as significant resources of new bioactive secondary metabolites, so they are predicted to have an important impact in drug discovery and development. In our preliminary study, the chemical diversity and cytotoxic activity of an endophytic fungus, namely Penicilium roseopurpureum 1E4BS1 isolated from Astragalus angustifolius, have been demonstrated. Based on these data, it was aimed to obtain bioactive secondary metabolites of P. roseopurpureum 1E4BS1 within the scope of this thesis. Firstly, a fermentation study was carried out in a rotary shaker at 180 rpm, 25 ºC for 20 days, and the obtained broth was extracted with EtOAc. Secondly, nine metabolites were isolated from the EtOAc extract by chromatographic methods, and the structures of compounds were elucidated by spectral methods (1D-, 2D NMR, and MS). The structure elucidation studies revealed that seven metabolites had anthraquinone backbone, whereas two compounds were found to be derivatives of curvularin from macrolide group. A chemical structure search confirmed that five of the metabolites were new for nature. Cytotoxic activity of the compounds and the EtOAc extract was tested against three cancer (DU145, LnCaP, and PC3) and normal (RPWE-1) cell lines by MTT cell viability assay. The metabolite PR-EB-01 exhibited the highest activity with IC50 values of 26.0, 37.2, 24.7, and 30.9 μM against LNCaP, PC3, DU145, and RPWE-1 cells, respectively.
Benzer Tezler
- Fındık bitkisinin (Corylus avellana) farklı organlarından endofitik fungusların izolasyonu ve sekonder metabolitlerinin araştırılması
Isolation of endophytic fungi from various part of hazelnut (Corylus avellana) and investigation of their secondary metabolites
ŞEREF AKAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDAL BEDİR
DOÇ. DR. ESİN KOCABAŞ
- Septofusidium berolinense'nin biyoaktif sekonder metabolit içeriğinin araştırılması ve endofitik funguslarla sikloartan grubu saponinlerin biyotransformasyonu
Research on bioactive secondary metabolite profile of Septofusidium berolinense and biotranformation of cycloartane type saponins by endophytic fungi
GÜNER EKİZ
Doktora
Türkçe
2016
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDAL BEDİR
PROF. DR. ELİF ESİN HAMEŞ
- Deniz kaynaklı mantar trichoderma saturnisporum'un farmakognozi açısından değerlendirilmesi
Pharmacognostical investigation of marine-derivedfungus trichoderma saturnisporum
ÖZGE DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELMA KONUKLUGİL
- Investigation of relationship between stress factors and certain metabolites including cardenolides in callus cultures of endemic Turkish digitalis L. species
Türkiye?ye endemik Digitalis L. türlerinin kallus kültürlerinde stress faktörleri ile kardenolitler de dahil belli metabolitler arasındaki ilişkinin araştırılması
GÜNCE ŞAHİN
Doktora
İngilizce
2012
BiyolojiAbant İzzet Baysal ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EKREM GÜREL
- Iğdır yöresinde yetişen iki farklı sinir otuna ait bazı fenoliklerin ve biyolojik aktivitelerin araştırılması
Investigation of some phenolics and biological activities of two different plantagos grown in Iğdır region
MUSA KARADAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaIğdır ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET HAKKI ALMA
DR. MUHİTTİN KULAK