Levreklerden (Dicentrarchus labrax) izole edilen vibrio türlerinin moleküler tiplendirilmesi ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi
Molecular typing of vibrio species isolated from seabass (Dicentrarchus labrax) and detection of antibiotic resistance
- Tez No: 743094
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞÜKRÜ KIRKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Balıkçılık Teknolojisi, Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Fisheries Technology, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
Amaç: Bu araştırma levreklerden izole edilen Vibrio türlerinin moleküler yöntemlerle identifikasyonunun yapılması ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi amacı ile yapıldı. Gereç ve Yöntem: Araştırma, Mayıs-Eylül 2021 tarihleri arasında, Ege bölgesi balık çiftliklerinden alının 100 levrek örneği ile gerçekleştirilmiştir. Örneklerden elde edilen izolatlar fenotipik ve genotipik olarak identifiye edildikten sonra antibiyotik dirençliliği disk diffüzyon yöntemi ve antibiyotik direnç genlerinin multipleks PCR ile tespitiyle yapılmıştır. Bulgular: Araştırmada 100 levrek örneğinden konvansiyonel ve biyokimyasal yöntemle 46 (%46) Vibrio spp. izolatı elde edilmiştir. Elde edilen 46 izolatın16S rRNA PCR ile Vibrio spp. olduğu doğrulanmıştır. Multipleks PCR ile 22 (47,8) izolatın V. alginolyticus, 13 (%28,2) izolatın V. harveyi, 3 (%6,5) izolatın V. parahaemolyticus, 1 (%2) izolatın V. vulnificus, 7 (%15) izolatın Vibrio spp. olduğu belirlenmiştir. Antibiyogramda en yüksek direncin ampisiline (%84,8) karşı geliştiği belirlenirken tüm izolatların enrofloksasin ve sulfametoksazol-trimetoprime (%100) duyarlı olduğu tespit edilmiştir. İzolatlarda en yüksek direnç geninin trimetoprim direnç geni (%63), en düşük direnç geninin ise florokinolon direnç geni (%6,5) bulunmuştur. Sonuç: Bu çalışmada Vibrio türlerinin balık hastalıklarda primer erken olarak önemli bir rolü olduğu ve identifikasyonda moleküler yöntemlerin daha güvenilir sonuç verdiği, izolatlar arasında tekli ve çoklu antibiyotik direnci bulunduğu tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Objective: This research was carried out to identify Vibrio species isolated from sea bass by molecular methods and to determine their antibiotic resistance. Material and Methods: The research was performed with 100 sea bass samples taken from fish farms in the Aegean region between May-September 2021. After the isolates obtained from the samples were phenotypically and genotypically identified, antibiotic resistance was determined by disc diffusion method and antibiotic resistance genes were determined by multiplex PCR. Results: In this study, 46 (46%) Vibrio spp. isolates were obtained from 100 sea bass samples by conventional and biochemical methods. The obtained 46 isolates were confirmed to be Vibrio spp. by 16S rRNA PCR. From 46 isolates, 22 (47,8%) isolates were identified as V. alginolyticus, 13 (28,2%) isolates as V. harveyi, 3 (6,5%) isolates as V. parahaemolyticus, 1 (2%) isolate as V. vulnificus and 7 (15%) isolates as Vibrio spp. by Multiplex PCR. The highest resistance was found to ampicillin (84,8%) in the isolates in the antibiogram. All isolates were found to be susceptible to enrofloxacin and sulfamethoxazole-trimethoprim (100%). In isolates, the highest resistance gene was found to be trimethoprim resistance gene (63%), and the lowest resistance gene was found to be fluoroquinolone resistance gene (6,5%). Conclution: In this study, it was determined that Vibrio species have an important role as a primary agent in fish diseases, molecular methods give more reliable results in identification, and there is single and multiple antibiotic resistance among isolates.
Benzer Tezler
- Türkiye sularında yakalanan ve yetiştiriciliği yapılan levreklerde (Dicentrarchus labrax linnaeus, 1758) diplectanid türlerin (monogenea, dıplectanıdae) moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of diplectanid species in sea bass (dicentrarchus labrax linnaeus, 1758) reared and captured off turkish waters
COŞKUN AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Su ÜrünleriOndokuz Mayıs ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖKMEN ZAFER PEKMEZCİ
- Doğal suş Rhodococcus pyridinivorans'tan elde edilen EPS'nin karakterizasyonu ve bu EPS film ile kaplanmış doğal ve çiftlik levreklerinin (dicentrarchus labrax) raf ömrü ve kalite özelliklerinin belirlenmesi
Characterization of EPS obtained from natural strain rhodococcus pyridinivorans and determination of the shelf life and quality characteristics of natural and farmed seabass (dicentrarchus labrax) coated with this EPS film
AYLİN TAŞKAYA
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NUR CEYHAN GÜVENSEN
- Levreklerde (Dicentrarchus labrax) stres durumunun belirlenmesinde, azot boşaltım oranlarının indikatör olarak kullanımı
Using ammonia nitrogen excretion rates as an index for determining stress conditions in sea bass (Dicentrarchus labrax)
BETÜL KAYALI
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Su ÜrünleriÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT YİĞİT
- Levreklerde (Dicentrarchus labrax, L. , 1758) besin maddelerinin sindirimi üzerine araştırmalar
Investigations on appearent digestibility of nutrient in sea bass (Dicentrarchus labrax, L. , 1758)
ÖZGÜR ALTAN
Doktora
Türkçe
2002
Su ÜrünleriEge ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. ALİ YILDIRIM KORKUT