Molecular characterization of some potato genotypes using simple sequence repeat (SSR) markers
Basit dizi tekrarları (SSR) markörleri kullanarak bazı patates genotiplerinin moleküler karakterizasyonu
- Tez No: 759354
- Danışmanlar: DOÇ. DR. UFUK DEMİREL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Basit dizi tekrarları (SSR), Genetik çeşitlilik, Moleküler karakterizasyon, Patates, Solanum tuberosum, Simple sequence repeats (SSR), Genetic diversity, Molecular Characterisation, Potato, Solanum tuberosum
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Patatesin önemi, ülkemizde patates ıslah çalışmalarının geliştirilmesine katkı sağlamaktadır. Bu çalışmada, ticari çeşitlerin ve bazı aday çeşitlerin bulunduğu 168 patates genotipinin genetik karakterizasyonları ve genetik çeşitliliklerinin belirlenmesi için 10 SSR markörü kullanılmıştır. Bu markörler, 168 patates genotipi için toplam 48 skorlanabilir bant oluşturmuştur. Elde edilen 48 banttan 47'si polimorfizm göstermiştir. Polimorfik bant sayısı 1 ile 9 arasında değişmekte olup, ortalama polimorfik bant sayısı 4,7 olarak hesaplanmıştır. Ortalama polimorfizm oranı ise %95 olarak hesaplanmıştır. Polimorfizm bilgi içeriği (PIC) değeri 0,08 ile 0,42 arasında değişmekte ve ortalama PIC değeri ise 0,28 olarak hesaplanmıştır. Genotipler arasındaki genetik mesafeyi hesaplamak için POPGENE istatistik programı kullanılmış ve bu uzaklık verileri kullanılarak komşu birleştirme yöntemi ile bir dendrogram oluşturulmuştur. Bu verilere göre birbirine en yakın genotipler Leventbey / Muratbey ve Bergerac / Highland B. Red'dir. Bu çalışma sonuçlarına göre, bu çalışmada yüksek polimorfizm gösteren SSR markör setleri genetik karakterizasyon ve genetik çeşitlilik analizlerinde kullanılabilecek güçlü araçlardır.
Özet (Çeviri)
The importance of potato contributes to the development of potato breeding studies in Turkey. In this study, 10 SSR markers were used for genetic characterization and genetic diversity determination of 168 potato genotypes of commercial cultivars and some breeding lines. These markers generated a total of 48 scoreable bands for 168 potato genotypes. Of the 48 bands obtained, 47 showed polymorphism. The number of polymorphic bands ranged from 1 to 9, and the average number of polymorphic bands was calculated as 4.7. The average polymorphism rate was calculated as 95%. The polymorphism information content (PIC) value ranged between 0.08 and 0.42, and the average PIC value was calculated as 0.28. POPGENE statistical program was used to calculate the genetic distance between genotypes and a dendrogram was created using the neighbor-joining method using this distance data. According to these data, the closest genotypes are Leventbey / Muratbey and Bergerac / Highland B. Red. According to the results of this study, SSR marker sets showing high polymorphism in this study are powerful tools that can be used in genetic characterization and genetic diversity analysis.
Benzer Tezler
- Tomato spotted wilt virus biber izolatlarının popülasyon çeşitliliği ve biber genotiplerinin reassortant izolatlara tepkisi
Population structure of Tomato spotted wilt virus and resistance response of pepper genotypes to reassortant isolates
SELİN CEREN BALSAK
Doktora
Türkçe
2020
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAL BUZKAN
- İç Anadolu bölgesi patates üretim alanlarındaki kök-lezyon nematodları (pratylenchus spp.)'nın morfolojik ve moleküler karakterizasyonu ile bazı nematisitlerin etkinliklerinin araştırılması
Morphological and molecular characterization of root-lesion nematodes (pratylenchus spp.) in potato production areas of the central anatolia region and investigation of the efficacy of some nematicides
UĞUR YİĞİT
- Kimyasal mutagen (etil metansülfonat) uygulamasıyla patateste (Solanum tuberosum L.) varyasyonun oluşturulması ve moleküler markırlarla tanımlanması
Induction of variation using chemical mutagene (ethyl methanesulfonate) treatment and characterization by molecular markers in potato (Solanum tuberosum L.).
NÜKET ALTINDAL
Doktora
Türkçe
2014
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TAHSİN KARADOĞAN
- Domates bitkisinde Pospiviroid cinsi viroid etmenlerinin varlığının araştırılması ve moleküler karakterizasyonu
Investigation and molecular characterization of viroid agents existance at Pospiviroid genus on tomato plant
RUŞEN KIŞLAK
- Erzurum ili patates tarlalarından izole edilen bitki patojeni Streptomyces türlerinin tanısı ve karakterizosyonu
Identification and characterization of plant pathogenic Streptomyces species from potato fields in Erzurum province
KENAN KARAGÖZ