Molecular characterization of some potato genotypes using simple sequence repeat (SSR) markers
Basit dizi tekrarları (SSR) markörleri kullanarak bazı patates genotiplerinin moleküler karakterizasyonu
- Tez No: 759354
- Danışmanlar: DOÇ. DR. UFUK DEMİREL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 163
Özet
Patatesin önemi, ülkemizde patates ıslah çalışmalarının geliştirilmesine katkı sağlamaktadır. Bu çalışmada, ticari çeşitlerin ve bazı aday çeşitlerin bulunduğu 168 patates genotipinin genetik karakterizasyonları ve genetik çeşitliliklerinin belirlenmesi için 10 SSR markörü kullanılmıştır. Bu markörler, 168 patates genotipi için toplam 48 skorlanabilir bant oluşturmuştur. Elde edilen 48 banttan 47'si polimorfizm göstermiştir. Polimorfik bant sayısı 1 ile 9 arasında değişmekte olup, ortalama polimorfik bant sayısı 4,7 olarak hesaplanmıştır. Ortalama polimorfizm oranı ise %95 olarak hesaplanmıştır. Polimorfizm bilgi içeriği (PIC) değeri 0,08 ile 0,42 arasında değişmekte ve ortalama PIC değeri ise 0,28 olarak hesaplanmıştır. Genotipler arasındaki genetik mesafeyi hesaplamak için POPGENE istatistik programı kullanılmış ve bu uzaklık verileri kullanılarak komşu birleştirme yöntemi ile bir dendrogram oluşturulmuştur. Bu verilere göre birbirine en yakın genotipler Leventbey / Muratbey ve Bergerac / Highland B. Red'dir. Bu çalışma sonuçlarına göre, bu çalışmada yüksek polimorfizm gösteren SSR markör setleri genetik karakterizasyon ve genetik çeşitlilik analizlerinde kullanılabilecek güçlü araçlardır.
Özet (Çeviri)
The importance of potato contributes to the development of potato breeding studies in Turkey. In this study, 10 SSR markers were used for genetic characterization and genetic diversity determination of 168 potato genotypes of commercial cultivars and some breeding lines. These markers generated a total of 48 scoreable bands for 168 potato genotypes. Of the 48 bands obtained, 47 showed polymorphism. The number of polymorphic bands ranged from 1 to 9, and the average number of polymorphic bands was calculated as 4.7. The average polymorphism rate was calculated as 95%. The polymorphism information content (PIC) value ranged between 0.08 and 0.42, and the average PIC value was calculated as 0.28. POPGENE statistical program was used to calculate the genetic distance between genotypes and a dendrogram was created using the neighbor-joining method using this distance data. According to these data, the closest genotypes are Leventbey / Muratbey and Bergerac / Highland B. Red. According to the results of this study, SSR marker sets showing high polymorphism in this study are powerful tools that can be used in genetic characterization and genetic diversity analysis.
Benzer Tezler
- Tomato spotted wilt virus biber izolatlarının popülasyon çeşitliliği ve biber genotiplerinin reassortant izolatlara tepkisi
Population structure of Tomato spotted wilt virus and resistance response of pepper genotypes to reassortant isolates
SELİN CEREN BALSAK
Doktora
Türkçe
2020
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAL BUZKAN
- Eskişehir ili domates ve biber ekim alanlarında görülen bazı virüs hastalıklarının belirlenmesi ve moleküler karakterizasyonları
Determination and molecular characterization of some virus diseases on tomato and pepper plants in Eskişehir province
FARUK ÖNCÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatSelçuk ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERKAN YEŞİL
- Diyarbakır ili domates üretim alanlarındaki bazı virüslerin moleküler yöntemler ile araştırılması ve virüs izolatlarının moleküler karakterizasyonu
Investigation of some viruses in tomato production areas of Diyarbakir province by molecular methods and molecular characterization of some virus isolates
FEYZULLAH YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatMalatya Turgut Özal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİKMET MURAT SİPAHİOĞLU
- Ticari patates tohum partilerinde, spongospora subterranea'nın neden olduğu tozlu uyuz hastalığının yaygınlığı, yakalanma oranı ve hastalık şiddetinin belirlenmesi ve etmenin morfolojik ve moleküler teşhisi
Determination of prevalence, incidence and severity of powdery scab disease caused by spongospora subterranea in commercial potato seed lots and it's morphological and molecular identification
ESRA İÇEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ERHAN GÖRE
- Samsun ilinde yetiştirilen bazı kültür bitkilerinden elde edilen rhizoctonia izolatlarının geleneksel ve moleküler yöntemler ile karakterizasyonu
Traditional and molecular characterization of rhizoctonia isolates obtained from some cultivated plants grown in samsun province
VİLDAN AKIN MUTLU