Characterization of a novel IRE1 substrate PACT and interacting miRNAs
IRE1 kinaz substratı PACT'ın ve bağlandığı miRNA'ların karakterizasyonu
- Tez No: 739363
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EBRU ERBAY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 137
Özet
RNA bağlayıcı protein, çift sarmallı RNA'ya bağlı protein kinaz aktivatörü A (PACT), RNA kaynaklı susturma kompleksinin (RISC), çekirdeklenmesi için membranöz bir platform sağlayarak merkezi bir rol oynayan Endoplazmik Retikuluma (ER) tutturur ve mikroRNA (miR) aracılı translasyonel baskıda rol alır. Önceki çalışmalar, ER stresin PACT fosforilasyonuna yol açarken aynı anda birçok miR'in ifadesinde değişikliklere neden olduğunu göstermiştir. Bu tez bulguları, PACT'ın hem ER stress altında hem de bazal koşullarda ER bağlantılı Inositol gerektiren enzim-1 (IRE1), (çift endoribonükleaz (RNaz) ve kinaz) tarafından fosforile edildiğini gösterir. ER stresin aktive ettiği IRE1 RNaz fonksiyonu, katlanmamış protein tepkisini (UPR) tetiklerken, fizyolojik koşullarda bazal IRE1 kinaz aktivitesinin işlevi veya hedefleri bilinmemektedir. Bu tezin bulguları fosforile edilmiş PACT'ın, mitokondriyal biyogenezin (mitobiyogenez) kilit düzenleyicilerinin ekspresyonunu baskılayan olgun miR-181c seviyelerini düzenlediğini göstermektedir. IRE1 ile fosforilasyon, PACT aracılı mitobiyogenez ve mitokondriyel oksijen kullanımının baskılanması için gereklidir. Farelerde kısmi PACT eksikliği, hücre kültüründe olduğu kadar in vivo olarak da kahverengi adipoz doku aktivasyonu sırasında daha güçlü mitobiyogeneze yol açar. Ayrıca, kardiyopulmoner baypas kaynaklı iskemi/perfüzyon hasarı, insan kalp dokusunda PACT protein ekspresyonunu azaltırken aynı zamanda mitokondriyal biyogenezi indükler. Toplu olarak, bu bulgular PACT-miR181c sinyal ekseninin mitokondriyal biyogenez ve enerjinin önemli bir düzenleyicisi olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
The double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A (PACT) anchors the RNA-induced silencing complex (RISC) to the endoplasmic reticulum (ER)'s membranous platform where RISC nucleation occurs and thus, PACT plays a key role in microRNA (miR)-mediated translational repression. Previous studies have shown that ER stress leads to PACT phosphorylation while simultaneously inducing changes in the expression of many miRs. Here, we demonstrate that PACT is phosphorylated by the ER-resident Inositol-requiring enzyme-1 (IRE1), a bifunctional kinase/endoribonuclease (RNase), both under ER stress and no stress conditions. While the role of IRE1 as a stress-induced RNase driving the unfolded protein response (UPR) is well understood, the function or the target(s) of its kinase activity have remained unexplored. Findings of this thesis show that IRE1-mediated phosphorylation of PACT regulates mature miR-181c levels, which suppresses the expression of key regulators of mitochondrial biogenesis (mitobiogenesis). Phosphorylation by IRE1 causes PACT-mediated suppression of mitobiogenesis and respiration. Partial PACT-deficiency in mice leads to enhanced mitobiogenesis during brown fat activation in cells and mice. Furthermore, cardiopulmonary bypass-induced ischemia/reperfusion injury downregulates PACT protein expression in human hearts while simultaneously inducing mitobiogenesis. Collectively, these findings demonstrate PACT-miR-181c signaling axis is a key regulator of mitochondrial biogenesis and energetics.
Benzer Tezler
- Yeni bir Serratia fonticola EBS19 izolatının karakterizasyonu ve botrytis cinerea' ya karşı biyolojik kontrol ajanı olarak kullanılabilme potansiyelinin araştırılması
Characterization of a novel Serratia fonticola EBS19 bacteria and investigation of its potential for biological control agent for botrytis cinerea
EFE BERK BOZKURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMÜR BAYSAL
- Characterization of a novel R7-specific gene in the drosophila visual system
Fotoalmaç-7 hücresine spesifik özgün genin sirke sineği görme sisteminde karakterizasyonu
GÜNER KAÇMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARZU ÇELİK FUSS
- Anoxybacıllus gonensis 05s15'ten izole edilen yeni, küçük ve halkasal bir plazmitin (pAnox1) karakterizasyonu
Characterization of a novel small and circular plasmid (pAnox1)isolated from Anoxybacillus gonensis 05s15
GAMZE ÇUBUKCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HALİL İBRAHİM GÜLER
- Characterization of a novel sporulation gene yvgW, in Bacillus subtilis
Basillus subtilis'te bulunan yeni sporulasyon geni, yvgW'nun karakterizasyonu
AYÇA GÜLÇİN ÜLGEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ
- Characterization of a novel heterozygous NFkB2 variant in a multiplex family with common variable immune deficiency
Yaygın değişken immün yetmezliği olan multipleks bir ailede yeni bir heterozigot NFkB2 varyantının karakterizasyonu
ALPEREN BARAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Allerji ve İmmünolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERKAN BELKAYA