Geri Dön

In vivo investigation of the epigenetic functions of the CENP-A amino terminal

CENP-A amino terminalinin epigenetik fonksiyonlarının ın vivo araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 740081
  2. Yazar: TUĞBA ŞEHİTOĞULLARI
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MUHAMMED KASIM DİRİL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

Sentromerik Protein A (CENP-A) bir histon H3 varyantıdır. Diğer sentromere özgü DNA bağlayıcı faktörlerle birlikte mitoz sırasında kinetokor düzeneğini yönlendirir. Ayrıca, CENP-A, sentromerlerin tanımlanmasını belirleyen epigenetik bir belirteç görevi görür. CENP-A N-terminalinin fosforilasyonu, diğer H3 varyantlarından farklı olduğu için araştırmacıların ilgi odağı olmuştur. İnsan CENP-A serin 7'nin (S7p) fosforilasyonu mitotik girişin bir belirteci olan H3 S10p'ye benzerliği sebebiyle özellikle ilgi çekicidir. Hücre bölünmesi sırasında S7 fosforilasyonunun fonksiyonu ile ilgili tartışmalı bulgular yayınlanmıştır. İnsan CENP-A S7 fosforilasyonu konusunda fikir birliği olmamasının yanı sıra, diğer türlerde karşılık gelen fosforilasyon bölgelerinin işlevi araştırılması gerekeklidir. Yakın tarihli bir yayında, murin CENP-A'nın ilk üç serininin (S15, S16 ve S22) mitoz sırasında insan CENP-A S7p'ye benzer bir rolü olan fosforilasyon bölgeleri olduğu öne sürülmüştür. Bununla birlikte, S15 ve S16 fonksiyonlarını ele alan in vivo bir çalışma bildirilmemiştir. Fare CENP-A N-terminal fosforilasyonunun amacını anlamak için, S15A ve S16A fosforile edilemeyen rezidüleri ifade eden bir knockin fare modeli oluşturmayı amaçladık. Farelerin genetik mühendisliğini yapmak için CRISPR-EZ teknolojisini (Zigotların CRISPR ribonükleoprotein Elektroporasyonu) kullandık. İlk olarak, kendi protokollerimizi optimize etmek için, hedefleme ve genotipleme protokolleri yayınlanan fare Tyr lokusunu düzenledik. Albino Tyr knockout fare modelini başarıyla ürettikten sonra, CENP-A knockout fare modelini oluşturmayı hedefledik. Oluşturulan homozigot knockin fareleri canlı ve doğurgan olması sebebiyle CENP-A N-terminal fosforilasyonunun kromozom ayrımı için önemli bir rolü olmadığı sonucuna vardık. N-terminal fosforilasyonunun epigenetik fonksiyonlarını karakterize etmek için ayrıntılı çalışmaların yapılması gerekmektedir.

Özet (Çeviri)

Centromeric Protein A (CENP-A) is a histone H3 variant. During mitosis, it drives kinetochore formation with other centromere-specific DNA binding proteins. Furthermore, CENP-A serves as an epigenetic marker that determines the identification of centromeres. Phosphorylation of the CENP-A N-terminal has drawn a lot of attention since it differs greatly from other H3 variants. Phosphorylation of human CENP-A serine 7 (S7p) is of particular interest because it resembles H3 S10p, a marker of mitotic entry. There are conflicting findings related to the purpose of S7 phosphorylation during cell division. Besides the lack of consensus on human CENP-A S7 phosphorylation, the function of corresponding phosphorylation sites in other species needs to be investigated. In a recent publication, the first three serines (S15, S16, and S22) of the murine CENP-A were proposed to be phosphorylation sites with an analogous role to human CENP-A S7p during mitosis. However, no in vivo study has been reported addressing S15 and S16 functions. In order to understand the purpose of murine CENP-A N-terminal phosphorylation, we decided to create a knockin mouse model expressing S15A and S16A non-phosphorylatable residue substitutions. We used CRISPR-EZ technology (CRISPR ribonucleoprotein Electroporation of Zygotes) to genetically engineer mice. Firstly, we edited the mouse Tyr locus which has published targeting and genotyping protocols, in order to try and establish our own protocols. After successfully deriving the albino Tyr knock-out mouse model, we moved forward to create the CENP-A knockin mouse model. Homozygous knockin mice were viable and fertile suggesting that CENP-A N-terminal phosphorylation does not have a crucial role for chromosome segregation. Detailed studies will need to be carried out to characterize more subtle epigenetic functions of N-terminal phosphorylation.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    741247

    Fisetin ve mirisetin flavonoidlerinin Caernorhabditis elegans' ta yaşam uzunluğu ve stres direncine etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of fisetin and myricetin flavonoids on lifespan and stress resistance in Caernorhabditis elegans

    SEREN ÇELİKEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET AKİF KILIÇ

  2. Tez No

    789421

    Kolorektal kanserde metastatik süreçleri yönlendiren hücre matriks adezyonu ifade değişimleri

    Alterations in expression of the cell-matrix adhesion molecules which drive metastatic processes in colorectal cancer

    SELİN İŞİDOĞRU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikDokuz Eylül Üniversitesi

    Onkoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATMA DUYGU ÖZEL DEMİRALP

  3. Tez No

    692029

    Valproik asit ve spironolakton kombinasyonunun akciğer kanseri hücre soylarında sitotoksik/apoptotik etkilerinin araştırılması

    Investigation of cytotoxic/apoptotic effects of valproic acid and spironolactone combination on lung cancer cell lines

    MEHMET EMİN KÖSE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Biyolojiİstinye Üniversitesi

    Kanser Biyolojisi ve Farmakolojisi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ NAZLIHAN AZTOPAL

  4. Tez No

    885007

    Investigation of n-terminus mll complexes on the reversion of taxane resistance in castration-resistant prostate cancer

    N-terminal mll komplekslerinin kastrasyona dirençli prostat kanserinde taksan direncini geri döndürmedeki rollerinin araştırılması

    İPEK BULUT

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Moleküler TıpKoç Üniversitesi

    Hücresel ve Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CEYDA AÇILAN AYHAN

  5. Tez No

    854802

    Epigenetics of the mesenchymal to epithelial transition

    Mezenkimal epitelyal dönüşümün epigenetiği

    İNCİ YAPRAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Genom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HANİ ALOTAİBİ

Geri Dön